A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =25, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
11
688.7
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
13
674.2
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
14
657.6
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
)
20
601
A9-B10
A14-B15
A19-B20
A24-B25
A29-B30
A34-B35
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A9
B10
A14
B15
A19
B20
A24
B25
A29
B30
A34
B35
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
35
455.1
A5-B3
A10-B8
A15-B13
A20-B18
A25-B23
A30-B28
A35-B33
A40-B38
A45-B43
A50-B48
A55-B53
(
A5
B3
A10
B8
A15
B13
A20
B18
A25
B23
A30
B28
A35
B33
A40
B38
A45
B43
A50
B48
A55
B53
)
38
432.4
A3-B5
A8-B10
A13-B15
A18-B20
A23-B25
A28-B30
A33-B35
A38-B40
A43-B45
A48-B50
A53-B55
(
A3
B5
A8
B10
A13
B15
A18
B20
A23
B25
A28
B30
A33
B35
A38
B40
A43
B45
A48
B50
A53
B55
)
45
415.4
A1-B3
A6-B8
A11-B13
A16-B18
A21-B23
A26-B28
A31-B33
A36-B38
A41-B43
A46-B48
A51-B53
(
A1
B3
A6
B8
A11
B13
A16
B18
A21
B23
A26
B28
A31
B33
A36
B38
A41
B43
A46
B48
A51
B53
)
49
390.9
A7-B9
A12-B14
A17-B19
A22-B24
A27-B29
A32-B34
A37-B39
A42-B44
A47-B49
A52-B54
(
A7
B9
A12
B14
A17
B19
A22
B24
A27
B29
A32
B34
A37
B39
A42
B44
A47
B49
A52
B54
)
51
376.1
A5-B7
A10-B12
A15-B17
A20-B22
A25-B27
A30-B32
A35-B37
A40-B42
A45-B47
A50-B52
(
A5
B7
A10
B12
A15
B17
A20
B22
A25
B27
A30
B32
A35
B37
A40
B42
A45
B47
A50
B52
)
54
358.1
A11-B9
A16-B14
A21-B19
A26-B24
A31-B29
A36-B34
A41-B39
A46-B44
A51-B49
(
A11
B9
A16
B14
A21
B19
A26
B24
A31
B29
A36
B34
A41
B39
A46
B44
A51
B49
)
60
343.1
A9-B11
A14-B16
A19-B21
A24-B26
A29-B31
A34-B36
A39-B41
A44-B46
A49-B51
(
A9
B11
A14
B16
A19
B21
A24
B26
A29
B31
A34
B36
A39
B41
A44
B46
A49
B51
)
80
266.1
A7-B2
A12-B7
A19-B14
A24-B19
A29-B24
A34-B29
A46-B41
A54-B49
(
A7
B2
A12
B7
A19
B14
A24
B19
A29
B24
A34
B29
A46
B41
A54
B49
)
86
242.1
A15-B1
A20-B6
A25-B11
A30-B16
A37-B23
A43-B29
A49-B35
A54-B40
(
A15
B1
A20
B6
A25
B11
A30
B16
A37
B23
A43
B29
A49
B35
A54
B40
)
93
217.3
A23-B10
A28-B15
A37-B24
A42-B29
A48-B35
A54-B41
(
A23
B10
A28
B15
A37
B24
A42
B29
A48
B35
A54
B41
)
94
216.7
A9-B4
A19-B14
A24-B19
A29-B24
