A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =35, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
15 540 A5-B4 A10-B9 A15-B14 A20-B19 A25-B24 A30-B29 A35-B34 A40-B39 A45-B44 A50-B49 A55-B54 ( A5 B4 A10 B9 A15 B14 A20 B19 A25 B24 A30 B29 A35 B34 A40 B39 A45 B44 A50 B49 A55 B54 )
16 531.2 A1-B2 A6-B7 A11-B12 A16-B17 A21-B22 A26-B27 A31-B32 A36-B37 A41-B42 A46-B47 A51-B52 A56-B57 ( A1 B2 A6 B7 A11 B12 A16 B17 A21 B22 A26 B27 A31 B32 A36 B37 A41 B42 A46 B47 A51 B52 A56 B57 )
18 516.2 A7-B6 A12-B11 A17-B16 A22-B21 A27-B26 A32-B31 A37-B36 A42-B41 A47-B46 A52-B51 A57-B56 ( A7 B6 A12 B11 A17 B16 A22 B21 A27 B26 A32 B31 A37 B36 A42 B41 A47 B46 A52 B51 A57 B56 )
21 501 A5-B6 A10-B11 A15-B16 A20-B21 A25-B26 A30-B31 A35-B36 A40-B41 A45-B46 A50-B51 A55-B56 ( A5 B6 A10 B11 A15 B16 A20 B21 A25 B26 A30 B31 A35 B36 A40 B41 A45 B46 A50 B51 A55 B56 )
22 496 A3-B4 A8-B9 A13-B14 A18-B19 A23-B24 A28-B29 A33-B34 A39-B40 A44-B45 A49-B50 A54-B55 ( A3 B4 A8 B9 A13 B14 A18 B19 A23 B24 A28 B29 A33 B34 A39 B40 A44 B45 A49 B50 A54 B55 )
62 200.7 A19-B3 A27-B11 A37-B21 A52-B36 A57-B41 ( A19 B3 A27 B11 A37 B21 A52 B36 A57 B41 )
64 195.3 A23-B1 A33-B11 A39-B17 A45-B23 A51-B29 ( A23 B1 A33 B11 A39 B17 A45 B23 A51 B29 )
65 194.3 A3-B14 A8-B19 A19-B30 A32-B43 A46-B57 ( A3 B14 A8 B19 A19 B30 A32 B43 A46 B57 )
66 193 A23-B10 A28-B15 A37-B24 A45-B32 A55-B42 ( A23 B10 A28 B15 A37 B24 A45 B32 A55 B42 )
67 188.5 A11-B5 A16-B10 A21-B15 A26-B20 A31-B25 ( A11 B5 A16 B10 A21 B15 A26 B20 A31 B25 )
73 160 A7-B22 A25-B40 A30-B45 A39-B54 ( A7 B22 A25 B40 A30 B45 A39 B54 )
74 159.4 A27-B14 A37-B24 A45-B32 A55-B42 ( A27 B14 A37 B24 A45 B32 A55 B42 )
75 157.8 A25-B12 A37-B24 A45-B32 A55-B42 ( A25 B12 A37 B24 A45 B32 A55 B42 )
78 152.4 A9-B14 A31-B36 A36-B41 A41-B46 ( A9 B14 A31 B36 A36 B41 A41 B46 )
89 124.1 A39-B22 A46-B29 A56-B39 ( A39 B22 A46 B29 A56 B39 )
93 120.8 A3-B20 A19-B36 A39-B56 ( A3 B20 A19 B36 A39 B56 )
100 113.4 A3-B29 A18-B44 A30-B56 ( A3 B29 A18 B44 A30 B56 )
111 87.1 A45-B30 A53-B38 ( A45 B30 A53 B38 )
114 84.4 A37-B7 A43-B13 ( A37 B7 A43 B13 )
120 82.4 A7-B19 A42-B54 ( A7 B19 A42 B54 )
123 81.3 A35-B14 A51-B30 ( A35 B14 A51 B30 )
126 80.6 A3-B19 A36-B52 ( A3 B19 A36 B52 )
129 79.5 A45-B12 A51-B18 ( A45 B12 A51 B18 )
130 79.2 A45-B19 A56-B30 ( A45 B19 A56 B30 )
131 78.9 A5-B21 A36-B52 ( A5 B21 A36 B52 )
134 76.5 A35-B41 A42-B48 ( A35 B41 A42 B48 )
143 72.8 A33-B41 A39-B47 ( A33 B41 A39 B47 )
145 71.9 A29-B9 A50-B30 ( A29 B9 A50 B30 )
153 45.5 A35-B48 ( A35 B48 )
155 44.7 A5-B54 ( A5 B54 )
162 43.2 A39-B30 ( A39 B30 )
164 42.4 A45-B15 ( A45 B15 )
165 42.4 A57-B31 ( A57 B31 )
169 40.5 A37-B18 ( A37 B18 )
172 40 A57-B53 ( A57 B53 )
176 38.5 A1-B29 ( A1 B29 )
179 38.2 A7-B49 ( A7 B49 )
182 38.2 A35-B30 ( A35 B30 )
186 37.1 A21-B54 ( A21 B54 )
195 36.4 A41-B11 ( A41 B11 )
196 36.4 A41-B33 ( A41 B33 )
203 35.1 A25-B52 ( A25 B52 )