A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =30, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
49.4
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A37-B37
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A37
B37
)
2
48.6
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A37-B37
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A37
B37
)
3
48.2
A35-B7
(
A35
B7
)
4
47.6
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
A37-B37
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A37
B37
)
5
46.8
A15-B15
A37-B37
(
A15
B15
A37
B37
)
6
45.6
A15-B16
(
A15
B16
)
7
45.3
A39-B23
(
A39
B23
)
8
44.4
A11-B11
A16-B16
A37-B37
(
A11
B11
A16
B16
A37
B37
)
9
44.4
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A37-B37
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A37
B37
)
10
43.3
A9-B9
A14-B14
A19-B19
A37-B37
(
A9
B9
A14
B14
A19
B19
A37
B37
)
11
42.9
A3-B26
(
A3
B26
)
12
42.9
A49-B40
(
A49
B40
)
13
42.7
A13-B13
A18-B18
A37-B37
(
A13
B13
A18
B18
A37
B37
)
14
41.8
A1-B24
(
A1
B24
)
15
41.8
A3-B29
(
A3
B29
)
16
41.8
A23-B39
(
A23
B39
)
17
41.7
A55-B12
(
A55
B12
)
18
41.4
A55-B30
(
A55
B30
)
19
41.1
A19-B22
A33-B36
(
A19
B22
A33
B36
)
20
40.7
A35-B38
(
A35
B38
)
21
40.4
A13-B14
(
A13
B14
)
22
40.4
A53-B28
(
A53
B28
)
23
40.3
A17-B18
(
A17
B18
)
24
40.0
A25-B35
(
A25
B35
)
25
40.0
A35-B32
(
A35
B32
)
26
40.0
A51-B11
(
A51
B11
)
27
39.6
A15-B4
(
A15
B4
)
28
39.6
A17-B17
A37-B37
(
A17
B17
A37
B37
)
29
39.5
A5-B18
A18-B31
(
A5
B18
A18
B31
)
30
39.3
A33-B36
(
A33
B36
)
31
39.3
A47-B30
(
A47
B30
)
32
39.3
A53-B4
(
A53
B4
)
33
39.0
A35-B6
(
A35
B6
)
34
38.9
A5-B6
A10-B11
A15-B16
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
)
35
38.9
A37-B37
(
A37
B37
)
36
38.8
A7-B8
A12-B13
A17-B18
(
A7
B8
A12
B13
A17
B18
)
37
38.7
A3-B32
(
A3
B32
)
38
38.5
A11-B12
A16-B17
(
A11
B12
A16
B17
)
39
38.5
A9-B12
A19-B22
A33-B36
(
A9
B12
A19
B22
A33
B36
)
40
38.4
A9-B10
A14-B15
(
A9
B10
A14
B15
)
41
38.3
A5-B17
(
A5
B17
)
42
38.2
A53-B13
(
A53
B13
)
43
38.2
A55-B18
(
A55
B18
)
44
38.1
A15-B30
A24-B39
(
A15
B30
A24
B39
)
45
37.9
A21-B4
A38-B21
A47-B30
(
A21
B4
A38
B21
A47
B30
)
46
37.8
A13-B29
A23-B39
(
A13
B29
A23
B39
)
47
37.7
A41-B20
(
A41
B20
)
48
37.7
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
)
49
37.7
A3-B4
A8-B9
A13-B14
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
)
50
37.5
A21-B26
A35-B40
(
A21
B26
A35
