A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =30, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
5
48.2
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
A30-B30
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A30
B30
)
6
47.8
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A30-B30
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A30
B30
)
8
47.2
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A30-B30
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A30
B30
)
9
47.2
A35-B7
(
A35
B7
)
10
47.2
A41-B20
A50-B29
(
A41
B20
A50
B29
)
14
46.0
A45-B12
A50-B17
(
A45
B12
A50
B17
)
15
45.4
A9-B9
A14-B14
A30-B30
(
A9
B9
A14
B14
A30
B30
)
21
42.9
A57-B13
(
A57
B13
)
24
42.1
A5-B18
A20-B33
(
A5
B18
A20
B33
)
29
41.2
A5-B16
(
A5
B16
)
38
39.7
A15-B4
A23-B12
A35-B24
(
A15
B4
A23
B12
A35
B24
)
42
39.0
A7-B20
A20-B33
(
A7
B20
A20
B33
)
56
38.0
A39-B13
A45-B19
(
A39
B13
A45
B19
)
62
37.7
A7-B19
A13-B25
A27-B39
(
A7
B19
A13
B25
A27
B39
)
70
37.1
A37-B9
(
A37
B9
)
71
37.1
A9-B6
A16-B13
A21-B18
A37-B34
(
A9
B6
A16
B13
A21
B18
A37
B34
)
74
36.8
A23-B12
A35-B24
(
A23
B12
A35
B24
)
79
36.4
A25-B4
A37-B16
A50-B29
(
A25
B4
A37
B16
A50
B29
)
81
36.3
A3-B14
A8-B19
(
A3
B14
A8
B19
)
82
36.3
A35-B2
A44-B11
A49-B16
(
A35
B2
A44
B11
A49
B16
)
87
36.1
A45-B15
(
A45
B15
)
88
36.1
A45-B19
(
A45
B19
)
95
35.9
A57-B14
(
A57
B14
)
96
35.8
A21-B18
A37-B34
(
A21
B18
A37
B34
)
97
35.7
A3-B10
A10-B17
A24-B31
(
A3
B10
A10
B17
A24
B31
)
100
35.5
A9-B13
A14-B18
A20-B24
A37-B41
(
A9
B13
A14
B18
A20
B24
A37
B41
)
101
35.5
A47-B8
A57-B18
(
A47
B8
A57
B18
)
102
35.4
A3-B18
A15-B30
A25-B40
(
A3
B18
A15
B30
A25
B40
)
104
35.2
A19-B11
A24-B16
A43-B35
(
A19
B11
A24
B16
A43
B35
)
110
34.9
A37-B16
A50-B29
(
A37
B16
A50
B29
)
111
34.9
A31-B7
A40-B16
A47-B23
A54-B30
(
A31
B7
A40
B16
A47
B23
A54
B30
)
113
34.7
A39-B7
A52-B20
(
A39
B7
A52
B20
)
117
34.4
A57-B11
(
A57
B11
)
118
34.3
A27-B3
A40-B16
A47-B23
A54-B30
(
A27
B3
A40
B16
A47
B23
A54
B30
)
119
34.3
A7-B4
A16-B13
A21-B18
A37-B34
(
A7
B4
A16
B13
A21
B18
A37
B34
)
123
34.2
A57-B18
(
A57
B18
)
126
34.0
A27-B14
A33-B20
(
A27
B14
A33
B20
)
127
33.8
A35-B12
A45-B22
(
A35
B12
A45
B22
)
128
33.8
A1-B8
A7-B14
A24-B31
(
A1
B8
A7
B14
A24
B31
)
132
33.6
A3-B8
A20-B25
A33-B38
(
A3
B8
A20
B25
A33
B38
)
134
33.4
A33-B11
A38-B16
A46-B24
A54-B32
(
A33
B11
A38
B16
A46
B24
A54
B32
)
136
33.3
A3-B7
A8-B12
A13-B17
A20-B24
A37-B41
(
A3
B7
A8
B12
A13
B17
A20
B24
A37
B41
)
149
33.2
A27-B2
A38-B13
A53-B28
(
A27
B2
A38
B13
A53
B28
)
150
33.0
A37-B1
A44-B8
A49-B13
A54-B18
(
A37
B1
A44
B8
A49
B13
A54
B18
)
153
32.7
A31-B9
A38-B16
A46-B24
A54-B32
(
A31
B9
A38
B16
A46
B24
A54
B32
)
158
32.5
A51-B5
A57-B11
(
A51
B5
A57
B11
)
159
32.4
A27-B5
A32-B10
A38-B16
A46-B24
A54-B32
(
A27
B5
A32
B10
A38
B16
A46
B24
A54
B32
)
165
32.3
A7-B14
A24-B31
(
A7
B14
A24
B31
)
168
32.0
A15-B11
A22-B18
A28-B24
A38-B34
(
A15
B11
A22
B18
A28
B24
A38
B34
)
178
31.4
A37-B8
(
A37
B8
)
186
31.1
A5-B19
A16-B30
A22-B36
(
A5
B19
A16
B30
A22
B36
)
187
31.0
A39-B9
A44-B14
(
A39
B9
A44
B14
)