A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =25, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
32
52.1
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
34
51.3
A57-B56
(
A57
B56
)
37
49.6
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
39
49.2
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
40
49.2
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
43
48.6
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
47
47.9
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
48
47.5
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
49
47.5
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
52
46.8
A7-B6
A12-B11
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
57
46.2
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
60
45.5
A5-B6
A10-B11
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
61
45.2
A35-B14
(
A35
B14
)
64
44.9
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
66
44.8
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
67
44.8
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
68
44.7
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
69
44.4
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
73
43.9
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
75
43.4
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
76
43.4
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
77
43.1
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
81
42.6
A45-B30
A53-B38
(
A45
B30
A53
B38
)
82
42.4
A45-B15
(
A45
B15
)
83
42.4
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
86
41.5
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
87
40.6
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
90
40.1
A43-B10
A50-B17
(
A43
B10
A50
B17
)
95
37.8
A27-B14
A42-B29
(
A27
B14
A42
B29
)
96
37.5
A43-B13
(
A43
B13
)
97
37.5
A57-B53
(
A57
B53
)
98
37.3
A37-B4
A42-B9
A50-B17
(
A37
B4
A42
B9
A50
B17
)
102
36.4
A41-B11
(
A41
B11
)
103
35.9
A19-B6
A26-B13
A42-B29
(
A19
B6
A26
B13
A42
B29
)
110
34.4
A57-B31
(
A57
B31
)
114
34.0
A21-B15
A41-B35
(
A21
B15
A41
B35
)
115
33.8
A45-B12
A50-B17
(
A45
B12
A50
B17
)
116
33.7
A7-B38
A21-B52
(
A7
B38
A21
B52
)
117
33.3
A43-B47
A53-B57
(
A43
B47
A53
B57
)
120
32.7
A9-B14
A19-B24
A30-B35
A36-B41
A41-B46
A48-B53
(
A9
B14
A19
B24
A30
B35
A36
B41
A41
B46
A48
B53
)
123
32.4
A23-B37
A31-B45
A39-B53
(
A23
B37
A31
B45
A39
B53
)
125
32.4
A35-B30
(
A35
B30
)
130
32.0
A31-B35
A43-B47
A53-B57
(
A31
B35
A43
B47
A53
B57
)
131
32.0
A31-B45
A39-B53
(
A31
B45
A39
B53
)
132
31.9
A45-B49
A53-B57
(
A45
B49
A53
B57
)
133
31.7
A3-B14
A8-B19
A13-B24
A23-B34
A31-B42
A37-B48
A45-B56
(
A3
B14
A8
B19
A13
B24
A23
B34
A31
B42
A37
B48
A45
B56
)
134
31.7
A11-B5
A21-B15
A41-B35
(
A11
B5
A21
B15
A41
B35
)
137
31.4
A45-B48
(
A45
B48
)
141
31.3
A15-B12
A31-B28
A48-B45
A57-B54
(
A15
B12
A31
B28
A48
B45
A57
B54
)
142
31.2
A7-B54
(
A7
B54
)
143
31.2
A13-B17
A30-B34
A43-B47
A53-B57
(
A13
B17
A30
B34
A43
B47
A53
B57
)
144
31.2
A45-B56
(
A45
B56
)
147
31.2
A57-B18
(
A57
B18
)
148
31.1
A23-B34
A31-B42
A37-B48
A45-B56
(
A23
B34
A31
B42
A37
B48
A45
B56
)
151
30.8
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
152
30.8
A13-B24
A23-B34
A31-B42
A37-B48
A45-B56
(
A13
B24
A23
B34
A31
B42
A37
B48
A45
B56
)
153
30.8
A45-B31
(
A45
B31
)
155
30.7
A33-B11
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A33
B11
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
156
30.7
A39-B9
A44-B14
(
A39
B9
A44
B14
)
159
30.6
A39-B49
A47-B57
(
A39
B49
A47
B57
)
161
30.6
A45-B11
A54-B20
(
A45
B11
A54
B20
)
164
30.4
A31-B42
A37-B48
A45-B56
(
A31
B42
A37
B48
A45
B56
)
165
30.3
A21-B52
(
A21
B52
)
167
30.1
A41-B33
A47-B39
(
A41
B33
A47
B39
)
168
30.0
A25-B51
A30-B56
(
A25
B51
A30
B56
)
169
29.9
A7-B19
A29-B41
A39-B51
(
A7
B19
A29
B41
A39
B51
)
171
29.7
A9-B52
(
A9
B52
)
172
29.7
A39-B18
(
A39
B18
)
174
29.5
A37-B48
A45-B56
(
A37
B48
A45
B56
)
175
29.5
A3-B25
A10-B32
A30-B52
(
A3
B25
A10
B32
A30
B52
)
177
29.4
A33-B41
A39-B47
(
A33
B41
A39
B47
)
184
29.1
A25-B3
A32-B10
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A25
B3
A32
B10
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
185
29.0
A23-B18
A34-B29
(
A23
B18
A34
B29
)
187
28.9
A37-B23
A45-B31
(
A37
B23
A45
B31
)
188
28.9
A39-B53
(
A39
B53
)
190
28.9
A57-B54
(
A57
B54
)
192
28.8
A35-B46
A45-B56
(
A35
B46
A45
B56
)
196
28.6
A39-B31
A45-B37
(
A39
B31
A45
B37
)
198
28.5
A13-B16
A45-B48
(
A13
B16
A45
B48
)
199
28.5
A15-B18
A45-B48
(
A15
B18
A45
B48
)
201
28.4
A1-B48
A7-B54
(
A1
B48
A7
B54
)
202
28.4
A31-B28
A48-B45
A57-B54
(
A31
B28
A48
B45
A57
B54
)
209
27.8
A31-B17
A36-B22
A45-B31
(
A31
B17
A36
B22
A45
B31
)
214
27.5
A13-B10
A18-B15
A31-B28
A48-B45
A57-B54
(
A13
B10
A18
B15
A31
B28
A48
B45
A57
B54
)
217
27.3
A39-B16
A45-B22
A54-B31
(
A39
B16
A45
B22
A54
B31
)
223
26.6
A29-B41
A39-B51
(
A29
B41
A39
B51
)
224
26.5
A39-B47
(
A39
B47
)
227
26.3
A5-B56
(
A5
B56
)
229
26.3
A5-B17
A29-B41
A39-B51
(
A5
B17
A29
B41
A39
B51
)
231
25.7
A21-B55
(
A21
B55
)
232
25.7
A27-B18
(
A27
B18
)
235
25.7
A39-B51
(
A39
B51
)