A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =30, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
15
535
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
16
526.3
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
18
514.7
A7-B6
A12-B11
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
20
501
A5-B6
A10-B11
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
22
493.5
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
63
195.5
A3-B14
A8-B19
A23-B34
A31-B42
A38-B49
A45-B56
(
A3
B14
A8
B19
A23
B34
A31
B42
A38
B49
A45
B56
)
69
145.8
A9-B14
A36-B41
A41-B46
A49-B54
(
A9
B14
A36
B41
A41
B46
A49
B54
)
75
112
A37-B4
A42-B9
A50-B17
(
A37
B4
A42
B9
A50
B17
)
78
101.2
A1-B35
A7-B41
A20-B54
(
A1
B35
A7
B41
A20
B54
)
84
85.2
A45-B30
A53-B38
(
A45
B30
A53
B38
)
88
80.2
A43-B10
A50-B17
(
A43
B10
A50
B17
)
90
75.7
A39-B9
A45-B15
(
A39
B9
A45
B15
)
91
75.6
A27-B14
A42-B29
(
A27
B14
A42
B29
)
97
69
A33-B11
A39-B17
(
A33
B11
A39
B17
)
100
67.7
A45-B12
A50-B17
(
A45
B12
A50
B17
)
101
67.4
A7-B38
A21-B52
(
A7
B38
A21
B52
)
102
66.7
A19-B29
A38-B48
(
A19
B29
A38
B48
)
103
66.7
A43-B47
A53-B57
(
A43
B47
A53
B57
)
107
63
A25-B51
A31-B57
(
A25
B51
A31
B57
)
117
45.2
A35-B14
(
A35
B14
)
125
38.7
A21-B15
(
A21
B15
)
128
37.5
A43-B13
(
A43
B13
)
129
37.5
A57-B53
(
A57
B53
)
131
36.4
A7-B19
(
A7
B19
)
132
36.4
A41-B11
(
A41
B11
)
140
34.4
A57-B31
(
A57
B31
)
146
32.4
A35-B30
(
A35
B30
)
147
32.4
A39-B49
(
A39
B49
)
150
31.4
A45-B48
(
A45
B48
)
153
31.2
A7-B54
(
A7
B54
)
158
31.2
A57-B18
(
A57
B18
)
159
30.8
A45-B31
(
A45
B31
)