A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =30, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
11
688.7
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
13
674.2
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
14
657.6
A1-B2
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A16-B17
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A26-B27
A31-B32
A36-B37
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A46-B47
A51-B52
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
)
20
601
A9-B10
A14-B15
A19-B20
A24-B25
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A34-B35
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A9
B10
A14
B15
A19
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A24
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A34
B35
A39
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A44
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A49
B50
A54
B55
)
35
455.1
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A35-B33
A40-B38
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A50-B48
A55-B53
(
A5
B3
A10
B8
A15
B13
A20
B18
A25
B23
A30
B28
A35
B33
A40
B38
A45
B43
A50
B48
A55
B53
)
38
432.4
A3-B5
A8-B10
A13-B15
A18-B20
A23-B25
A28-B30
A33-B35
A38-B40
A43-B45
A48-B50
A53-B55
(
A3
B5
A8
B10
A13
B15
A18
B20
A23
B25
A28
B30
A33
B35
A38
B40
A43
B45
A48
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A53
B55
)
43
428
A1-B3
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A21-B23
A26-B28
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A47-B49
A52-B54
(
A1
B3
A6
B8
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B13
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B18
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B23
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B28
A31
B33
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A42
B44
A47
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A52
B54
)
49
390.9
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A17-B19
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A27-B29
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A42-B44
A47-B49
A52-B54
(
A7
B9
A12
B14
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A32
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B39
A42
B44
A47
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A52
B54
)
50
390.1
A5-B7
A10-B12
A15-B17
A20-B22
A25-B27
A30-B32
A37-B39
A42-B44
A47-B49
A52-B54
(
A5
B7
A10
B12
A15
B17
A20
B22
A25
B27
A30
B32
A37
B39
A42
B44
A47
B49
A52
B54
)
54
358.1
A11-B9
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A21-B19
A26-B24
A31-B29
A36-B34
A41-B39
A46-B44
A51-B49
(
A11
B9
A16
B14
A21
B19
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B24
A31
B29
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B34
A41
B39
A46
B44
A51
B49
)
61
343.1
A9-B11
A14-B16
A19-B21
A24-B26
A29-B31
A34-B36
A39-B41
A44-B46
A49-B51
(
A9
B11
A14
B16
A19
B21
A24
B26
A29
B31
A34
B36
A39
B41
A44
B46
A49
B51
)
93
201
A15-B1
A20-B6
A25-B11
A31-B17
A43-B29
A52-B38
(
A15
B1
A20
B6
A25
B11
A31
B17
A43
B29
A52
B38
)
100
188.3
A23-B10
A28-B15
A37-B24
A42-B29
A48-B35
(
A23
B10
A28
B15
A37
B24
A42
B29
A48
B35
)
105
181.1
A25-B12
A31-B18
A37-B24
A42-B29
A48-B35
(
A25
B12
A31
B18
A37
B24
A42
B29
A48
B35
)
108
171.9
A9-B20
A20-B31
A31-B42
A38-B49
A44-B55
(
A9
B20
A20
B31
A31
B42
A38
B49
A44
B55
)
110
157.3
A13-B26
A22-B35
A32-B45
A42-B55
(
A13
B26
A22
B35
A32
B45
A42
B55
)
111
156.6
A9-B3
A14-B8
A19-B13
A24-B18
A52-B46
(
A9
B3
A14
B8
A19
B13
A24
B18
A52
B46
)
115
149.2
A1-B34
A8-B41
A14-B47
A19-B52
(
A1
B34
A8
B41
A14
B47
A19
B52
)
116
146.8
A15-B28
A22-B35
A32-B45
A42-B55
(
A15
B28
A22
B35
A32
B45
A42
B55
)
118
146.1
A3-B19
A16-B32
A30-B46