B40
)
51
37.5
A11-B38
(
A11
B38
)
52
37.5
A47-B7
A52-B12
(
A47
B7
A52
B12
)
53
37.3
A1-B38
(
A1
B38
)
54
37.3
A3-B40
(
A3
B40
)
55
37.3
A19-B38
(
A19
B38
)
56
37.2
A9-B25
A16-B32
A23-B39
(
A9
B25
A16
B32
A23
B39
)
57
37.2
A31-B9
A38-B16
(
A31
B9
A38
B16
)
58
36.9
A23-B26
A33-B36
(
A23
B26
A33
B36
)
59
36.8
A19-B40
(
A19
B40
)
60
36.8
A35-B40
(
A35
B40
)
61
36.8
A49-B13
A54-B18
(
A49
B13
A54
B18
)
62
36.7
A39-B24
(
A39
B24
)
63
36.7
A49-B12
A54-B17
(
A49
B12
A54
B17
)
64
36.2
A15-B35
(
A15
B35
)
65
36.1
A19-B19
A37-B37
(
A19
B19
A37
B37
)
66
36.0
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A23-B22
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A23
B22
)
67
36.0
A7-B20
A18-B31
(
A7
B20
A18
B31
)
68
36.0
A9-B16
A22-B29
(
A9
B16
A22
B29
)
69
35.9
A21-B13
A47-B39
(
A21
B13
A47
B39
)
70
35.9
A3-B2
A8-B7
A13-B12
A18-B17
A23-B22
(
A3
B2
A8
B7
A13
B12
A18
B17
A23
B22
)
71
35.8
A3-B30
A10-B37
(
A3
B30
A10
B37
)
72
35.8
A39-B14
A53-B28
(
A39
B14
A53
B28
)
73
35.8
A41-B24
A47-B30
(
A41
B24
A47
B30
)
74
35.6
A47-B39
(
A47
B39
)
75
35.6
A53-B3
(
A53
B3
)
76
35.5
A11-B27
A16-B32
A23-B39
(
A11
B27
A16
B32
A23
B39
)
77
35.3
A23-B22
(
A23
B22
)
78
35.2
A1-B25
A7-B31
(
A1
B25
A7
B31
)
79
35.1
A15-B14
A23-B22
(
A15
B14
A23
B22
)
80
35.0
A11-B10
A16-B15
A23-B22
(
A11
B10
A16
B15
A23
B22
)
81
35.0
A5-B37
(
A5
B37
)
82
34.9
A43-B22
(
A43
B22
)
83
34.8
A23-B5
A50-B32
(
A23
B5
A50
B32
)
84
34.8
A9-B13
A19-B23
A35-B39
(
A9
B13
A19
B23
A35
B39
)
85
34.8
A11-B15
A19-B23
A35-B39
(
A11
B15
A19
B23
A35
B39
)
86
34.8
A19-B24
A35-B40
(
A19
B24
A35
B40
)
87
34.8
A35-B39
(
A35
B39
)
88
34.7
A13-B28
A18-B33
A24-B39
(
A13
B28
A18
B33
A24
B39
)
89
34.5
A23-B28
A35-B40
(
A23
B28
A35
B40
)
90
34.5
A53-B17
(
A53
B17
)
91
34.4
A21-B40
(
A21
B40
)
92
34.3
A17-B16
A23-B22
(
A17
B16
A23
B22
)
93
34.3
A47-B10
A52-B15
(
A47
B10
A52
B15
)
94
34.2
A7-B6
A13-B12
A18-B17
A23-B22
(
A7
B6
A13
B12
A18
B17
A23
B22
)
95
34.1
A15-B29
A21-B35
(
A15
B29
A21
B35
)
96
34.1
A5-B1
A22-B18
A28-B24
(
A5
B1
A22
B18
A28
B24
)
97
34.1
A29-B22
A38-B31
A46-B39
(
A29
B22
A38
B31
A46
B39
)
98
34.0
A5-B19
A15-B29
A21-B35
(
A5
B19
A15
B29
A21
B35
)
99
34.0
A37-B5
A53-B21
(
A37
B5
A53
B21
)
100
33.9
A31-B17
(
A31
B17
)
101
33.9
A39-B9
A52-B22
(
A39
B9
A52
B22
)
102
33.9
A17-B31
A22-B36
(
A17
B31
A22
B36
)
103
33.8
A15-B8
A29-B22
A38-B31
A46-B39
(
A15
B8
A29
B22
A38
B31
A46
B39
)
104
33.6
A23-B29