A34-B29
A46-B41
A54-B49
(
A9
B4
A19
B14
A24
B19
A29
B24
A34
B29
A46
B41
A54
B49
)
95
216.2
A1-B15
A11-B25
A16-B30
A21-B35
A27-B41
A32-B46
A37-B51
(
A1
B15
A11
B25
A16
B30
A21
B35
A27
B41
A32
B46
A37
B51
)
96
210.1
A25-B12
A31-B18
A37-B24
A42-B29
A48-B35
A54-B41
(
A25
B12
A31
B18
A37
B24
A42
B29
A48
B35
A54
B41
)
98
198.3
A7-B18
A12-B23
A20-B31
A31-B42
A38-B49
A44-B55
(
A7
B18
A12
B23
A20
B31
A31
B42
A38
B49
A44
B55
)
100
196.1
A17-B6
A31-B20
A36-B25
A43-B32
A49-B38
A55-B44
(
A17
B6
A31
B20
A36
B25
A43
B32
A49
B38
A55
B44
)
102
194.3
A1-B19
A6-B24
A13-B31
A19-B37
A30-B48
A37-B55
(
A1
B19
A6
B24
A13
B31
A19
B37
A30
B48
A37
B55
)
104
193
A1-B7
A8-B14
A16-B22
A29-B35
A34-B40
A48-B54
(
A1
B7
A8
B14
A16
B22
A29
B35
A34
B40
A48
B54
)
107
188.3
A29-B7
A34-B12
A39-B17
A44-B22
A49-B27
A54-B32
(
A29
B7
A34
B12
A39
B17
A44
B22
A49
B27
A54
B32
)
109
187.2
A5-B18
A10-B23
A15-B28
A22-B35
A31-B44
A38-B51
(
A5
B18
A10
B23
A15
B28
A22
B35
A31
B44
A38
B51
)
111
185.9
A9-B3
A14-B8
A19-B13
A24-B18
A32-B26
A52-B46
(
A9
B3
A14
B8
A19
B13
A24
B18
A32
B26
A52
B46
)
114
183
A25-B3
A30-B8
A35-B13
A44-B22
A49-B27
A54-B32
(
A25
B3
A30
B8
A35
B13
A44
B22
A49
B27
A54
B32
)
115
182.1
A25-B4
A30-B9
A37-B16
A42-B21
A47-B26
A52-B31
(
A25
B4
A30
B9
A37
B16
A42
B21
A47
B26
A52
B31
)
117
181.5
A1-B9
A15-B23
A20-B28
A30-B38
A35-B43
A40-B48
(
A1
B9
A15
B23
A20
B28
A30
B38
A35
B43
A40
B48
)
118
181.3
A17-B1
A23-B7
A35-B19
A44-B28
A49-B33
A55-B39
(
A17
B1
A23
B7
A35
B19
A44
B28
A49
B33
A55
B39
)
121
180.2
A23-B2
A30-B9
A37-B16
A42-B21
A47-B26
A52-B31
(
A23
B2
A30
B9
A37
B16
A42
B21
A47
B26
A52
B31
)
122
179.2
A7-B1
A13-B7
A19-B13
A24-B18
A32-B26
A52-B46
(
A7
B1
A13
B7
A19
B13
A24
B18
A32
B26
A52
B46
)
123
178.3
A5-B17
A11-B23
A16-B28
A22-B34
A30-B42
A41-B53
(
A5
B17
A11
B23
A16
B28
A22
B34
A30
B42
A41
B53
)
126
176.3
A5-B23
A13-B31
A19-B37
A30-B48
A37-B55
(
A5
B23
A13
B31
A19
B37
A30
B48
A37
B55
)
128
171.9
A9-B20
A20-B31
A31-B42
A38-B49
A44-B55
(
A9
B20
A20
B31
A31
B42
A38
B49
A44
B55
)
129
170
A27-B14
A37-B24
A42-B29
A48-B35
A54-B41
(
A27
B14
A37
B24
A42
B29
A48
B35
A54
B41
)
130
168.4
A3-B21
A13-B31
A19-B37
A30-B48
A37-B55
(
A3
B21
A13
