A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =35, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
1076.4
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A21-B21
A26-B26
A31-B31
A36-B36
A41-B41
A46-B46
A51-B51
A56-B56
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A21
B21
A26
B26
A31
B31
A36
B36
A41
B41
A46
B46
A51
B51
A56
B56
)
2
999.1
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A20-B20
A25-B25
A30-B30
A35-B35
A40-B40
A45-B45
A50-B50
A55-B55
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A20
B20
A25
B25
A30
B30
A35
B35
A40
B40
A45
B45
A50
B50
A55
B55
)
3
960.2
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
A23-B23
A28-B28
A33-B33
A38-B38
A43-B43
A48-B48
A53-B53
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A23
B23
A28
B28
A33
B33
A38
B38
A43
B43
A48
B48
A53
B53
)
4
960.1
A7-B7
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A17-B17
A22-B22
A27-B27
A32-B32
A37-B37
A42-B42
A47-B47
A52-B52
A57-B57
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A22
B22
A27
B27
A32
B32
A37
B37
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B42
A47
B47
A52
B52
A57
B57
)
5
899.3
A9-B9
A14-B14
A19-B19
A24-B24
A29-B29
A34-B34
A39-B39
A44-B44
A49-B49
A54-B54
(
A9
B9
A14
B14
A19
B19
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B24
A29
B29
A34
B34
A39
B39
A44
B44
A49
B49
A54
B54
)
15
540
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
16
531.2
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
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A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
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B22
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B27
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B32
A36
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B42
A46
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B52
A56
B57
)
17
528.6
A3-B2
A8-B7
A13-B12
A18-B17
A23-B22
A28-B27
A33-B32
A39-B38
A44-B43
A49-B48
A54-B53
(
A3
B2
A8
B7
A13
B12
A18
B17
A23
B22
A28
B27
A33
B32
A39
B38
A44
B43
A49
B48
A54
B53
)
18
516.2
A7-B6
A12-B11
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
21
501
A5-B6
A10-B11
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
22
496
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
23
490
A11-B10
A16-B15
A21-B20
A26-B25
A31-B30
A36-B35
A41-B40
A46-B45
A51-B50
A56-B55
(
A11
B10
A16
B15
A21
B20
A26
B25
A31
B30
A36
B35
A41
B40
A46
B45
A51
B50
A56
B55
)
24
483.5
A9-B8
A14-B13
A19-B18
A24-B23
A29-B28
A34-B33
A39-B38
A44-B43
A49-B48
A54-B53
(
A9
B8
A14
B13
A19
B18
A24
B23
A29
B28
A34
B33
A39
B38
A44
B43
A49
B48
A54
B53
)
25
451
A9-B10
A14-B15
A19-B20
A24-B25
A29-B30
A34-B35
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A9
B10
A14
B15
A19
B20
A24
B25
A29
B30
A34
B35
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
26
449.3
A7-B8
A12-B13
A17-B18
A22-B23
A27-B28
A32-B33
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A7
B8
A12
B13
A17
B18
A22
B23
A27
B28
A32
B33
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
62
200.7
A19-B3
A27-B11
A37-B21
A52-B36
A57-B41
(
A19
B3
A27
B11
A37
B21
A52
B36
A57
B41
)
64
195.3
A23-B1
A33-B11
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A23
B1
A33
B11
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
65
194.3
A3-B14
A8-B19
A19-B30
A32-B43
A46-B57
(
A3
B14
A8
B19
A19
B30
A32
B43
A46
B57
)
66
193
A23-B10
A28-B15
A37-B24
A45-B32
A55-B42
(
A23
B10
A28
B15
A37
B24
A45
B32
A55
B42
)
67
188.5
A11-B5
A16-B10
A21-B15
A26-B20
A31-B25
(
A11
B5
A16
B10
A21
B15
A26
B20
A31
B25
)
73
160
A7-B22
A25-B40
A30-B45