A34-B40
(
A23
B29
A34
B40
)
105
33.6
A19-B6
A25-B12
A52-B39
(
A19
B6
A25
B12
A52
B39
)
106
33.5
A21-B5
A37-B21
(
A21
B5
A37
B21
)
107
33.4
A13-B12
A18-B17
A23-B22
(
A13
B12
A18
B17
A23
B22
)
108
33.3
A19-B13
A28-B22
(
A19
B13
A28
B22
)
109
33.3
A33-B18
A38-B23
(
A33
B18
A38
B23
)
110
33.3
A9-B4
(
A9
B4
)
111
33.3
A17-B35
(
A17
B35
)
112
33.3
A17-B36
(
A17
B36
)
113
33.3
A45-B18
(
A45
B18
)
114
33.1
A17-B32
A24-B39
(
A17
B32
A24
B39
)
115
33.0
A23-B10
A52-B39
(
A23
B10
A52
B39
)
116
32.9
A9-B8
A14-B13
A23-B22
(
A9
B8
A14
B13
A23
B22
)
117
32.9
A19-B23
A35-B39
(
A19
B23
A35
B39
)
118
32.8
A7-B31
(
A7
B31
)
119
32.8
A11-B39
(
A11
B39
)
120
32.8
A13-B1
A18-B6
A35-B23
A52-B40
(
A13
B1
A18
B6
A35
B23
A52
B40
)
121
32.8
A25-B12
A52-B39
(
A25
B12
A52
B39
)
122
32.8
A33-B6
A45-B18
(
A33
B6
A45
B18
)
123
32.8
A49-B18
A54-B23
(
A49
B18
A54
B23
)
124
32.8
A49-B39
(
A49
B39
)
125
32.8
A51-B7
(
A51
B7
)
126
32.8
A53-B29
(
A53
B29
)
127
32.8
A3-B16
A18-B31
(
A3
B16
A18
B31
)
128
32.5
A31-B16
A36-B21
(
A31
B16
A36
B21
)
129
32.4
A15-B3
A35-B23
A52-B40
(
A15
B3
A35
B23
A52
B40
)
130
32.4
A1-B5
A8-B12
A19-B23
A35-B39
(
A1
B5
A8
B12
A19
B23
A35
B39
)
131
32.3
A39-B13
A44-B18
A54-B28
(
A39
B13
A44
B18
A54
B28
)
132
32.3
A39-B36
(
A39
B36
)
133
32.3
A51-B32
(
A51
B32
)
134
32.3
A53-B21
(
A53
B21
)
135
32.3
A55-B19
(
A55
B19
)
136
32.2
A35-B23
A52-B40
(
A35
B23
A52
B40
)
137
32.2
A45-B6
(
A45
B6
)
138
32.2
A53-B10
(
A53
B10
)
139
32.2
A43-B6
A48-B11
A53-B16
(
A43
B6
A48
B11
A53
B16
)
140
32.1
A9-B17
A25-B33
A31-B39
(
A9
B17
A25
B33
A31
B39
)
141
31.9
A5-B16
(
A5
B16
)
142
31.7
A3-B33
(
A3
B33
)
143
31.7
A9-B33
(
A9
B33
)
144
31.7
A11-B28
(
A11
B28
)
145
31.7
A31-B39
(
A31
B39
)
146
31.6
A29-B37
(
A29
B37
)
147
31.6
A51-B15
(
A51
B15
)
148
31.5
A21-B35
(
A21
B35
)
149
31.2
A25-B33
A31-B39
(
A25
B33
A31
B39
)
150
31.2
A5-B35
(
A5
B35
)
151
31.2
A51-B20
(
A51
B20
)
152
31.1
A13-B33
(
A13
B33
)
153
31.1
A53-B16
(
A53
B16
)
154
31.0
A37-B21
(
A37
B21
)
155
30.9
A23-B32
(
A23
B32
)
156
30.9
A45-B19
A54-B28
(
A45
B19
A54
B28
)
157
30.8
A5-B30
(
A5
B30
)
158
30.8
A5-B31
(
A5
B31
)
159
30.8
A55-B10
(
A55
B10
)
160
30.8
A27-B17
A46-B36
(
A27
B17
A46
B36
)
161
30.6
A1-B23
(
A1
B23
)
162
30.6
A53-B9
(
A53
B9
)
163
30.6
A55-B29
(
A55
B29
)
164
30.5
A51-B5
(
A51
B5
)
165
30.3
A3-B36
(
A3
B36
)
166
30.3
A55-B25
(
A55
B25
)
167
30.2
A51-B31
(
A51
B31
)
168
30.2
A53-B35
(
A53
B35
)