A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =30, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
242.9
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A37-B37
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A37
B37
)
2
237.9
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
A37-B37
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A37
B37
)
3
197.4
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A37-B37
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A37
B37
)
4
179.4
A3-B2
A8-B7
A13-B12
A18-B17
A23-B22
(
A3
B2
A8
B7
A13
B12
A18
B17
A23
B22
)
5
177.4
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A37-B37
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A37
B37
)
6
173.1
A9-B9
A14-B14
A19-B19
A37-B37
(
A9
B9
A14
B14
A19
B19
A37
B37
)
7
150.8
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
)
8
144.2
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A23-B22
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A23
B22
)
9
137
A7-B6
A13-B12
A18-B17
A23-B22
(
A7
B6
A13
B12
A18
B17
A23
B22
)
10
135
A15-B8
A29-B22
A38-B31
A46-B39
(
A15
B8
A29
B22
A38
B31
A46
B39
)
12
131.2
A13-B1
A18-B6
A35-B23
A52-B40
(
A13
B1
A18
B6
A35
B23
A52
B40
)
13
129.6
A1-B5
A8-B12
A19-B23
A35-B39
(
A1
B5
A8
B12
A19
B23
A35
B39
)
15
116.7
A5-B6
A10-B11
A15-B16
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
)
16
116.3
A7-B8
A12-B13
A17-B18
(
A7
B8
A12
B13
A17
B18
)
17
115.5
A9-B12
A19-B22
A33-B36
(
A9
B12
A19
B22
A33
B36
)
18
113.7
A21-B4
A38-B21
A47-B30
(
A21
B4
A38
B21
A47
B30
)
19
113
A3-B4
A8-B9
A13-B14
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
)
20
111.7
A9-B25
A16-B32
A23-B39
(
A9
B25
A16
B32
A23
B39
)
21
106.6
A11-B27
A16-B32
A23-B39
(
A11
B27
A16
B32
A23
B39
)
22
105.1
A11-B10
A16-B15
A23-B22
(
A11
B10
A16
B15
A23
B22
)
23
104.4
A9-B13
A19-B23
A35-B39
(
A9
B13
A19
B23
A35
B39
)
24
104.4
A11-B15
A19-B23
A35-B39
(
A11
B15
A19
B23
A35
B39
)
25
104.1
A13-B28
A18-B33
A24-B39
(
A13
B28
A18
B33
A24
B39
)
26
102.2
A5-B1
A22-B18
A28-B24
(
A5
B1
A22
B18
A28
B24
)
28
102.1
A5-B19
A15-B29
A21-B35
(
A5
B19
A15
B29
A21
B35
)
29
100.7
A19-B6
A25-B12
A52-B39
(
A19
B6
A25
B12
A52
B39
)
31
98.8
A9-B8
A14-B13
A23-B22
(
A9
B8
A14
B13
A23
B22
)
32
97.3
A15-B3
A35-B23
A52-B40
(
A15
B3
A35
B23
A52
B40
)
33
96.9
A39-B13
A44-B18
A54-B28
(
A39
B13
A44
B18
A54
B28
)
34
96.6
A43-B6
A48-B11
A53-B16
(
A43
B6
A48
B11
A53
B16
)
35
96.4
A9-B17
A25-B33
A31-B39
(
A9
B17
A25
B33
A31
B39
)
39
78.9
A5-B18
A18-B31
(
A5
B18
A18
B31
)
41
76.7
A9-B10
A14-B15
(
A9
B10
A14
B15
)
42
76.2
A15-B30
A24-B39
(
A15
B30
A24
B39
)
43
75.7
A13-B29
A23-B39
(
A13
B29
A23
B39
)
44
75.1
A21-B26
A35-B40
(
A21
B26
A35
B40
)
45
75
A47-B7
A52-B12
(
A47
B7
A52
B12
)
46
74.4
A31-B9
A38-B16
(
A31
B9
A38
B16
)
47
73.8
A23-B26
A33-B36
(
A23
B26
A33
B36
)
48
73.6
A49-B13
A54-B18
(
A49
B13
A54
B18
)
49
73.3
A49-B12
A54-B17
(
A49
B12
A54
B17
)
51
72
A7-B20
A18-B31
(
A7
B20
A18
B31
)
52
72
A9-B16
A22-B29
