A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =35, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
11
688.7
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
13
674.2
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
14
657.6
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
)
20
601
A9-B10
A14-B15
A19-B20
A24-B25
A29-B30
A34-B35
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A9
B10
A14
B15
A19
B20
A24
B25
A29
B30
A34
B35
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
35
455.1
A5-B3
A10-B8
A15-B13
A20-B18
A25-B23
A30-B28
A35-B33
A40-B38
A45-B43
A50-B48
A55-B53
(
A5
B3
A10
B8
A15
B13
A20
B18
A25
B23
A30
B28
A35
B33
A40
B38
A45
B43
A50
B48
A55
B53
)
38
432.4
A3-B5
A8-B10
A13-B15
A18-B20
A23-B25
A28-B30
A33-B35
A38-B40
A43-B45
A48-B50
A53-B55
(
A3
B5
A8
B10
A13
B15
A18
B20
A23
B25
A28
B30
A33
B35
A38
B40
A43
B45
A48
B50
A53
B55
)
39
430.8
A1-B3
A6-B8
A11-B13
A16-B18
A21-B23
A26-B28
A31-B33
A38-B40
A43-B45
A48-B50
A53-B55
(
A1
B3
A6
B8
A11
B13
A16
B18
A21
B23
A26
B28
A31
B33
A38
B40
A43
B45
A48
B50
A53
B55
)
49
393.7
A7-B9
A12-B14
A17-B19
A22-B24
A27-B29
A32-B34
A38-B40
A43-B45
A48-B50
A53-B55
(
A7
B9
A12
B14
A17
B19
A22
B24
A27
B29
A32
B34
A38
B40
A43
B45
A48
B50
A53
B55
)
50
392.9
A5-B7
A10-B12
A15-B17
A20-B22
A25-B27
A30-B32
A38-B40
A43-B45
A48-B50
A53-B55
(
A5
B7
A10
B12
A15
B17
A20
B22
A25
B27
A30
B32
A38
B40
A43
B45
A48
B50
A53
B55
)
55
358.1
A11-B9
A16-B14
A21-B19
A26-B24
A31-B29
A36-B34
A41-B39
A46-B44
A51-B49
(
A11
B9
A16
B14
A21
B19
A26
B24
A31
B29
A36
B34
A41
B39
A46
B44
A51
B49
)
56
355.7
A9-B11
A14-B16
A19-B21
A24-B26
A29-B31
A38-B40
A43-B45
A48-B50
A53-B55
(
A9
B11
A14
B16
A19
B21
A24
B26
A29
B31
A38
B40
A43
B45
A48
B50
A53
B55
)
106
132.5
A1-B34
A10-B43
A17-B50
(
A1
B34
A10
B43
A17
B50
)
107
131.7
A35-B2
A43-B10
A49-B16
(
A35
B2
A43
B10
A49
B16
)
110
125.9
A23-B10
A28-B15
A38-B25
(
A23
B10
A28
B15
A38
B25
)
115
119.7
A31-B9
A39-B17
A50-B28
(
A31
B9
A39
B17
A50
B28
)
121
108.4
A39-B41
A44-B46
A49-B51
(
A39
B41
A44
B46
A49
B51
)
128
85.4
A25-B12
A38-B25
(
A25
B12
A38
B25
)
129
83.8
A3-B19
A35-B51
(
A3
B19
A35
B51
)
135
78
A37-B7
A42-B12
(
A37
B7
A42
B12
)
137
77.7
A35-B9
A44-B18
(
A35
B9
A44
B18
)
140
76.1
A17-B27
A36-B46
(
A17
B27
A36
B46
)
141
76.1
A35-B19
A50-B34
(
A35
B19
A50
B34
)
143
74.4
A27-B13
A43-B29
(
A27
B13
A43
B29
)
144
74.4
A33-B3
A41-B11
(
A33
B3
A41
B11
)
145
74.3
A7-B19
A41-B53
(
A7
B19
A41
B53
)
146
74.1
A7-B37
A20-B50
(
A7
B37
A20
B50
)
149
72.2
A1-B15
A22-B36
(
A1
B15
A22
B36
)
151
71.8
A3-B25
A8-B30
(
A3
B25
A8
B30
)
153
71
A15-B23
A37-B45
(
A15
B23
A37
B45
)
173
40
A35-B30
(
A35
B30
)
174
40
A39-B28
(
A39
B28
)
182
38.6
A21-B55
(
A21
B55
)
183
38.6
A43-B13
(
A43
B13
)
188
38.1
A37-B29
(
A37
B29
)
191
37.9
A23-B50
(
A23
B50
)
192
37.5
A39-B50
(
A39
B50
)
193
37.3
A1-B18
(
A1
B18
)
198
37.1
A39-B30
(
A39
B30
)
206
35.9
A37-B28
(
A37
B28
)
209
35.5
A43-B28
(
A43
B28
)