A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =35, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
15
535
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
18
514.7
A7-B6
A12-B11
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
20
501
A5-B6
A10-B11
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
22
496
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
66
165.8
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
72
110.5
A3-B14
A32-B43
A46-B57
(
A3
B14
A32
B43
A46
B57
)
79
85.2
A45-B30
A53-B38
(
A45
B30
A53
B38
)
84
76.9
A47-B43
A57-B53
(
A47
B43
A57
B53
)
92
45.2
A35-B14
(
A35
B14
)
96
43.3
A27-B14
(
A27
B14
)
97
42.4
A45-B15
(
A45
B15
)
103
38.7
A21-B15
(
A21
B15
)
104
38.7
A39-B17
(
A39
B17
)
107
37.5
A43-B13
(
A43
B13
)
111
36.4
A7-B19
(
A7
B19
)
112
36.4
A41-B11
(
A41
B11
)