B31
A19
B37
A30
B48
A37
B55
)
131
167.1
A13-B24
A20-B31
A31-B42
A38-B49
A44-B55
(
A13
B24
A20
B31
A31
B42
A38
B49
A44
B55
)
132
166
A29-B16
A37-B24
A42-B29
A48-B35
A54-B41
(
A29
B16
A37
B24
A42
B29
A48
B35
A54
B41
)
135
162.2
A33-B11
A39-B17
A44-B22
A49-B27
A54-B32
(
A33
B11
A39
B17
A44
B22
A49
B27
A54
B32
)
136
161.4
A21-B5
A35-B19
A44-B28
A49-B33
A55-B39
(
A21
B5
A35
B19
A44
B28
A49
B33
A55
B39
)
137
160.3
A3-B29
A12-B38
A17-B43
A22-B48
A29-B55
(
A3
B29
A12
B38
A17
B43
A22
B48
A29
B55
)
138
159.8
A11-B21
A16-B26
A23-B33
A36-B46
A45-B55
(
A11
B21
A16
B26
A23
B33
A36
B46
A45
B55
)
140
159.3
A7-B19
A12-B24
A22-B34
A30-B42
A41-B53
(
A7
B19
A12
B24
A22
B34
A30
B42
A41
B53
)
142
158.4
A21-B16
A29-B24
A34-B29
A46-B41
A54-B49
(
A21
B16
A29
B24
A34
B29
A46
B41
A54
B49
)
143
158.4
A31-B9
A36-B14
A44-B22
A49-B27
A54-B32
(
A31
B9
A36
B14
A44
B22
A49
B27
A54
B32
)
144
156.5
A27-B13
A37-B23
A43-B29
A49-B35
A54-B40
(
A27
B13
A37
B23
A43
B29
A49
B35
A54
B40
)
147
152.8
A9-B2
A16-B9
A21-B14
A30-B23
A51-B44
(
A9
B2
A16
B9
A21
B14
A30
B23
A51
B44
)
149
152
A1-B22
A8-B29
A19-B40
A24-B45
A29-B50
(
A1
B22
A8
B29
A19
B40
A24
B45
A29
B50
)
152
150.4
A31-B17
A37-B23
A43-B29
A49-B35
A54-B40
(
A31
B17
A37
B23
A43
B29
A49
B35
A54
B40
)
153
150.2
A17-B5
A23-B11
A35-B23
A40-B28
A50-B38
(
A17
B5
A23
B11
A35
B23
A40
B28
A50
B38
)
154
149.2
A1-B34
A8-B41
A14-B47
A19-B52
(
A1
B34
A8
B41
A14
B47
A19
B52
)
155
147.9
A21-B9
A26-B14
A35-B23
A40-B28
A50-B38
(
A21
B9
A26
B14
A35
B23
A40
B28
A50
B38
)
156
147.5
A29-B15
A37-B23
A43-B29
A49-B35
A54-B40
(
A29
B15
A37
B23
A43
B29
A49
B35
A54
B40
)
157
146.1
A3-B19
A16-B32
A30-B46
A35-B51
(
A3
B19
A16
B32
A30
B46
A35
B51
)
158
145.5
A31-B10
A37-B16
A42-B21
A47-B26
A52-B31
(
A31
B10
A37
B16
A42
B21
A47
B26
A52
B31
)
160
144.3
A35-B9
A44-B18
A49-B23
A55-B29
(
A35
B9
A44
B18
A49
B23
A55
B29
)
161
144.1
A19-B2
A24-B7
A36-B19
A44-B27
A51-B34
(
A19
B2
A24
B7
A36
B19
A44
B27
A51
B34
)
162
141.8
A13-B26
A22-B35
A31-B44
A38-B51
(
A13
B26
A22
B35
A31
B44
A38
B51
)
163
141.4
A15-B33
A20-B38
A30-B48
A37-B55
(
A15
B33
A20
B38
A30
B48
A37
B55
)
164
141.1
A13-B27
A20-B34
A25-B39
A30-B44
A37-B51
(
A13