A35-B51
(
A3
B19
A16
B32
A30
B46
A35
B51
)
119
144.3
A35-B9
A44-B18
A49-B23
A55-B29
(
A35
B9
A44
B18
A49
B23
A55
B29
)
120
143.3
A21-B5
A35-B19
A50-B34
A55-B39
(
A21
B5
A35
B19
A50
B34
A55
B39
)
121
142.8
A17-B6
A36-B25
A43-B32
A50-B39
(
A17
B6
A36
B25
A43
B32
A50
B39
)
122
141.4
A11-B24
A22-B35
A32-B45
A42-B55
(
A11
B24
A22
B35
A32
B45
A42
B55
)
123
141
A27-B14
A37-B24
A42-B29
A48-B35
(
A27
B14
A37
B24
A42
B29
A48
B35
)
124
139.5
A25-B4
A30-B9
A39-B18
A49-B28
(
A25
B4
A30
B9
A39
B18
A49
B28
)
127
137.3
A1-B35
A7-B41
A14-B48
A20-B54
(
A1
B35
A7
B41
A14
B48
A20
B54
)
129
137
A29-B16
A37-B24
A42-B29
A48-B35
(
A29
B16
A37
B24
A42
B29
A48
B35
)
130
134.6
A3-B25
A8-B30
A25-B47
A30-B52
(
A3
B25
A8
B30
A25
B47
A30
B52
)
134
131.6
A35-B1
A43-B9
A50-B16
A55-B21
(
A35
B1
A43
B9
A50
B16
A55
B21
)
135
131.3
A17-B2
A35-B20
A43-B28
A53-B38
(
A17
B2
A35
B20
A43
B28
A53
B38
)
136
130.8
A23-B6
A36-B19
A44-B27
A52-B35
(
A23
B6
A36
B19
A44
B27
A52
B35
)
138
129.5
A25-B3
A30-B8
A36-B14
A49-B27
(
A25
B3
A30
B8
A36
B14
A49
B27
)
141
128.1
A1-B15
A12-B26
A21-B35
A27-B41
(
A1
B15
A12
B26
A21
B35
A27
B41
)
142
128
A21-B4
A36-B19
A44-B27
A52-B35
(
A21
B4
A36
B19
A44
B27
A52
B35
)
143
126.9
A37-B3
A43-B9
A50-B16
A55-B21
(
A37
B3
A43
B9
A50
B16
A55
B21
)
144
124.3
A37-B4
A42-B9
A48-B15
A55-B22
(
A37
B4
A42
B9
A48
B15
A55
B22
)
154
109.4
A27-B13
A43-B29
A52-B38
(
A27
B13
A43
B29
A52
B38
)
155
109
A31-B1
A37-B7
A42-B12
(
A31
B1
A37
B7
A42
B12
)
156
108.9
A17-B27
A36-B46
A45-B55
(
A17
B27
A36
B46
A45
B55
)
157
108.6
A43-B10
A48-B15
A55-B22
(
A43
B10
A48
B15
A55
B22
)
159
108.2
A25-B38
A32-B45
A42-B55
(
A25
B38
A32
B45
A42
B55
)
160
108.1
A21-B3
A37-B19
A48-B30
(
A21
B3
A37
B19
A48
B30
)
162
106.9
A7-B37
A13-B43
A20-B50
(
A7
B37
A13
B43
A20
B50
)
163
106
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A12-B24
A41-B53
(
A7
B19
A12
B24
A41
B53
)
164
105.9
A33-B11
A39-B17
A49-B27
(
A33
B11
A39
B17
A49
B27
)
166
104.3
A23-B5
A37-B19
A48-B30
(
A23
B5
A37
B19
A48
B30
)
170
102.9
A31-B10
A39-B18
A49-B28
(
A31
B10
A39
B18
A49
B28
)
172
102.5
A37-B20
A44-B27
A52-B35
(
A37
B20
A44
B27
A52
B35
)
173
102.3
A5-B17
A12-B24
A41-B53
(
A5
B17
A12
B24
A41
B53
)
174
102.1
A31-B9
A36-B14
A49-B27
(
A31
B9
A36
B14
A49
B27
)
177
101
A33-B12
A39-B18
A49-B28
(
A33
B12
A39
B18
A49
B28
)
181
97.1
A15-B23
A20-B28
A35-B43
(
A15
B23
A20
B28
A35
B43
)
184
94.7
A17-B5
A23-B11
A54-B42
(
A17
B5
A23
B11
A54
B42
)
187
94
A9-B31
A25-B47
A30-B52
(
A9
B31
A25
B47
A30
B52
)
190
91.7
A1-B16
A18-B33
A35-B50
(
A1
B16
A18
B33
A35
B50
)
200
73.9
A17-B43
A26-B52
(
A17
B43
A26
B52
)
204
72.8
A39-B28
A50-B39
(
A39
B28
A50
B39
)
206
71.7
A1-B18
A34-B51
(
A1
B18
A34
B51
)
207
71.1
A33-B3
A39-B9
(
A33
B3
A39
B9
)
210
70.8
A39-B50
A44-B55
(
A39
B50
A44
B55
)
212
70.7
A1-B28
A23-B50
(
A1
B28
A23
B50
)
214
70.1
A11-B41
A20-B50
(
A11
B41
A20
B50
)
216
69
A9-B39
A20-B50
(
A9
B39
A20
B50
)
217
69
A13-B25
A41-B53
(
A13
B25
A41
B53
)
222
67.6
A25-B16
A37-B28
(
A25
B16
A37
B28
)
229
65.6
A5-B36
A20-B51
(
A5
B36
A20
B51
)
230
65.6
A35-B46
A41-B52
(
A35
B46
A41
B52
)
231
65
A5-B40
A20-B55
(
A5
B40
A20
B55
)
232
65
A25-B13
A54-B42
(
A25
B13
A54
B42
)
238
64
A21-B9
A54-B42
(
A21
B9
A54
B42
)
244
62.5
A19-B34
A35-B50
(
A19
B34
A35
B50
)
246
61.3
A21-B15
A52-B46
(
A21
B15
A52
B46
)
258
40
A35-B30
(
A35
B30
)
265
38.6
A21-B55
(
A21
B55
)
266
38.6
A43-B13
(
A43
B13
)
270
38.1
A37-B29
(
A37
B29
)
274
37.3
A41-B11
(
A41
B11
)
278
37.1
A39-B30
(
A39
B30
)
286
35.9
A37-B45
(
A37
B45
)
291
34.4
A25-B52
(
A25
B52
)
301
33.3
A39-B47
(
A39
B47
)
319
32.2
A43-B55
(
A43
B55
)
320
31.7
A3-B49
(
A3
B49
)
328
31.2
A35-B52
(
A35
B52
)
333
30.8
A39-B31
(
A39
B31
)
334
30.6
A37-B27
(
A37
B27
)
337
30.3
A7-B50
(
A7
B50
)
341
30.2
A35-B10
(
A35
B10
)