A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =25, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
225
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A34-B34
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A34
B34
)
2
207.6
A3-B3
A9-B9
A14-B14
A19-B19
A34-B34
(
A3
B3
A9
B9
A14
B14
A19
B19
A34
B34
)
3
177
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A34-B34
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A34
B34
)
4
159.1
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A34-B34
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A34
B34
)
6
149.4
A3-B2
A10-B9
A17-B16
A24-B23
A31-B30
(
A3
B2
A10
B9
A17
B16
A24
B23
A31
B30
)
7
149.4
A5-B4
A10-B9
A17-B16
A24-B23
A31-B30
(
A5
B4
A10
B9
A17
B16
A24
B23
A31
B30
)
8
130.7
A31-B9
A38-B16
A46-B24
A54-B32
(
A31
B9
A38
B16
A46
B24
A54
B32
)
9
125.8
A1-B7
A14-B20
A23-B29
A32-B38
(
A1
B7
A14
B20
A23
B29
A32
B38
)
11
114.6
A15-B3
A26-B14
A41-B29
A52-B40
(
A15
B3
A26
B14
A41
B29
A52
B40
)
12
114.5
A29-B3
A38-B12
A46-B20
A55-B29
(
A29
B3
A38
B12
A46
B20
A55
B29
)
13
111.7
A7-B6
A17-B16
A24-B23
A31-B30
(
A7
B6
A17
B16
A24
B23
A31
B30
)
14
111.4
A13-B13
A18-B18
A34-B34
(
A13
B13
A18
B18
A34
B34
)
15
104.1
A7-B12
A20-B25
A33-B38
(
A7
B12
A20
B25
A33
B38
)
16
103.2
A3-B30
A8-B35
A13-B40
(
A3
B30
A8
B35
A13
B40
)
17
97.3
A1-B8
A10-B17
A24-B31
(
A1
B8
A10
B17
A24
B31
)
18
95.6
A39-B13
A46-B20
A55-B29
(
A39
B13
A46
B20
A55
B29
)
19
94.1
A5-B6
A13-B14
A18-B19
(
A5
B6
A13
B14
A18
B19
)
20
92.8
A15-B24
A22-B31
A27-B36
(
A15
B24
A22
B31
A27
B36
)
21
92.4
A37-B16
A45-B24
A54-B33
(
A37
B16
A45
B24
A54
B33
)
22
91.9
A45-B12
A50-B17
(
A45
B12
A50
B17
)
23
91
A9-B13
A14-B18
A21-B25
(
A9
B13
A14
B18
A21
B25
)
24
90.8
A19-B10
A27-B18
A50-B41
(
A19
B10
A27
B18
A50
B41
)
25
89.3
A35-B12
A40-B17
A46-B23
(
A35
B12
A40
B17
A46
B23
)
26
89
A1-B2
A9-B10
A14-B15
(
A1
B2
A9
B10
A14
B15
)
27
89
A3-B4
A9-B10
A14-B15
(
A3
B4
A9
B10
A14
B15
)
28
88.1
A37-B1
A49-B13
A54-B18
(
A37
B1
A49
B13
A54
B18
)
29
86.5
A5-B25
A10-B30
A15-B35
(
A5
B25
A10
B30
A15
B35
)
31
85.9
A19-B21
A24-B26
A35-B37
(
A19
B21
A24
B26
A35
B37
)
32
83
A41-B20
A54-B33
(
A41
B20
A54
B33
)
34
74.6
A29-B22
A46-B39
(
A29
B22
A46
B39
)
35
72
A31-B11
A41-B21
(
A31
B11
A41
B21
)
36
70.8
A21-B26
A33-B38
(
A21
B26
A33
B38
)
37
70.8
A31-B27
A43-B39
(
A31
B27
A43
B39
)
38
70.3
A27-B35
A32-B40
(
A27
B35
A32
B40
)
40
66.9
A27-B23
A43-B39
(
A27
B23
A43
B39
)
41
66.9
