A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =25, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
46.7
A37-B34
(
A37
B34
)
2
46.0
A45-B12
A50-B17
(
A45
B12
A50
B17
)
3
45.0
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A34-B34
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A34
B34
)
4
44.2
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A34-B34
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A34
B34
)
5
43.8
A55-B30
(
A55
B30
)
6
41.9
A7-B20
(
A7
B20
)
7
41.7
A11-B11
A16-B16
A34-B34
(
A11
B11
A16
B16
A34
B34
)
8
41.5
A3-B3
A9-B9
A14-B14
A19-B19
A34-B34
(
A3
B3
A9
B9
A14
B14
A19
B19
A34
B34
)
9
41.5
A41-B20
A54-B33
(
A41
B20
A54
B33
)
10
40.6
A5-B18
(
A5
B18
)
11
40.5
A17-B17
A34-B34
(
A17
B17
A34
B34
)
12
40.5
A17-B18
(
A17
B18
)
13
39.8
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A34-B34
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A34
B34
)
14
38.7
A13-B40
(
A13
B40
)
15
38.7
A19-B38
(
A19
B38
)
16
38.7
A47-B40
(
A47
B40
)
17
38.2
A5-B36
(
A5
B36
)
18
37.5
A43-B39
(
A43
B39
)
19
37.4
A9-B9
A14-B14
A19-B19
A34-B34
(
A9
B9
A14
B14
A19
B19
A34
B34
)
20
37.3
A29-B22
A46-B39
(
A29
B22
A46
B39
)
21
37.1
A13-B13
A18-B18
A34-B34
(
A13
B13
A18
B18
A34
B34
)
22
36.4
A23-B6
(
A23
B6
)
23
36.0
A31-B11
A41-B21
(
A31
B11
A41
B21
)
24
35.5
A21-B38
(
A21
B38
)
25
35.4
A21-B26
A33-B38
(
A21
B26
A33
B38
)
26
35.4
A31-B27
A43-B39
(
A31
B27
A43
B39
)
27
35.3
A5-B41
(
A5
B41
)
28
35.1
A27-B35
A32-B40
(
A27
B35
A32
B40
)
29
35.1
A15-B16
(
A15
B16
)
30
34.7
A7-B12
A20-B25
A33-B38
(
A7
B12
A20
B25
A33
B38
)
31
34.5
A15-B15
A34-B34
(
A15
B15
A34
B34
)
32
34.4
A3-B30
A8-B35
A13-B40
(
A3
B30
A8
B35
A13
B40
)
33
33.5
A27-B23
A43-B39
(
A27
B23
A43
B39
)
34
33.5
A49-B12
A54-B17
(
A49
B12
A54
B17
)
35
33.3
A5-B37
(
A5
B37
)
36
33.3
A27-B37
(
A27
B37
)
37
33.3
A33-B38
(
A33
B38
)
38
33.3
A41-B21
(
A41
B21
)
39
33.3
A55-B6
(
A55
B6
)
40
33.1
A15-B30
A25-B40
(
A15
B30
A25
B40
)
41
33.0
A35-B7
A53-B25
(
A35
B7
A53
B25
)
42
32.7
A31-B9
A38-B16
A46-B24
A54-B32
(
A31
B9
A38
B16
A46
B24
A54
B32
)
43
32.5
A5-B32
A13-B40
(
A5
B32
A13
B40
)
44
32.4
A1-B8
A10-B17
A24-B31
(
A1
B8
A10
B17
A24
B31
)
45
32.4
A11-B14
(
A11
B14
)
46
32.4
A13-B14
A18-B19
(
A13
B14
A18
B19
)
47
32.4
A25-B32
(
A25
B32
)
48
32.3
A15-B26
(
A15
B26
)
49
32.3
A17-B32
A25-B40
(
A17
B32
A25
B40
)
50
32.2
A17-B31
A22-B36
(
A17
B31
A22
B36
)
51
32.1
A27-B14
A52-B39
(
A27
B14
A52
B39
)
52
31.9
A11-B18
A24-B31
(
A11
B18
A24
B31
)
53
31.9
A31-B16
A36-B21
(
A31
B16
A36
B21
)
54
31.9
A39-B13
A46-B20
A55-B29
(
A39
B13
A46
B20
A55
B29
)
55
31.8
A51-B5
A57-B11
(
A51
B5
A57
B11
)
56
31.4
A1-B7
A14-B20
A23-B29
A32-B38
(
A1
B7
A14
B20
A23
B29
A32
B38
)
57
31.4
A5-B35
(
A5
B35
)
58
31.4
A33-B19
(
A33
B19
)
59
31.4
A51-B14
(
A51
B14
)
60
31.4
A53-B3
(
A53
B3
)
61
31.4
A53-B4
(
A53
B4
)
62
31.4
A5-B6
A13-B14
A18-B19
(
A5
B6
A13
B14
A18
B19
)
63
31.2
A53-B28
(
A53
B28
)
64
31.2
A57-B11
(
A57
B11
)
65
30.9
A41-B18
A46-B23
(
A41
B18
A46
B23
)
66
30.9
A15-B24
A22-B31
A27-B36
(
A15
B24
A22
B31
A27
B36
)
67
30.8
A27-B20
