A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =30, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
15
540
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
16
531.2
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
17
516.2
A7-B6
A12-B11
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
21
501
A5-B6
A10-B11
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
22
493.5
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
55
254.4
A3-B14
A8-B19
A19-B30
A30-B41
A36-B47
A41-B52
A46-B57
(
A3
B14
A8
B19
A19
B30
A30
B41
A36
B47
A41
B52
A46
B57
)
60
218.7
A11-B5
A16-B10
A21-B15
A26-B20
A31-B25
A41-B35
(
A11
B5
A16
B10
A21
B15
A26
B20
A31
B25
A41
B35
)
62
215.9
A11-B22
A19-B30
A30-B41
A36-B47
A41-B52
A46-B57
(
A11
B22
A19
B30
A30
B41
A36
B47
A41
B52
A46
B57
)
64
213.3
A1-B4
A6-B9
A12-B15
A17-B20
A45-B48
A54-B57
(
A1
B4
A6
B9
A12
B15
A17
B20
A45
B48
A54
B57
)
68
196.1
A29-B3
A36-B10
A41-B15
A46-B20
A56-B30
(
A29
B3
A36
B10
A41
B15
A46
B20
A56
B30
)
69
192.1
A23-B10
A28-B15
A37-B24
A42-B29
A55-B42
(
A23
B10
A28
B15
A37
B24
A42
B29
A55
B42
)
70
191.1
A5-B23
A15-B33
A20-B38
A30-B48
A36-B54
(
A5
B23
A15
B33
A20
B38
A30
B48
A36
B54
)
71
190.8
A7-B22
A20-B35
A25-B40
A30-B45
A39-B54
(
A7
B22
A20
B35
A25
B40
A30
B45
A39
B54
)
72
190.1
A23-B1
A32-B10
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A23
B1
A32
B10
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
74
186.8
A9-B14
A31-B36
A36-B41
A41-B46
A47-B52
(
A9
B14
A31
B36
A36
B41
A41
B46
A47
B52
)
75
182.8
A19-B8
A35-B24
A41-B30
A50-B39
A56-B45
(
A19
B8
A35
B24
A41
B30
A50
B39
A56
B45
)
76
182.4
A7-B25
A15-B33
A20-B38
A30-B48
A36-B54
(
A7
B25
A15
B33
A20
B38
A30
B48
A36
B54
)
78
178.2
A19-B3
A27-B11
A36-B20
A50-B34
A57-B41
(
A19
B3
A27
B11
A36
B20
A50
B34
A57
B41
)
79
177.7
A25-B3
A32-B10
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A25
B3
A32
B10
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
81
175.4
A3-B29
A9-B35
A18-B44
A25-B51
A30-B56
(
A3
B29
A9
B35
A18
B44
A25
B51
A30
B56
)
82
174.7
A23-B34
A30-B41
A36-B47
A41-B52
A46-B57
(
A23
B34
A30
B41
A36
B47
A41
B52
A46
B57
)
85
173.4
A9-B2
A14-B7
A26-B19
A46-B39
A51-B44
(
A9
B2
A14
B7
A26
B19
A46
B39
A51
B44
)
86
167
A7-B4
A14-B11
A25-B22
A45-B42
A57-B54
(
A7
B4
A14
B11
A25
B22
A45
B42
A57
B54
)
88
163.6
A5-B8
A10-B13
A17-B20
A45-B48
A54-B57
(
A5
B8
A10
B13
A17
B20
A45
B48
A54
B57
)
89
158.5
A27-B14
A37-B24
A42-B29
A55-B42
(
A27
B14
A37
B24
A42
B29
A55
B42
)
90
157.7
A21-B6
A38-B23
A45-B30
A53-B38
(
A21
B6
A38
B23
A45
B30
A53
B38
)
91
156.9
A25-B12
A37-B24
A42-B29
A55-B42
(
A25
B12
A37
B24
A42
B29
A55
B42
)
93
156.1
A23-B8
A38-B23
A45-B30
A53-B38
(
A23
B8
A38
B23
A45
B30
A53
B38
)
94
153.2
A3-B20
A19-B36
A29-B46
A39-B56
(
A3
B20
A19
B36
A29
B46
A39
B56
)
95
151.5
A33-B11
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A33
B11
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
96
150.4
A13-B26
A24-B37
A31-B44
A42-B55
(
A13
B26
A24
B37
A31
B44
A42
B55
)
99
148
A31-B35
A37-B41
A43-B47
A53-B57
(
A31
B35
A37
B41
A43
B47
