A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =25, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
54.7
A15-B15
(
A15
B15
)
2
50.9
A5-B5
A10-B10
A15-B15
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
)
3
50.5
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
)
4
50.5
A9-B9
A14-B14
(
A9
B9
A14
B14
)
5
47.2
A11-B11
A16-B16
(
A11
B11
A16
B16
)
6
46.5
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
)
7
45.6
A15-B16
(
A15
B16
)
8
45.3
A7-B7
A12-B12
A17-B17
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
)
9
43.1
A39-B18
(
A39
B18
)
10
41.5
A17-B17
(
A17
B17
)
11
40.7
A5-B36
(
A5
B36
)
12
40.5
A13-B13
A18-B18
(
A13
B13
A18
B18
)
13
40.4
A55-B30
(
A55
B30
)
14
40.0
A35-B32
(
A35
B32
)
15
39.5
A11-B12
A16-B17
(
A11
B12
A16
B17
)
16
39.3
A53-B4
(
A53
B4
)
17
38.5
A9-B10
A14-B15
(
A9
B10
A14
B15
)
18
38.2
A53-B3
(
A53
B3
)
19
38.1
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
)
20
37.5
A5-B37
(
A5
B37
)
21
37.2
A5-B6
A10-B11
A15-B16
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
)
22
37.0
A5-B18
A16-B29
(
A5
B18
A16
B29
)
23
36.5
A53-B28
(
A53
B28
)
24
35.7
A5-B4
A10-B9
A15-B14
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
)
25
35.6
A31-B9
A38-B16
(
A31
B9
A38
B16
)
26
35.1
A17-B18
(
A17
B18
)
27
34.9
A11-B10
A16-B15
(
A11
B10
A16
B15
)
28
34.9
A15-B14
(
A15
B14
)
29
34.8
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
)
30
34.6
A19-B24
(
A19
B24
)
31
34.5
A5-B17
(
A5
B17
)
32
34.5
A31-B16
(
A31
B16
)
33
34.2
A15-B29
A22-B36
(
A15
B29
A22
B36
)
34
34.0
A3-B40
(
A3
B40
)
35
34.0
A7-B8
A12-B13
A17-B18
(
A7
B8
A12
B13
A17
B18
)
36
33.9
A31-B17
(
A31
B17
)
37
33.4
A13-B14
A18-B19
(
A13
B14
A18
B19
)
38
33.3
A17-B16
(
A17
B16
)
39
33.0
A15-B4
A45-B34
(
A15
B4
A45
B34
)
40
32.8
A1-B25
(
A1
B25
)
41
32.8
A15-B30
A21-B36
(
A15
B30
A21
B36
)
42
32.8
A25-B12
(
A25
B12
)
43
32.8
A53-B29
(
A53
B29
)
44
32.7
A3-B29
(
A3
B29
)
45
32.7
A3-B33
(
A3
B33
)
46
32.7
A9-B16
(
A9
B16
)
47
32.7
A49-B12
(
A49
B12
)
48
32.7
A51-B11
(
A51
B11
)
49
32.4
A3-B2
A8-B7
A13-B12
A18-B17
(
A3
B2
A8
B7
A13
B12
A18
B17
)
50
32.2
A39-B19
(
A39
B19
)
51
31.8
A7-B6
A12-B11
A17-B16
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
)
52
31.8
A9-B8
A14-B13
(
A9
B8
A14
B13
)
53
31.7
A11-B28
(
A11
B28
)
54
31.5
A53-B16
(
A53
B16
)
55
31.3
A15-B17
A20-B22
(
A15
B17
A20
B22
)
56
30.8
A21-B1
A39-B19
(
A21
B1
A39
B19
)
57
30.6
A55-B29
(
A55
B29
)
58
30.6
A5-B19
A14-B28
A19-B33
(
A5
B19
A14
B28
A19
B33
)
59
30.5
A13-B28
A21-B36
(
A13
B28
A21
B36
)
60
30.2
A27-B14
(
A27
B14
)
61
29.8
A53-B17
(
A53
B17
)
62
29.5
A15-B3
A25-B13
(
A15
B3
A25
B13
)
63
29.1
A49-B13
(
A49
B13
)
64
29.0
A33-B19
(
A33
B19
)
65
28.8
A41-B21
(
A41
B21
)
66
28.6
A15-B35
(
A15
B35
)
67
28.6
A47-B11
A52-B16
(
A47
B11
A52
B16
)
68
28.3
A1-B3
A12-B14
A20-B22
(
A1
B3
A12
B14
A20
B22
)
69
28.3
A35-B33
(
A35
B33
)
70
27.9
A5-B3
A35-B33
(
A5
B3
A35
B33
)
71
27.8
A13-B12
A18-B17
(
A13
B12
A18
B17
)
72
27.6
A19-B23
(
A19
B23
)
73
27.6
A5-B1
A16-B12
A33-B29
(
A5
B1
A16
B12
A33
B29
)
74
27.4
A3-B16
A16-B29
(
A3
B16
A16
B29
)
75
27.4
A13-B29
(
A13
B29
)
76
27.4
A19-B25
(
A19
B25
)
77
27.4
A39-B16
(
A39
B16
)
78
27.3
A15-B31
(
A15
B31
)
79
27.3
A33-B18
(
A33
B18
)
80
27.3
A33-B29
(
A33
B29
)
81
27.3
A39-B17
(
A39
B17
)
82
27.2
A3-B1
A35-B33
(
A3
B1
A35
B33
)
83
26.8
A19-B33
(
A19
B33
)
84
26.7
A37-B33
(
A37
B33
)
85
26.7
A49-B17
(
A49
B17
)
86
26.6
A3-B38
(
A3
B38
)
87
26.6
A7-B37
(
A7
B37
)
88
26.6
A17-B13
A33-B29
(
A17
B13
A33
B29
)
89
26.4
A31-B21
(
A31
B21
)
90
26.3
A21-B36
(
A21
B36
)
91
26.3
A25-B13
(
A25
B13
)
92
26.3
A45-B34
(
A45
B34
)
93
26.2
A29-B21
(
A29
B21
)
94
25.9
A3-B30
(
A3
B30
)
95
25.9
A55-B10
(
A55
B10
)
96
25.8
A19-B1
(
A19
B1
)
97
25.8
A53-B5
(
A53
B5
)
98
25.8
A53-B27
(
A53
B27
)