A39-B54
(
A7
B22
A25
B40
A30
B45
A39
B54
)
74
159.4
A27-B14
A37-B24
A45-B32
A55-B42
(
A27
B14
A37
B24
A45
B32
A55
B42
)
75
157.8
A25-B12
A37-B24
A45-B32
A55-B42
(
A25
B12
A37
B24
A45
B32
A55
B42
)
77
155.8
A11-B22
A19-B30
A32-B43
A46-B57
(
A11
B22
A19
B30
A32
B43
A46
B57
)
78
152.4
A9-B14
A31-B36
A36-B41
A41-B46
(
A9
B14
A31
B36
A36
B41
A41
B46
)
81
141.1
A43-B42
A48-B47
A53-B52
(
A43
B42
A48
B47
A53
B52
)
82
138.9
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
84
128.7
A5-B23
A15-B33
A30-B48
(
A5
B23
A15
B33
A30
B48
)
85
128.6
A3-B36
A10-B43
A19-B52
(
A3
B36
A10
B43
A19
B52
)
86
128.4
A37-B4
A43-B10
A51-B18
(
A37
B4
A43
B10
A51
B18
)
89
124.1
A39-B22
A46-B29
A56-B39
(
A39
B22
A46
B29
A56
B39
)
90
122.7
A13-B26
A24-B37
A32-B45
(
A13
B26
A24
B37
A32
B45
)
91
122.5
A1-B41
A6-B46
A16-B56
(
A1
B41
A6
B46
A16
B56
)
92
122.1
A39-B28
A50-B39
A56-B45
(
A39
B28
A50
B39
A56
B45
)
93
120.8
A3-B20
A19-B36
A39-B56
(
A3
B20
A19
B36
A39
B56
)
95
120
A7-B25
A15-B33
A30-B48
(
A7
B25
A15
B33
A30
B48
)
96
119.9
A1-B4
A6-B9
A12-B15
(
A1
B4
A6
B9
A12
B15
)
97
119.8
A15-B28
A24-B37
A32-B45
(
A15
B28
A24
B37
A32
B45
)
98
119.2
A35-B24
A50-B39
A56-B45
(
A35
B24
A50
B39
A56
B45
)
100
113.4
A3-B29
A18-B44
A30-B56
(
A3
B29
A18
B44
A30
B56
)
103
111.7
A41-B6
A52-B17
A57-B22
(
A41
B6
A52
B17
A57
B22
)
108
90.3
A39-B46
A48-B55
(
A39
B46
A48
B55
)
111
87.1
A45-B30
A53-B38
(
A45
B30
A53
B38
)
114
84.4
A37-B7
A43-B13
(
A37
B7
A43
B13
)
116
83.8
A9-B2
A16-B9
(
A9
B2
A16
B9
)
117
83.7
A5-B42
A15-B52
(
A5
B42
A15
B52
)
119
82.7
A7-B4
A15-B12
(
A7
B4
A15
B12
)
120
82.4
A7-B19
A42-B54
(
A7
B19
A42
B54
)
121
82.3
A31-B35
A37-B41
(
A31
B35
A37
B41
)
122
81.9
A47-B43
A54-B50
(
A47
B43
A54
B50
)
123
81.3
A35-B14
A51-B30
(
A35
B14
A51
B30
)
125
81.1
A7-B37
A15-B45
(
A7
B37
A15
B45
)
126
80.6
A3-B19
A36-B52
(
A3
B19
A36
B52
)
127
80.5
A47-B48
A52-B53
(
A47
B48
A52
B53
)
128
80.4
A37-B3
A56-B22
(
A37
B3
A56
B22
)
129
79.5
A45-B12
A51-B18
(
A45
B12
A51
B18
)
130
79.2
A45-B19
A56-B30
(
A45
B19
A56
B30
)
131
78.9
A5-B21
A36-B52
(
A5
B21
A36
B52
)
132
77.8
A5-B8
A12-B15
(
A5
B8
A12
B15
)
133
76.6
A25-B7
A32-B14
(
A25
B7
A32
B14
)
134
76.5
A35-B41
A42-B48
(
A35
B41
A42
B48
)
135
76
A19-B7
A50-B38
(
A19
B7
A50
B38
)
136
76
A23-B9
A30-B16
(
A23
B9
A30
B16
)
137
75.9
A1-B23
A32-B54
(
A1
B23
A32
B54
)
138
75.7
A37-B44
A48-B55
(
A37
B44
A48
B55
)
139
75.3
A23-B5
A32-B14
(
A23
B5
A32
B14
)
140
74.6
A5-B37
A19-B51
(
A5
B37
A19
B51
)
141
74.6
A45-B41
A54-B50
(
A45
B41
A54
B50
)
143
72.8
A33-B41
A39-B47
(
A33
B41
A39
B47
)
145
71.9
A29-B9
A50-B30
(
A29
B9
A50
B30
)
149
46.9
A17-B54
(
A17
B54
)
153
45.5
A35-B48
(
A35
B48
)
154
45.5
A41-B3
(
A41
B3
)
155
44.7
A5-B54
(
A5
B54
)
161
43.8
A53-B9
(
A53
B9
)
162
43.2
A39-B30
(
A39
B30
)
163
42.4
A33-B15
(
A33
B15
)
164
42.4
A45-B15
(
A45
B15
)
165
42.4
A57-B31
(
A57
B31
)
166
41.9
A53-B16
(
A53
B16
)
168
41.7
A11-B32
(
A11
B32
)
169
40.5
A37-B18
(
A37
B18
)
170
40.5
A51-B28
(
A51
B28
)
171
40
A57-B46
(
A57
B46
)
172
40
A57-B53
(
A57
B53
)
173
39.4
A37-B27
(
A37
B27
)
174
39.4
A43-B1
(
A43
B1
)
176
38.5
A1-B29
(
A1
B29
)
178
38.5
A51-B19
(
A51
B19
)
179
38.2
A7-B49
(
A7
B49
)
181
38.2
A27-B50
(
A27
B50
)
182
38.2
A35-B30
(
A35
B30
)
183
38.2
A47-B4
(
A47
B4
)
185
37.1
A11-B55
(
A11
B55
)
186
37.1
A21-B54
(
A21
B54
)
187
37.1
A29-B49
(
A29
B49
)
188
37.1
A31-B57
(
A31
B57
)
189
37.1
A33-B46
(
A33
B46
)
195
36.4
A41-B11
(
A41
B11
)
196
36.4
A41-B33
(
A41
B33
)
200
35.3
A5-B40
(
A5
B40
)
201
35.3
A45-B21
(
A45
B21
)
202
35.3
A53-B2
(
A53
B2
)
203
35.1
A25-B52
(
A25
B52
)
204
35.1
A31-B45
(
A31
B45
)
205
35.1
A53-B31
(
A53
B31
)