A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =35, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
15 535 A5-B4 A10-B9 A15-B14 A20-B19 A25-B24 A30-B29 A35-B34 A40-B39 A45-B44 A50-B49 A55-B54 ( A5 B4 A10 B9 A15 B14 A20 B19 A25 B24 A30 B29 A35 B34 A40 B39 A45 B44 A50 B49 A55 B54 )
18 514.7 A7-B6 A12-B11 A17-B16 A22-B21 A27-B26 A32-B31 A37-B36 A42-B41 A47-B46 A52-B51 A57-B56 ( A7 B6 A12 B11 A17 B16 A22 B21 A27 B26 A32 B31 A37 B36 A42 B41 A47 B46 A52 B51 A57 B56 )
20 501 A5-B6 A10-B11 A15-B16 A20-B21 A25-B26 A30-B31 A35-B36 A40-B41 A45-B46 A50-B51 A55-B56 ( A5 B6 A10 B11 A15 B16 A20 B21 A25 B26 A30 B31 A35 B36 A40 B41 A45 B46 A50 B51 A55 B56 )
22 496 A3-B4 A8-B9 A13-B14 A18-B19 A23-B24 A28-B29 A33-B34 A39-B40 A44-B45 A49-B50 A54-B55 ( A3 B4 A8 B9 A13 B14 A18 B19 A23 B24 A28 B29 A33 B34 A39 B40 A44 B45 A49 B50 A54 B55 )
66 165.8 A41-B42 A46-B47 A51-B52 A56-B57 ( A41 B42 A46 B47 A51 B52 A56 B57 )
72 110.5 A3-B14 A32-B43 A46-B57 ( A3 B14 A32 B43 A46 B57 )
79 85.2 A45-B30 A53-B38 ( A45 B30 A53 B38 )
84 76.9 A47-B43 A57-B53 ( A47 B43 A57 B53 )
92 45.2 A35-B14 ( A35 B14 )
96 43.3 A27-B14 ( A27 B14 )
97 42.4 A45-B15 ( A45 B15 )
103 38.7 A21-B15 ( A21 B15 )
104 38.7 A39-B17 ( A39 B17 )
107 37.5 A43-B13 ( A43 B13 )
111 36.4 A7-B19 ( A7 B19 )
112 36.4 A41-B11 ( A41 B11 )