A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =35, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
242.2
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A30-B30
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A30
B30
)
2
241.1
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
A30-B30
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A30
B30
)
3
191.1
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A30-B30
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A30
B30
)
4
189
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A30-B30
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A30
B30
)
5
152
A1-B22
A7-B28
A13-B34
A18-B39
(
A1
B22
A7
B28
A13
B34
A18
B39
)
7
136.3
A9-B9
A14-B14
A30-B30
(
A9
B9
A14
B14
A30
B30
)
8
133.8
A25-B4
A41-B20
A50-B29
(
A25
B4
A41
B20
A50
B29
)
10
119.1
A15-B4
A23-B12
A35-B24
(
A15
B4
A23
B12
A35
B24
)
11
116.7
A29-B22
A38-B31
A47-B40
(
A29
B22
A38
B31
A47
B40
)
12
115.2
A1-B8
A10-B17
A25-B32
(
A1
B8
A10
B17
A25
B32
)
14
111
A3-B7
A8-B12
A14-B18
(
A3
B7
A8
B12
A14
B18
)
15
107.9
A1-B25
A11-B35
A17-B41
(
A1
B25
A11
B35
A17
B41
)
16
107.9
A31-B7
A40-B16
A47-B23
(
A31
B7
A40
B16
A47
B23
)
18
88.1
A19-B22
A35-B38
(
A19
B22
A35
B38
)
19
87.5
A44-B11
A50-B17
(
A44
B11
A50
B17
)
20
83.7
A23-B26
A35-B38
(
A23
B26
A35
B38
)
22
82.6
A9-B6
A37-B34
(
A9
B6
A37
B34
)
23
81.9
A19-B3
A40-B24
(
A19
B3
A40
B24
)
24
80.6
A17-B1
A40-B24
(
A17
B1
A40
B24
)
25
80.5
A17-B18
A23-B24
(
A17
B18
A23
B24
)
26
79.9
A11-B18
A25-B32
(
A11
B18
A25
B32
)
27
79.9
A13-B25
A27-B39
(
A13
B25
A27
B39
)
28
79.9
A38-B13
A54-B29
(
A38
B13
A54
B29
)
29
79
A31-B13
A47-B29
(
A31
B13
A47
B29
)
31
77.8
A40-B31
A49-B40
(
A40
B31
A49
B40
)
32
77.7
A11-B27
A25-B41
(
A11
B27
A25
B41
)
33
77
A9-B13
A14-B18
(
A9
B13
A14
B18
)
34
76.8
A13-B14
A19-B20
(
A13
B14
A19
B20
)
35
75.1
A15-B16
A23-B24
(
A15
B16
A23
B24
)
37
73.3
A21-B26
A36-B41
(
A21
B26
A36
B41
)
38
73.2
A25-B33
A32-B40
(
A25
B33
A32
B40
)
39
72.2
A13-B29
A25-B41
(
A13
B29
A25
B41
)
43
51.5
A23-B6
(
A23
B6
)
44
50
A5-B18
(
A5
B18
)
46
47.1
A52-B33
(
A52
B33
)
47
46.9
A1-B24
(
A1
B24
)
48
46.9
A5-B31
(
A5
B31
)
50
45.5
A42-B26
(
A42
B26
)
51
45.2
A34-B6
(
A34
B6
)
52
43.8
A7-B20
(
A7
B20
)
53
43.8
A17-B35
(
A17
B35
)
54
43.8
A36-B31
(
A36
B31
)
56
42.9
A7-B39
(
A7
B39
)
57
42.4
A3-B29
(
A3
B29
)
58
41.9
A48-B15
(
A48
B15
)
59
41.9
A50-B4
(
A50
B4
)
60
41.7
A5-B42
(
A5
B42
)
61
41.7
A17-B32
(
A17
B32
)
63
41.2
A5-B16
(
A5
B16
)
64
41.2
A23-B42
(
A23
B42
)
65
41.2
A52-B21
(
A52
B21
)
66
41.2
A54-B17
(
A54
B17
)
67
40.6
A15-B30
(
A15
B30
)
68
40.6
A54-B14
(
A54
B14
)
70
40
A54-B4
(
A54
B4
)
71
40
A56-B12
(
A56
B12
)
72
39.5
A46-B23
(
A46
B23
)
73
39.4
A19-B40
(
A19
B40
)
74
39.4
A48-B41
(
A48
B41
)
75
39.4
A54-B42
(
A54
B42
)
76
38.9
A3-B35
(
A3
B35
)
77
38.7
A13-B40
(
A13
B40
)
78
38.7
A25-B24
(
A25
B24
)
79
38.5
A5-B33
(
A5
B33
)
80
38.2
A3-B26
(
A3
B26
)
81
38.2
A36-B42
(
A36
B42
)
83
38.2
A54-B32
(
A54
B32
)
84
37.8
A3-B32
(
A3
B32
)
85
37.8
A11-B15
(
A11
B15
)
86
37.8
A23-B25
(
A23
B25
)
89
37.1
A36-B8
(
A36
B8
)
90
37.1
A50-B41
(
A50
B41
)
91
37.1
A56-B25
(
A56
B25
)
92
36.8
A31-B31
(
A31
B31
)
93
36.8
A54-B35
(
A54
B35
)
94
36.4
A27-B14
(
A27
B14
)
96
36.1
A40-B30
(
A40
B30
)
97
36.1
A54-B23
(
A54
B23
)
98
36.1
A56-B16
(
A56
B16
)
101
35.1
A50-B30
(
A50
B30
)