B27
A20
B34
A25
B39
A30
B44
A37
B51
)
165
140.7
A27-B17
A33-B23
A39-B29
A44-B34
A55-B45
(
A27
B17
A33
B23
A39
B29
A44
B34
A55
B45
)
168
136.6
A29-B19
A34-B24
A39-B29
A44-B34
A55-B45
(
A29
B19
A34
B24
A39
B29
A44
B34
A55
B45
)
170
136.2
A15-B29
A20-B34
A25-B39
A30-B44
A37-B51
(
A15
B29
A20
B34
A25
B39
A30
B44
A37
B51
)
172
134.3
A17-B27
A23-B33
A36-B46
A45-B55
(
A17
B27
A23
B33
A36
B46
A45
B55
)
174
131.3
A17-B2
A35-B20
A43-B28
A53-B38
(
A17
B2
A35
B20
A43
B28
A53
B38
)
176
130.8
A3-B25
A8-B30
A23-B45
A28-B50
(
A3
B25
A8
B30
A23
B45
A28
B50
)
178
130.2
A21-B32
A31-B42
A38-B49
A44-B55
(
A21
B32
A31
B42
A38
B49
A44
B55
)
180
129.2
A33-B22
A39-B28
A49-B38
A55-B44
(
A33
B22
A39
B28
A49
B38
A55
B44
)
184
127.7
A1-B18
A6-B23
A15-B32
A34-B51
(
A1
B18
A6
B23
A15
B32
A34
B51
)
185
127.7
A19-B1
A24-B6
A37-B19
A48-B30
(
A19
B1
A24
B6
A37
B19
A48
B30
)
189
125.9
A11-B24
A22-B35
A31-B44
A38-B51
(
A11
B24
A22
B35
A31
B44
A38
B51
)
190
125.4
A39-B5
A44-B10
A49-B15
A54-B20
(
A39
B5
A44
B10
A49
B15
A54
B20
)
193
123.5
A23-B6
A36-B19
A44-B27
A51-B34
(
A23
B6
A36
B19
A44
B27
A51
B34
)
195
122.3
A13-B25
A22-B34
A30-B42
A41-B53
(
A13
B25
A22
B34
A30
B42
A41
B53
)
198
121.2
A37-B4
A42-B9
A48-B15
A54-B21
(
A37
B4
A42
B9
A48
B15
A54
B21
)
199
120.7
A21-B4
A36-B19
A44-B27
A51-B34
(
A21
B4
A36
B19
A44
B27
A51
B34
)
200
120.5
A25-B13
A35-B23
A40-B28
A50-B38
(
A25
B13
A35
B23
A40
B28
A50
B38
)
201
120.4
A11-B32
A19-B40
A24-B45
A29-B50
(
A11
B32
A19
B40
A24
B45
A29
B50
)
202
120.1
A33-B12
A39-B18
A47-B26
A52-B31
(
A33
B12
A39
B18
A47
B26
A52
B31
)
204
120
A25-B17
A37-B29
A45-B37
A53-B45
(
A25
B17
A37
B29
A45
B37
A53
B45
)
206
119.4
A1-B16
A17-B32
A22-B37
A35-B50
(
A1
B16
A17
B32
A22
B37
A35
B50
)
207
118.4
A13-B37
A19-B43
A26-B50
A31-B55
(
A13
B37
A19
B43
A26
B50
A31
B55
)
212
117.3
A7-B29
A12-B34
A23-B45
A28-B50
(
A7
B29
A12
B34
A23
B45
A28
B50
)
215
116.9
A9-B30
A19-B40
A24-B45
A29-B50
(
A9
B30
A19
B40
A24
B45
A29
B50
)
216
116.7
A17-B25
A30-B38
A35-B43
A40-B48
(
A17
B25
A30
B38
A35
B43
A40
B48
)
217
116.3
A3-B18
A17-B32
A22-B37
A35-B50
(
A3
B18
A17
B32
A22
B37
A35
B50
)
218
113.8
A31-B8
A36-B13
A45-B22
A50-B27
(
A31
B8
