A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =35, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
1 49.4 A5-B5 A10-B10 A15-B15 A37-B37 ( A5 B5 A10 B10 A15 B15 A37 B37 )
2 48.6 A1-B1 A6-B6 A11-B11 A16-B16 A37-B37 ( A1 B1 A6 B6 A11 B11 A16 B16 A37 B37 )
3 47.6 A3-B3 A8-B8 A13-B13 A18-B18 A37-B37 ( A3 B3 A8 B8 A13 B13 A18 B18 A37 B37 )
4 46.8 A15-B15 A37-B37 ( A15 B15 A37 B37 )
5 46.6 A9-B9 A14-B14 A37-B37 ( A9 B9 A14 B14 A37 B37 )
6 46.2 A5-B18 ( A5 B18 )
7 45.6 A15-B16 ( A15 B16 )
8 44.4 A11-B11 A16-B16 A37-B37 ( A11 B11 A16 B16 A37 B37 )
9 44.4 A40-B24 ( A40 B24 )
10 44.4 A7-B7 A12-B12 A17-B17 A37-B37 ( A7 B7 A12 B12 A17 B17 A37 B37 )
11 43.6 A34-B6 ( A34 B6 )
12 42.9 A3-B26 ( A3 B26 )
13 42.7 A13-B13 A18-B18 A37-B37 ( A13 B13 A18 B18 A37 B37 )
14 41.8 A1-B24 ( A1 B24 )
15 41.8 A3-B29 ( A3 B29 )
16 41.8 A23-B39 ( A23 B39 )
17 41.4 A36-B39 ( A36 B39 )
18 41.2 A48-B15 ( A48 B15 )
19 41.1 A9-B16 ( A9 B16 )
20 41.1 A48-B39 ( A48 B39 )
21 41.1 A19-B22 A33-B36 ( A19 B22 A33 B36 )
22 40.7 A9-B25 A23-B39 ( A9 B25 A23 B39 )
23 40.7 A21-B4 A47-B30 ( A21 B4 A47 B30 )
24 40.4 A13-B14 ( A13 B14 )
25 40.4 A38-B16 ( A38 B16 )
26 40.4 A38-B22 ( A38 B22 )
27 40.3 A17-B18 ( A17 B18 )
28 40.0 A25-B35 ( A25 B35 )
29 40.0 A52-B21 ( A52 B21 )
30 39.7 A48-B31 ( A48 B31 )
31 39.6 A15-B4 ( A15 B4 )
32 39.6 A17-B17 A37-B37 ( A17 B17 A37 B37 )
33 39.3 A7-B20 ( A7 B20 )
34 39.3 A46-B39 ( A46 B39 )
35 39.3 A54-B10 ( A54 B10 )
36 38.9 A1-B2 A7-B8 A12-B13 A17-B18 ( A1 B2 A7 B8 A12 B13 A17 B18 )
37 38.8 A28-B6 A38-B16 ( A28 B6 A38 B16 )
38 38.8 A3-B4 A12-B13 A17-B18 ( A3 B4 A12 B13 A17 B18 )
39 38.8 A7-B8 A12-B13 A17-B18 ( A7 B8 A12 B13 A17 B18 )
40 38.7 A3-B32 ( A3 B32 )
41 38.6 A9-B13 ( A9 B13 )
42 38.6 A11-B15 ( A11 B15 )
43 38.6 A38-B6 ( A38 B6 )
44 38.4 A3-B30 A11-B38 ( A3 B30 A11 B38 )
45 38.3 A5-B17 ( A5 B17 )
46 38.2 A21-B5 A38-B22 ( A21 B5 A38 B22 )
47 38.1 A15-B30 A24-B39 ( A15 B30 A24 B39 )
48 37.9 A54-B4 ( A54 B4 )
49 37.7 A3-B2 A8-B7 A16-B15 A23-B22 ( A3 B2 A8 B7 A16 B15 A23 B22 )
50 37.7 A1-B25 ( A1 B25 )
51 37.7 A5-B6 A12-B13 A17-B18 ( A5 B6 A12 B13 A17 B18 )
52 37.7 A52-B12 ( A52 B12 )
53 37.5 A21-B26 A35-B40 ( A21 B26 A35 B40 )
54 37.5 A11-B38 ( A11 B38 )
55 37.3 A1-B38 ( A1 B38 )
56 37.3 A3-B40 ( A3 B40 )
57 37.3 A19-B38 ( A19 B38 )
58 37.3 A50-B13 A55-B18 ( A50 B13 A55 B18 )
59 37.0 A54-B14 ( A54 B14 )
60 36.9 A5-B4 A16-B15 A23-B22 ( A5 B4 A16 B15 A23 B22 )
61 36.9 A40-B20 ( A40 B20 )
62 36.8 A19-B40 ( A19 B40 )
63 36.8 A50-B4 ( A50 B4 )
64 36.8 A54-B18 ( A54 B18 )
65 36.8 A54-B29 ( A54 B29 )
66 36.7 A15-B29 ( A15 B29 )
67 36.5 A32-B17 A39-B24 ( A32 B17 A39 B24 )
68 36.5 A38-B12 ( A38 B12 )
69 36.4 A23-B5 ( A23 B5 )
70 36.4 A34-B40 ( A34 B40 )
71 36.4 A52-B15 ( A52 B15 )
72 36.2 A15-B35 ( A15 B35 )
73 36.2 A7-B6 A16-B15 A23-B22 ( A7 B6 A16 B15 A23 B22 )
74 35.9 A21-B13 A47-B39 ( A21 B13 A47 B39 )
75 35.7 A46-B4 ( A46 B4 )
76 35.7 A13-B28 A24-B39 ( A13 B28 A24 B39 )
77 35.6 A17-B31 ( A17 B31 )
78 35.3 A23-B22 ( A23 B22 )
79 35.1 A19-B6 ( A19 B6 )
80 35.1 A30-B16 ( A30 B16 )
81 35.1 A34-B10 ( A34 B10 )
82 35.1 A52-B16 ( A52 B16 )
83 35.1 A54-B17 ( A54 B17 )