A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =35, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
1 51.5 A23-B6 ( A23 B6 )
2 50.0 A5-B18 ( A5 B18 )
3 50.0 A50-B17 ( A50 B17 )
4 48.4 A1-B1 A6-B6 A11-B11 A16-B16 A30-B30 ( A1 B1 A6 B6 A11 B11 A16 B16 A30 B30 )
5 48.2 A3-B3 A8-B8 A13-B13 A18-B18 A30-B30 ( A3 B3 A8 B8 A13 B13 A18 B18 A30 B30 )
6 47.8 A5-B5 A10-B10 A15-B15 A30-B30 ( A5 B5 A10 B10 A15 B15 A30 B30 )
7 47.5 A17-B17 A30-B30 ( A17 B17 A30 B30 )
8 47.2 A7-B7 A12-B12 A17-B17 A30-B30 ( A7 B7 A12 B12 A17 B17 A30 B30 )
9 47.1 A52-B33 ( A52 B33 )
10 46.9 A1-B24 ( A1 B24 )
11 46.9 A5-B31 ( A5 B31 )
12 46.4 A11-B11 A16-B16 A30-B30 ( A11 B11 A16 B16 A30 B30 )
13 45.5 A40-B24 ( A40 B24 )
14 45.5 A42-B26 ( A42 B26 )
15 45.4 A9-B9 A14-B14 A30-B30 ( A9 B9 A14 B14 A30 B30 )
16 45.2 A34-B6 ( A34 B6 )
17 44.6 A25-B4 A41-B20 A50-B29 ( A25 B4 A41 B20 A50 B29 )
18 44.0 A19-B22 A35-B38 ( A19 B22 A35 B38 )
19 43.8 A13-B13 A18-B18 A30-B30 ( A13 B13 A18 B18 A30 B30 )
20 43.8 A7-B20 ( A7 B20 )
21 43.8 A17-B35 ( A17 B35 )
22 43.8 A36-B31 ( A36 B31 )
23 43.8 A54-B29 ( A54 B29 )
24 43.8 A44-B11 A50-B17 ( A44 B11 A50 B17 )
25 42.9 A7-B39 ( A7 B39 )
26 42.4 A3-B29 ( A3 B29 )
27 41.9 A48-B15 ( A48 B15 )
28 41.9 A50-B4 ( A50 B4 )
29 41.8 A23-B26 A35-B38 ( A23 B26 A35 B38 )
30 41.7 A5-B42 ( A5 B42 )
31 41.7 A17-B32 ( A17 B32 )
32 41.7 A19-B20 ( A19 B20 )
33 41.5 A15-B15 A30-B30 ( A15 B15 A30 B30 )
34 41.3 A9-B6 A37-B34 ( A9 B6 A37 B34 )
35 41.2 A5-B16 ( A5 B16 )
36 41.2 A23-B42 ( A23 B42 )
37 41.2 A52-B21 ( A52 B21 )
38 41.2 A54-B17 ( A54 B17 )
39 41.0 A19-B3 A40-B24 ( A19 B3 A40 B24 )
40 40.6 A15-B30 ( A15 B30 )
41 40.6 A54-B14 ( A54 B14 )
42 40.3 A17-B1 A40-B24 ( A17 B1 A40 B24 )
43 40.2 A17-B18 A23-B24 ( A17 B18 A23 B24 )
44 40.0 A23-B24 ( A23 B24 )
45 40.0 A54-B4 ( A54 B4 )
46 40.0 A56-B12 ( A56 B12 )
47 40.0 A11-B18 A25-B32 ( A11 B18 A25 B32 )
48 40.0 A13-B25 A27-B39 ( A13 B25 A27 B39 )
49 40.0 A38-B13 A54-B29 ( A38 B13 A54 B29 )
50 39.7 A15-B4 A23-B12 A35-B24 ( A15 B4 A23 B12 A35 B24 )
51 39.5 A31-B13 A47-B29 ( A31 B13 A47 B29 )
52 39.5 A46-B23 ( A46 B23 )
53 39.4 A19-B40 ( A19 B40 )
54 39.4 A48-B41 ( A48 B41 )
55 39.4 A54-B42 ( A54 B42 )
56 38.9 A29-B22 A38-B31 A47-B40 ( A29 B22 A38 B31 A47 B40 )
57 38.9 A3-B35 ( A3 B35 )
58 38.9 A13-B34 A18-B39 ( A13 B34 A18 B39 )
59 38.9 A40-B31 A49-B40 ( A40 B31 A49 B40 )
60 38.9 A11-B27 A25-B41 ( A11 B27 A25 B41 )
61 38.7 A13-B40 ( A13 B40 )
62 38.7 A25-B24 ( A25 B24 )
63 38.5 A5-B33 ( A5 B33 )
64 38.5 A9-B13 A14-B18 ( A9 B13 A14 B18 )
65 38.4 A13-B14 A19-B20 ( A13 B14 A19 B20 )
66 38.4 A1-B8 A10-B17 A25-B32 ( A1 B8 A10 B17 A25 B32 )
67 38.2 A3-B26 ( A3 B26 )
68 38.2 A36-B42 ( A36 B42 )
69 38.2 A50-B29 ( A50 B29 )
70 38.2 A54-B32 ( A54 B32 )
71 38.1 A7-B28 A13-B34 A18-B39 ( A7 B28 A13 B34 A18 B39 )
72 38.0 A1-B22 A7-B28 A13-B34 A18-B39 ( A1 B22 A7 B28 A13 B34 A18 B39 )
73 37.8 A3-B32 ( A3 B32 )
74 37.8 A11-B15 ( A11 B15 )
75 37.8 A23-B25 ( A23 B25 )
76 37.5 A15-B16 A23-B24 ( A15 B16 A23 B24 )
77 37.5 A27-B39 ( A27 B39 )
78 37.1 A25-B41 ( A25 B41 )
79 37.1 A36-B8 ( A36 B8 )
80 37.1 A50-B41 ( A50 B41 )
81 37.1 A56-B25 ( A56 B25 )
82 37.0 A3-B7 A8-B12 A14-B18 ( A3 B7 A8 B12 A14 B18 )
83 36.8 A23-B12 A35-B24 ( A23 B12 A35 B24 )
84 36.8 A31-B31 ( A31 B31 )
85 36.8 A54-B35 ( A54 B35 )
86 36.7 A21-B26 A36-B41 ( A21 B26 A36 B41 )
87 36.6 A25-B33 A32-B40 ( A25 B33 A32 B40 )
88 36.4 A27-B14 ( A27 B14 )
89 36.1 A13-B29 A25-B41 ( A13 B29 A25 B41 )
90 36.1 A25-B32 ( A25 B32 )
91 36.1 A40-B30 ( A40 B30 )
92 36.1 A54-B23 ( A54 B23 )
93 36.1 A56-B16 ( A56 B16 )
94 36.0 A11-B35 A17-B41 ( A11 B35 A17 B41 )
95 36.0 A1-B25 A11-B35 A17-B41 ( A1 B25 A11 B35 A17 B41 )
96 36.0 A31-B7 A40-B16 A47-B23 ( A31 B7 A40 B16 A47 B23 )
97 35.9 A17-B41 ( A17 B41 )
98 35.8 A38-B31 A47-B40 ( A38 B31 A47 B40 )
99 35.8 A40-B16 A47-B23 ( A40 B16 A47 B23 )
100 35.1 A36-B41 ( A36 B41 )
101 35.1 A50-B30 ( A50 B30 )