A36
B13
A45
B22
A50
B27
)
221
113
A19-B27
A30-B38
A35-B43
A40-B48
(
A19
B27
A30
B38
A35
B43
A40
B48
)
222
112.6
A27-B15
A35-B23
A40-B28
A50-B38
(
A27
B15
A35
B23
A40
B28
A50
B38
)
223
112.2
A33-B10
A38-B15
A45-B22
A50-B27
(
A33
B10
A38
B15
A45
B22
A50
B27
)
225
110
A39-B25
A44-B30
A49-B35
A54-B40
(
A39
B25
A44
B30
A49
B35
A54
B40
)
226
109.1
A3-B28
A11-B36
A16-B41
A29-B54
(
A3
B28
A11
B36
A16
B41
A29
B54
)
227
109
A31-B1
A37-B7
A42-B12
(
A31
B1
A37
B7
A42
B12
)
229
108.1
A21-B3
A37-B19
A48-B30
(
A21
B3
A37
B19
A48
B30
)
231
107.7
A33-B4
A38-B9
A43-B14
A53-B24
(
A33
B4
A38
B9
A43
B14
A53
B24
)
232
106.9
A7-B37
A13-B43
A20-B50
(
A7
B37
A13
B43
A20
B50
)
234
105.5
A43-B10
A48-B15
A54-B21
(
A43
B10
A48
B15
A54
B21
)
237
104.3
A23-B5
A37-B19
A48-B30
(
A23
B5
A37
B19
A48
B30
)
247
98.6
A19-B29
A36-B46
A45-B55
(
A19
B29
A36
B46
A45
B55
)
248
98.3
A1-B28
A6-B33
A23-B50
(
A1
B28
A6
B33
A23
B50
)
250
97
A5-B35
A11-B41
A20-B50
(
A5
B35
A11
B41
A20
B50
)
251
96.9
A19-B35
A30-B46
A35-B51
(
A19
B35
A30
B46
A35
B51
)
252
96.7
A35-B30
A46-B41
A54-B49
(
A35
B30
A46
B41
A54
B49
)
254
96.5
A33-B3
A39-B9
A44-B14
(
A33
B3
A39
B9
A44
B14
)
255
95.9
A9-B39
A14-B44
A20-B50
(
A9
B39
A14
B44
A20
B50
)
257
95.2
A37-B20
A44-B27
A51-B34
(
A37
B20
A44
B27
A51
B34
)
259
94.5
A17-B35
A30-B48
A37-B55
(
A17
B35
A30
B48
A37
B55
)
260
94
A43-B9
A49-B15
A54-B20
(
A43
B9
A49
B15
A54
B20
)
262
93.3
A25-B7
A37-B19
A48-B30
(
A25
B7
A37
B19
A48
B30
)
263
92.7
A25-B38
A31-B44
A38-B51
(
A25
B38
A31
B44
A38
B51
)
274
91.1
A3-B34
A8-B39
A20-B51
(
A3
B34
A8
B39
A20
B51
)
275
90.6
A21-B15
A32-B26
A52-B46
(
A21
B15
A32
B26
A52
B46
)
277
90.2
A9-B31
A23-B45
A28-B50
(
A9
B31
A23
B45
A28
B50
)
280
89.6
A35-B3
A42-B10
A48-B16
(
A35
B3
A42
B10
A48
B16
)
284
88.5
A1-B43
A8-B50
A13-B55
(
A1
B43
A8
B50
A13
B55
)
288
88.2
A35-B10
A43-B18
A55-B30
(
A35
B10
A43
B18
A55
B30
)
292
86.8
A15-B40
A20-B45
A29-B54
(
A15
B40
A20
B45
A29
B54
)
293
86.5
A39-B16
A45-B22
A50-B27
(
A39
B16
A45
B22
A50
B27
)
294
86.1
A31-B11
A36-B16
A50-B30
(
A31
B11
A36
B16
A50
B30
)
297
85.6
A37-B12
A43-B18
A55-B30
(
A37
B12
A43
B18
A55
B30
)
298
85.1
A23-B16
A30-B23
A51-B44
(