A49-B12
A54-B17
(
A49
B12
A54
B17
)
42
66.3
A15-B30
A25-B40
(
A15
B30
A25
B40
)
43
66.1
A35-B7
A53-B25
(
A35
B7
A53
B25
)
44
65
A5-B32
A13-B40
(
A5
B32
A13
B40
)
46
64.6
A17-B32
A25-B40
(
A17
B32
A25
B40
)
47
64.5
A17-B31
A22-B36
(
A17
B31
A22
B36
)
48
64.2
A27-B14
A52-B39
(
A27
B14
A52
B39
)
49
63.8
A11-B18
A24-B31
(
A11
B18
A24
B31
)
50
63.8
A31-B16
A36-B21
(
A31
B16
A36
B21
)
51
63.5
A51-B5
A57-B11
(
A51
B5
A57
B11
)
52
61.9
A41-B18
A46-B23
(
A41
B18
A46
B23
)
53
61.7
A27-B20
A46-B39
(
A27
B20
A46
B39
)
54
60.9
A41-B1
A54-B14
(
A41
B1
A54
B14
)
57
60
A21-B2
A57-B38
(
A21
B2
A57
B38
)
58
60
A37-B8
A44-B15
(
A37
B8
A44
B15
)
61
58.7
A11-B15
A21-B25
(
A11
B15
A21
B25
)
62
58.6
A35-B11
A54-B30
(
A35
B11
A54
B30
)
64
57.6
A45-B15
A57-B27
(
A45
B15
A57
B27
)
65
57.5
A13-B17
A21-B25
(
A13
B17
A21
B25
)
66
57.5
A15-B19
A21-B25
(
A15
B19
A21
B25
)
68
57.3
A15-B4
A47-B36
(
A15
B4
A47
B36
)
69
57.2
A37-B9
A53-B25
(
A37
B9
A53
B25
)
70
56.8
A5-B31
A13-B39
(
A5
B31
A13
B39
)
71
56.8
A35-B6
A44-B15
(
A35
B6
A44
B15
)
72
56.4
A9-B28
A16-B35
(
A9
B28
A16
B35
)
73
56
A7-B32
A15-B40
(
A7
B32
A15
B40
)
74
55.4
A5-B17
A23-B35
(
A5
B17
A23
B35
)
75
55.4
A7-B19
A23-B35
(
A7
B19
A23
B35
)
77
53.1
A41-B14
A47-B20
(
A41
B14
A47
B20
)
78
52.9
A3-B14
A13-B24
(
A3
B14
A13
B24
)
79
46.7
A37-B34
(
A37
B34
)
80
43.8
A55-B30
(
A55
B30
)
81
41.9
A7-B20
(
A7
B20
)
82
40.6
A5-B18
(
A5
B18
)
83
40.5
A17-B18
(
A17
B18
)
85
38.7
A19-B38
(
A19
B38
)
86
38.7
A47-B40
(
A47
B40
)
87
38.2
A5-B36
(
A5
B36
)
89
36.4
A23-B6
(
A23
B6
)
90
35.5
A21-B38
(
A21
B38
)
91
35.3
A5-B41
(
A5
B41
)
92
35.1
A15-B16
(
A15
B16
)
93
33.3
A5-B37
(
A5
B37
)
94
33.3
A27-B37
(
A27
B37
)
97
33.3
A55-B6
(
A55
B6
)
98
32.4
A11-B14
(
A11
B14
)
99
32.4
A25-B32
(
A25
B32
)
100
32.3
A15-B26
(
A15
B26
)
101
31.4
A5-B35
(
A5
B35
)
102
31.4
A33-B19
(
A33
B19
)
103
31.4
A51-B14
(
A51
B14
)
104
31.4
A53-B3
(
A53
B3
)
105
31.4
A53-B4
(
A53
B4
)
106
31.2
A53-B28
(
A53
B28
)
109
30.3
A25-B39
(
A25
B39
)
110
30.3
A55-B18
(
A55
B18
)
111
29.4
A29-B23
(
A29
B23
)
112
29.4
A51-B42
(
A51
B42
)
113
29.4
A55-B5
(
A55
B5
)
114
29.4
A55-B11
(
A55
B11
)
116
28.9
A55-B31
(
A55
B31
)
119
28.1
A39-B23
(
A39
B23
)
120
27.8
A53-B40
(
A53
B40
)
121
27.8
A55-B12
(
A55
B12
)
122
27.3
A45-B35
(
A45
B35
)
124
27
A29-B37
(
A29
B37
)
126
27
A55-B19
(
A55
B19
)
131
25.7
A3-B35
(
A3
B35
)
134
25.7
A33-B18
(
A33
B18
)
137
25.6
A23-B5
(
A23
B5
)
139
25.6
A47-B39
(
A47
B39
)