A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =30, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
49.4
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A37-B37
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A37
B37
)
2
48.6
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A37-B37
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A37
B37
)
3
48.2
A35-B7
(
A35
B7
)
4
47.6
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
A37-B37
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A37
B37
)
9
44.4
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A37-B37
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A37
B37
)
29
39.5
A5-B18
A18-B31
(
A5
B18
A18
B31
)
33
39.0
A35-B6
(
A35
B6
)
34
38.9
A5-B6
A10-B11
A15-B16
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
)
36
38.8
A7-B8
A12-B13
A17-B18
(
A7
B8
A12
B13
A17
B18
)
41
38.3
A5-B17
(
A5
B17
)
47
37.7
A41-B20
(
A41
B20
)
48
37.7
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
)
49
37.7
A3-B4
A8-B9
A13-B14
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
)
57
37.2
A31-B9
A38-B16
(
A31
B9
A38
B16
)
67
36.0
A7-B20
A18-B31
(
A7
B20
A18
B31
)
69
35.9
A21-B13
A47-B39
(
A21
B13
A47
B39
)
70
35.9
A3-B2
A8-B7
A13-B12
A18-B17
A23-B22
(
A3
B2
A8
B7
A13
B12
A18
B17
A23
B22
)
72
35.8
A39-B14
A53-B28
(
A39
B14
A53
B28
)
83
34.8
A23-B5
A50-B32
(
A23
B5
A50
B32
)
94
34.2
A7-B6
A13-B12
A18-B17
A23-B22
(
A7
B6
A13
B12
A18
B17
A23
B22
)
96
34.1
A5-B1
A22-B18
A28-B24
(
A5
B1
A22
B18
A28
B24
)
98
34.0
A5-B19
A15-B29
A21-B35
(
A5
B19
A15
B29
A21
B35
)
99
34.0
A37-B5
A53-B21
(
A37
B5
A53
B21
)
101
33.9
A39-B9
A52-B22
(
A39
B9
A52
B22
)
105
33.6
A19-B6
A25-B12
A52-B39
(
A19
B6
A25
B12
A52
B39
)
106
33.5
A21-B5
A37-B21
(
A21
B5
A37
B21
)
115
33.0
A23-B10
A52-B39
(
A23
B10
A52
B39
)
121
32.8
A25-B12
A52-B39
(
A25
B12
A52
B39
)
127
32.8
A3-B16
A18-B31
(
A3
B16
A18
B31
)
130
32.4
A1-B5
A8-B12
A19-B23
A35-B39
(
A1
B5
A8
B12
A19
B23
A35
B39
)
131
32.3
A39-B13
A44-B18
A54-B28
(
A39
B13
A44
B18
A54
B28
)
139
32.2
A43-B6
A48-B11
A53-B16
(
A43
B6
A48
B11
A53
B16
)
141
31.9
A5-B16
(
A5
B16
)