A23
B16
A30
B23
A51
B44
)
299
85.1
A37-B27
A44-B34
A55-B45
(
A37
B27
A44
B34
A55
B45
)
301
84.3
A39-B31
A45-B37
A53-B45
(
A39
B31
A45
B37
A53
B45
)
302
84.1
A15-B39
A26-B50
A31-B55
(
A15
B39
A26
B50
A31
B55
)
304
83.6
A23-B37
A30-B44
A37-B51
(
A23
B37
A30
B44
A37
B51
)
305
83.6
A37-B14
A45-B22
A50-B27
(
A37
B14
A45
B22
A50
B27
)
308
82.2
A15-B22
A34-B41
A41-B48
(
A15
B22
A34
B41
A41
B48
)
309
82.1
A3-B45
A8-B50
A13-B55
(
A3
B45
A8
B50
A13
B55
)
310
81.8
A37-B8
A42-B13
A53-B24
(
A37
B8
A42
B13
A53
B24
)
320
75.4
A17-B50
A22-B55
(
A17
B50
A22
B55
)
323
70.8
A39-B50
A44-B55
(
A39
B50
A44
B55
)
331
67.6
A25-B16
A37-B28
(
A25
B16
A37
B28
)
333
66.4
A17-B26
A37-B46
(
A17
B26
A37
B46
)
336
65.8
A15-B49
A20-B54
(
A15
B49
A20
B54
)
337
65.6
A5-B36
A20-B51
(
A5
B36
A20
B51
)
338
65.6
A35-B46
A41-B52
(
A35
B46
A41
B52
)
339
65.4
A33-B45
A41-B53
(
A33
B45
A41
B53
)
340
65
A27-B18
A37-B28
(
A27
B18
A37
B28
)
345
63.9
A19-B28
A37-B46
(
A19
B28
A37
B46
)
349
62.8
A25-B47
A30-B52
(
A25
B47
A30
B52
)
351
62.7
A5-B49
A10-B54
(
A5
B49
A10
B54
)
352
62.5
A19-B34
A35-B50
(
A19
B34
A35
B50
)
353
62.3
A23-B49
A29-B55
(
A23
B49
A29
B55
)
358
61.7
A7-B38
A20-B51
(
A7
B38
A20
B51
)
366
59.8
A35-B48
A42-B55
(
A35
B48
A42
B55
)
368
59.4
A35-B29
A52-B46
(
A35
B29
A52
B46
)
375
58.6
A23-B38
A35-B50
(
A23
B38
A35
B50
)
379
57.2
A43-B19
A51-B27
(
A43
B19
A51
B27
)
380
56.8
A41-B29
A50-B38
(
A41
B29
A50
B38
)
383
55.5
A17-B45
A22-B50
(
A17
B45
A22
B50
)
392
52.9
A39-B10
A53-B24
(
A39
B10
A53
B24
)
393
52.8
A41-B12
A53-B24
(
A41
B12
A53
B24
)
394
52.6
A31-B45
A37-B51
(
A31
B45
A37
B51
)
396
51.9
A43-B12
A51-B20
(
A43
B12
A51
B20
)
409
38.6
A21-B55
(
A21
B55
)
410
38.6
A43-B13
(
A43
B13
)
416
37.3
A41-B11
(
A41
B11
)
419
37.1
A39-B30
(
A39
B30
)
426
35.9
A37-B45
(
A37
B45
)
430
34.4
A25-B52
(
A25
B52
)
437
33.3
A39-B47
(
A39
B47
)
455
32.2
A43-B55
(
A43
B55
)
456
31.7
A3-B49
(
A3
B49
)
462
31.2
A35-B52
(
A35
B52
)
468
30.3
A7-B50
(
A7
B50
)
474
29.7
A21-B54
(
A21
B54
)
477
29.6
A5-B54
(
A5
B54
)
482
29.2
A3-B54
(
A3
B54
)
483
29.2
A5-B52
(
A5
B52
)
497
28.1
A7-B51
(
A7
B51
)
508
26.9
A25-B51
(
A25
B51
)
513
26.7
A5-B53
(
A5
B53
)