A53
B57
)
100
147.5
A15-B28
A24-B37
A31-B44
A42-B55
(
A15
B28
A24
B37
A31
B44
A42
B55
)
101
146.8
A7-B2
A14-B9
A28-B23
A35-B30
(
A7
B2
A14
B9
A28
B23
A35
B30
)
108
140.5
A31-B42
A36-B47
A41-B52
A46-B57
(
A31
B42
A36
B47
A41
B52
A46
B57
)
109
139.5
A15-B12
A25-B22
A45-B42
A57-B54
(
A15
B12
A25
B22
A45
B42
A57
B54
)
110
139.3
A23-B9
A30-B16
A45-B31
A53-B39
(
A23
B9
A30
B16
A45
B31
A53
B39
)
111
139.1
A41-B6
A46-B11
A51-B16
A57-B22
(
A41
B6
A46
B11
A51
B16
A57
B22
)
113
138.8
A1-B23
A8-B30
A15-B37
A30-B52
(
A1
B23
A8
B30
A15
B37
A30
B52
)
115
137.5
A25-B31
A35-B41
A40-B46
A51-B57
(
A25
B31
A35
B41
A40
B46
A51
B57
)
119
131.8
A3-B19
A9-B25
A18-B34
A35-B51
(
A3
B19
A9
B25
A18
B34
A35
B51
)
120
131.2
A1-B35
A7-B41
A17-B51
A22-B56
(
A1
B35
A7
B41
A17
B51
A22
B56
)
121
130.1
A5-B21
A11-B27
A18-B34
A35-B51
(
A5
B21
A11
B27
A18
B34
A35
B51
)
124
124.6
A37-B4
A43-B10
A50-B17
(
A37
B4
A43
B10
A50
B17
)
130
113.5
A7-B37
A15-B45
A23-B53
(
A7
B37
A15
B45
A23
B53
)
131
113.4
A37-B21
A50-B34
A57-B41
(
A37
B21
A50
B34
A57
B41
)
134
111.8
A35-B14
A40-B19
A49-B28
(
A35
B14
A40
B19
A49
B28
)
135
111.6
A35-B2
A43-B10
A50-B17
(
A35
B2
A43
B10
A50
B17
)
138
108.5
A1-B22
A11-B32
A26-B47
(
A1
B22
A11
B32
A26
B47
)
140
108.3
A3-B24
A11-B32
A26-B47
(
A3
B24
A11
B32
A26
B47
)
143
106.8
A11-B6
A28-B23
A35-B30
(
A11
B6
A28
B23
A35
B30
)
146
106.1
A7-B19
A12-B24
A39-B51
(
A7
B19
A12
B24
A39
B51
)
147
106.1
A29-B9
A38-B18
A50-B30
(
A29
B9
A38
B18
A50
B30
)
151
105
A27-B17
A37-B27
A45-B35
(
A27
B17
A37
B27
A45
B35
)
154
102.6
A39-B26
A45-B32
A55-B42
(
A39
B26
A45
B32
A55
B42
)
157
101.7
A3-B37
A17-B51
A22-B56
(
A3
B37
A17
B51
A22
B56
)
158
100.7
A3-B34
A8-B39
A21-B52
(
A3
B34
A8
B39
A21
B52
)
163
98.3
A19-B45
A25-B51
A30-B56
(
A19
B45
A25
B51
A30
B56
)
164
96.7
A29-B2
A46-B19
A52-B25
(
A29
B2
A46
B19
A52
B25
)
176
84.4
A37-B7
A43-B13
(
A37
B7
A43
B13
)
181
79.8
A35-B48
A42-B55
(
A35
B48
A42
B55
)
182
79.2
A45-B19
A56-B30
(
A45
B19
A56
B30
)
186
75.7
A45-B12
A50-B17
(
A45
B12
A50
B17
)
189
74.6
A27-B18
A39-B30
(
A27
B18
A39
B30
)
195
72.6
A17-B27
A38-B48
(
A17
B27
A38
B48
)
197
71.4
A33-B46
A42-B55
(
A33
B46
A42
B55
)
199
70.9
A1-B29
A13-B41
(
A1
B29
A13
B41
)
204
69.7
A35-B5
A41-B11
(
A35
B5
A41
B11
)
212
67.5
A25-B17
A40-B32
(
A25
B17
A40
B32
)
216
66.7
A31-B45
A40-B54
(
A31
B45
A40
B54
)
221
65.7
A39-B9
A44-B14
(
A39
B9
A44
B14
)
224
65.1
A31-B49
A36-B54
(
A31
B49
A36
B54
)
228
64.8
A39-B18
A49-B28
(
A39
B18
A49
B28
)
229
64.5
A7-B38
A21-B52
(
A7
B38
A21
B52
)
246
44.7
A5-B54
(
A5
B54
)
251
42.4
A45-B15
(
A45
B15
)
252
42.4
A57-B31
(
A57
B31
)
255
40.5
A37-B18
(
A37
B18
)
258
40
A57-B53
(
A57
B53
)
263
38.2
A7-B49
(
A7
B49
)
266
37.5
A39-B47
(
A39
B47
)
268
37.1
A21-B54
(
A21
B54
)
276
36.4
A41-B33
(
A41
B33
)
281
35.1
A25-B52
(
A25
B52
)
286
34.3
A21-B55
(
A21
B55
)
290
34.2
A5-B55
(
A5
B55
)
291
34.2
A21-B30
(
A21
B30
)
292
34.2
A43-B55
(
A43
B55
)
304
32.4
A7-B54
(
A7
B54
)
308
32.4
A39-B49
(
A39
B49
)
313
31.6
A23-B47
(
A23
B47
)
315
31.6
A57-B18
(
A57
B18
)
320
31.2
A45-B56
(
A45
B56
)