A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =30, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
39
63.1
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
40
63.0
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
43
62.5
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
52
61.7
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
55
61.3
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
63
59.8
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A31-B32
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A46-B47
A51-B52
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
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64
59.8
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A19-B20
A24-B25
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A34-B35
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(
A9
B10
A14
B15
A19
B20
A24
B25
A29
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A34
B35
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
65
59.4
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
(
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
)
72
58.9
A19-B20
A24-B25
A29-B30
A34-B35
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A19
B20
A24
B25
A29
B30
A34
B35
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
74
58.6
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
76
58.0
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A26-B27
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A36-B37
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A46-B47
A51-B52
(
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
)
78
57.4
A29-B30
A34-B35
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A29
B30
A34
B35
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
86
43.1
A25-B12
(
A25
B12
)
87
41.9
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A30-B28
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(
A25
B23
A30
B28
A35
B33
A40
B38
A45
B43
A50
B48
A55
B53
)
88
41.7
A35-B33
A40-B38
A45-B43
A50-B48
A55-B53
(
A35
B33
A40
B38
A45
B43
A50
B48
A55
B53
)
89
41.7
A15-B13
A20-B18
A25-B23
A30-B28
A35-B33
A40-B38
A45-B43
A50-B48
A55-B53
(
A15
B13
A20
B18
A25
B23
A30
B28
A35
B33
A40
B38
A45
B43
A50
B48
A55
B53
)
90
41.4
A5-B3
A10-B8
A15-B13
A20-B18
A25-B23
A30-B28
A35-B33
A40-B38
A45-B43
A50-B48
A55-B53
(
A5
B3
A10
B8
A15
B13
A20
B18
A25
B23
A30
B28
A35
B33
A40
B38
A45
B43
A50
B48
A55
B53
)
101
40.4
A43-B10
(
A43
B10
)
103
39.7
A11-B9
A16-B14
A21-B19
A26-B24
A31-B29
A36-B34
A41-B39
A46-B44
A51-B49
(
A11
B9
A16
B14
A21
B19
A26
B24
A31
B29
A36
B34
A41
B39
A46
B44
A51
B49
)
108
39.4
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A48-B50
A53-B55
(
A43
B45
A48
B50
A53
B55
)
110
39.4
A21-B19
A26-B24
A31-B29
A36-B34
A41-B39
A46-B44
A51-B49
(
A21
B19
A26
B24
A31
B29
A36
B34
A41
B39
A46
B44
A51
B49
)
111
39.3
A3-B5
A8-B10
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A18-B20
A23-B25
A28-B30
A33-B35
A38-B40
A43-B45
A48-B50
A53-B55
(
A3
B5
A8
B10
A13
B15
A18
B20
A23
B25
A28
B30
A33
B35
A38
B40
A43
B45
A48
B50
A53
B55
)
113
39.2
A13-B15
A18-B20
A23-B25
A28-B30
A33-B35
A38-B40
A43-B45
A48-B50
A53-B55
(
A13
B15
A18
B20
A23
B25
A28
B30
A33
B35
A38
B40
A43
B45
A48
B50
A53
B55
)
114
39.1
A31-B29
A36-B34
A41-B39
A46-B44
A51-B49
(
A31
B29
A36
B34
A41
B39
A46
B44
A51
B49
)
116
39.1
A15-B17
A20-B22
A25-B27
A30-B32
A37-B39
A42-B44
A47-B49
A52-B54
(
A15
B17
A20
B22
A25
B27
A30
B32
A37
B39
A42
B44
A47
B49
A52
B54
)
117
39.0
A5-B7
A10-B12
A15-B17
A20-B22
A25-B27
A30-B32
A37-B39
A42-B44
A47-B49
A52-B54
(
A5
B7
A10
B12
A15
B17
A20
B22
A25
B27
A30
B32
A37
B39
A42
B44
A47
B49
A52
B54
)
118
39.0
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A16-B18
A21-B23
A26-B28
A31-B33
A37-B39
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A47-B49
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(
A11
B13
A16
B18
A21
B23
A26
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A31
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B39
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)
119
39.0
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A22-B24
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A32-B34
A37-B39
A42-B44
A47-B49
A52-B54
(
A7
B9
A12
B14
A17
B19
A22
B24
A27
B29
A32
B34
A37
B39
A42
B44
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A52
B54
)
120
38.9
A1-B3
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A11-B13
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A26-B28
A31-B33
A37-B39
A42-B44
A47-B49
A52-B54
(
A1
B3
A6
B8
A11
B13
A16
B18
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B23
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)
122
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A33-B35
A38-B40
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A48-B50
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(
A23
B25
A28
B30
A33
B35
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B40
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B45
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B50
A53
B55
)
123
38.6
A25-B27
A30-B32
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A47-B49
A52-B54
(
A25
B27
A30
B32
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)
126
38.3
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A47-B49
A52-B54
(
A21
B23
A26
B28
A31
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A37
B39
A42
B44
A47
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)
127
38.0
A33-B35
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A53-B55
(
A33
B35
A38
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A43
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A48
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)
131
37.8
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(
A9
B11
A14
B16
A19
B21
A24
B26
A29
B31
A34
B36
A39
B41
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)
135
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A19-B21
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A29-B31
A34-B36
A39-B41
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A49-B51
(
A19
B21
A24
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A29
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A39
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A49
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)
139
36.1
A39-B41
A44-B46
A49-B51
(
A39
B41
A44
B46
A49
B51
)
141
35.8
A29-B31
A34-B36
A39-B41
A44-B46
A49-B51
(
A29
B31
A34
B36
A39
B41
A44
B46
A49
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)
144
34.9
A39-B9
A45-B15
(
A39
B9
A45
B15
)
146
34.0
A21-B52
(
A21
B52
)
148
33.3
A39-B17
(
A39
B17
)
150
32.7
A23-B18
(
A23
B18
)
152
32.1
A37-B19
(
A37
B19
)
154
31.3
A43-B9
A54-B20
(
A43
B9
A54
B20
)
155
31.1
A25-B11
(
A25
B11
)