(
A9
B16
A22
B29
)
53
71.8
A21-B13
A47-B39
(
A21
B13
A47
B39
)
54
71.6
A3-B30
A10-B37
(
A3
B30
A10
B37
)
55
71.6
A39-B14
A53-B28
(
A39
B14
A53
B28
)
56
71.6
A41-B24
A47-B30
(
A41
B24
A47
B30
)
57
70.5
A1-B25
A7-B31
(
A1
B25
A7
B31
)
59
69.7
A23-B5
A50-B32
(
A23
B5
A50
B32
)
60
69.6
A19-B24
A35-B40
(
A19
B24
A35
B40
)
61
69.1
A23-B28
A35-B40
(
A23
B28
A35
B40
)
62
68.6
A17-B16
A23-B22
(
A17
B16
A23
B22
)
63
68.6
A47-B10
A52-B15
(
A47
B10
A52
B15
)
65
67.9
A37-B5
A53-B21
(
A37
B5
A53
B21
)
66
67.8
A39-B9
A52-B22
(
A39
B9
A52
B22
)
67
67.7
A17-B31
A22-B36
(
A17
B31
A22
B36
)
68
67.3
A23-B29
A34-B40
(
A23
B29
A34
B40
)
69
67.1
A21-B5
A37-B21
(
A21
B5
A37
B21
)
70
66.7
A19-B13
A28-B22
(
A19
B13
A28
B22
)
71
66.7
A33-B18
A38-B23
(
A33
B18
A38
B23
)
72
66.3
A17-B32
A24-B39
(
A17
B32
A24
B39
)
73
66.1
A23-B10
A52-B39
(
A23
B10
A52
B39
)
76
65.6
A33-B6
A45-B18
(
A33
B6
A45
B18
)
77
65.6
A49-B18
A54-B23
(
A49
B18
A54
B23
)
78
65.5
A3-B16
A18-B31
(
A3
B16
A18
B31
)
79
65
A31-B16
A36-B21
(
A31
B16
A36
B21
)
82
61.7
A45-B19
A54-B28
(
A45
B19
A54
B28
)
83
61.5
A27-B17
A46-B36
(
A27
B17
A46
B36
)
84
48.2
A35-B7
(
A35
B7
)
86
45.3
A39-B23
(
A39
B23
)
87
42.9
A3-B26
(
A3
B26
)
88
42.9
A49-B40
(
A49
B40
)
89
41.8
A1-B24
(
A1
B24
)
90
41.8
A3-B29
(
A3
B29
)
92
41.7
A55-B12
(
A55
B12
)
93
41.4
A55-B30
(
A55
B30
)
94
40.7
A35-B38
(
A35
B38
)
98
40
A25-B35
(
A25
B35
)
99
40
A35-B32
(
A35
B32
)
100
40
A51-B11
(
A51
B11
)
101
39.6
A15-B4
(
A15
B4
)
104
39.3
A53-B4
(
A53
B4
)
105
39
A35-B6
(
A35
B6
)
107
38.7
A3-B32
(
A3
B32
)
108
38.3
A5-B17
(
A5
B17
)
109
38.2
A53-B13
(
A53
B13
)
110
38.2
A55-B18
(
A55
B18
)
111
37.7
A41-B20
(
A41
B20
)
112
37.5
A11-B38
(
A11
B38
)
113
37.3
A1-B38
(
A1
B38
)
114
37.3
A3-B40
(
A3
B40
)
115
37.3
A19-B38
(
A19
B38
)
116
36.8
A19-B40
(
A19
B40
)
118
36.7
A39-B24
(
A39
B24
)
119
36.2
A15-B35
(
A15
B35
)
121
35.6
A53-B3
(
A53
B3
)
123
35
A5-B37
(
A5
B37
)
124
34.9
A43-B22
(
A43
B22
)
126
34.5
A53-B17
(
A53
B17
)
127
34.4
A21-B40
(
A21
B40
)
128
33.9
A31-B17
(
A31
B17
)
129
33.3
A9-B4
(
A9
B4
)
130
33.3
A17-B35
(
A17
B35
)
131
33.3
A17-B36
(
A17
B36
)
134
32.8
A11-B39
(
A11
B39
)
135
32.8
A49-B39
(
A49
B39
)
136
32.8
A51-B7
(
A51
B7
)
137
32.8
A53-B29
(
A53
B29
)
138
32.3
A39-B36
(
A39
B36
)
139
32.3
A51-B32
(
A51
B32
)
141
32.3
A55-B19
(
A55
B19
)
142
32.2
A45-B6
(
A45
B6
)
143
32.2
A53-B10
(
A53
B10
)
144
31.9
A5-B16
(
A5
B16
)
145
31.7
A3-B33
(
A3
B33
)
146
31.7
A9-B33
(
A9
B33
)
147
31.7
A11-B28
(
A11
B28
)
149
31.6
A29-B37
(
A29
B37
)
150
31.6
A51-B15
(
A51
B15
)
152
31.2
A5-B35
(
A5
B35
)
153
31.2
A51-B20
(
A51
B20
)
154
31.1
A13-B33
(
A13
B33
)
157
30.9
A23-B32
(
A23
B32
)
158
30.8
A5-B30
(
A5
B30
)
159
30.8
A5-B31
(
A5
B31
)
160
30.8
A55-B10
(
A55
B10
)
161
30.6
A1-B23
(
A1
B23
)
162
30.6
A53-B9
(
A53
B9
)
163
30.6
A55-B29
(
A55
B29
)
164
30.5
A51-B5
(
A51
B5
)
165
30.3
A3-B36
(
A3
B36
)
166
30.3
A55-B25
(
A55
B25
)
167
30.2
A51-B31
(
A51
B31
)
168
30.2
A53-B35
(
A53
B35
)