A46-B39
(
A27
B20
A46
B39
)
68
30.8
A37-B16
A45-B24
A54-B33
(
A37
B16
A45
B24
A54
B33
)
69
30.6
A15-B35
(
A15
B35
)
70
30.4
A41-B1
A54-B14
(
A41
B1
A54
B14
)
71
30.4
A45-B24
A54-B33
(
A45
B24
A54
B33
)
72
30.3
A9-B13
A14-B18
A21-B25
(
A9
B13
A14
B18
A21
B25
)
73
30.3
A25-B39
(
A25
B39
)
74
30.3
A55-B18
(
A55
B18
)
75
30.3
A41-B29
A52-B40
(
A41
B29
A52
B40
)
76
30.3
A19-B10
A27-B18
A50-B41
(
A19
B10
A27
B18
A50
B41
)
77
30.0
A21-B2
A57-B38
(
A21
B2
A57
B38
)
78
30.0
A37-B8
A44-B15
(
A37
B8
A44
B15
)
79
29.9
A3-B2
A10-B9
A17-B16
A24-B23
A31-B30
(
A3
B2
A10
B9
A17
B16
A24
B23
A31
B30
)
80
29.9
A5-B4
A10-B9
A17-B16
A24-B23
A31-B30
(
A5
B4
A10
B9
A17
B16
A24
B23
A31
B30
)
81
29.9
A9-B10
A14-B15
(
A9
B10
A14
B15
)
82
29.8
A35-B12
A40-B17
A46-B23
(
A35
B12
A40
B17
A46
B23
)
83
29.7
A1-B2
A9-B10
A14-B15
(
A1
B2
A9
B10
A14
B15
)
84
29.7
A3-B4
A9-B10
A14-B15
(
A3
B4
A9
B10
A14
B15
)
85
29.5
A23-B29
A32-B38
(
A23
B29
A32
B38
)
86
29.4
A29-B23
(
A29
B23
)
87
29.4
A51-B42
(
A51
B42
)
88
29.4
A55-B5
(
A55
B5
)
89
29.4
A55-B11
(
A55
B11
)
90
29.4
A37-B1
A49-B13
A54-B18
(
A37
B1
A49
B13
A54
B18
)
91
29.4
A11-B15
A21-B25
(
A11
B15
A21
B25
)
92
29.3
A35-B11
A54-B30
(
A35
B11
A54
B30
)
93
29.2
A49-B13
A54-B18
(
A49
B13
A54
B18
)
94
29.0
A57-B27
(
A57
B27
)
95
28.9
A55-B31
(
A55
B31
)
96
28.8
A5-B25
A10-B30
A15-B35
(
A5
B25
A10
B30
A15
B35
)
97
28.8
A45-B15
A57-B27
(
A45
B15
A57
B27
)
98
28.8
A13-B17
A21-B25
(
A13
B17
A21
B25
)
99
28.8
A15-B19
A21-B25
(
A15
B19
A21
B25
)
100
28.8
A27-B18
A50-B41
(
A27
B18
A50
B41
)
101
28.7
A17-B16
A24-B23
A31-B30
(
A17
B16
A24
B23
A31
B30
)
102
28.6
A15-B3
A26-B14
A41-B29
A52-B40
(
A15
B3
A26
B14
A41
B29
A52
B40
)
103
28.6
A15-B4
A47-B36
(
A15
B4
A47
B36
)
104
28.6
A19-B21
A24-B26
A35-B37
(
A19
B21
A24
B26
A35
B37
)
105
28.6
A29-B3
A38-B12
A46-B20
A55-B29
(
A29
B3
A38
B12
A46
B20
A55
B29
)
106
28.6
A37-B9
A53-B25
(
A37
B9
A53
B25
)
107
28.6
A53-B25
(
A53
B25
)
108
28.4
A5-B31
A13-B39
(
A5
B31
A13
B39
)
109
28.4
A35-B6
A44-B15
(
A35
B6
A44
B15
)
110
28.2
A9-B28
A16-B35
(
A9
B28
A16
B35
)
111
28.2
A31-B30
(
A31
B30
)
112
28.1
A39-B23
(
A39
B23
)
113
28.0
A7-B32
A15-B40
(
A7
B32
A15
B40
)
114
27.9
A7-B6
A17-B16
A24-B23
A31-B30
(
A7
B6
A17
B16
A24
B23
A31
B30
)
115
27.8
A53-B40
(
A53
B40
)
116
27.8
A55-B12
(
A55
B12
)
117
27.7
A5-B17
A23-B35
(
A5
B17
A23
B35
)
118
27.7
A7-B19
A23-B35
(
A7
B19
A23
B35
)
119
27.3
A45-B35
(
A45
B35
)
120
27.0
A27-B36
(
A27
B36
)
121
27.0
A29-B37
(
A29
B37
)
122
27.0
A47-B36
(
A47
B36
)
123
27.0
A55-B19
(
A55
B19
)
124
26.9
A19-B19
A34-B34
(
A19
B19
A34
B34
)
125
26.6
A41-B14
A47-B20
(
A41
B14
A47
B20
)
126
26.5
A23-B35
(
A23
B35
)
127
26.5
A3-B14
A13-B24
(
A3
B14
A13
B24
)
128
26.3
A21-B25
(
A21
B25
)
129
26.2
A55-B29
(
A55
B29
)
130
25.8
A47-B20
(
A47
B20
)
131
25.7
A3-B35
(
A3
B35
)
132
25.7
A15-B40
(
A15
B40
)
133
25.7
A25-B40
(
A25
B40
)
134
25.7
A33-B18
(
A33
B18
)
135
25.6
A13-B24
(
A13
B24
)
136
25.6
A13-B39
(
A13
B39
)
137
25.6
A23-B5
(
A23
B5
)
138
25.6
A35-B37
(
A35
B37
)
139
25.6
A47-B39
(
A47
B39
)
140
25.6
A57-B38
(
A57
B38
)