A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =30, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
198.5
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
)
2
153.8
A3-B3
A9-B9
A14-B14
(
A3
B3
A9
B9
A14
B14
)
3
150.5
A5-B5
A10-B10
A15-B15
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
)
4
132.6
A7-B7
A12-B12
A17-B17
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
)
5
130.7
A31-B9
A38-B16
A46-B24
A54-B32
(
A31
B9
A38
B16
A46
B24
A54
B32
)
6
104.2
A1-B7
A14-B20
A24-B30
(
A1
B7
A14
B20
A24
B30
)
7
104.1
A7-B12
A20-B25
A33-B38
(
A7
B12
A20
B25
A33
B38
)
8
100.3
A1-B8
A10-B17
A25-B32
(
A1
B8
A10
B17
A25
B32
)
10
95.8
A3-B2
A18-B17
A24-B23
(
A3
B2
A18
B17
A24
B23
)
11
95.8
A5-B4
A18-B17
A24-B23
(
A5
B4
A18
B17
A24
B23
)
13
91.9
A45-B12
A50-B17
(
A45
B12
A50
B17
)
14
84.9
A13-B13
A18-B18
(
A13
B13
A18
B18
)
15
83.9
A29-B22
A47-B40
(
A29
B22
A47
B40
)
16
83
A41-B20
A54-B33
(
A41
B20
A54
B33
)
17
76.2
A3-B30
A13-B40
(
A3
B30
A13
B40
)
18
72
A31-B11
A41-B21
(
A31
B11
A41
B21
)
19
71
A27-B20
A47-B40
(
A27
B20
A47
B40
)
20
70.8
A21-B26
A33-B38
(
A21
B26
A33
B38
)
21
70.8
A31-B27
A43-B39
(
A31
B27
A43
B39
)
22
70.3
A27-B35
A32-B40
(
A27
B35
A32
B40
)
23
66.8
A11-B18
A25-B32
(
A11
B18
A25
B32
)
24
65.8
A15-B24
A22-B31
(
A15
B24
A22
B31
)
25
64.7
A9-B13
A14-B18
(
A9
B13
A14
B18
)
26
64.5
A17-B31
A22-B36
(
A17
B31
A22
B36
)
27
63.6
A35-B12
A46-B23
(
A35
B12
A46
B23
)
28
63.5
A51-B5
A57-B11
(
A51
B5
A57
B11
)
29
63
A37-B16
A54-B33
(
A37
B16
A54
B33
)
31
46.7
A37-B34
(
A37
B34
)
32
43.8
A55-B30
(
A55
B30
)
34
41.9
A7-B20
(
A7
B20
)
35
40.6
A5-B18
(
A5
B18
)
36
40.6
A15-B30
(
A15
B30
)
37
40.5
A17-B18
(
A17
B18
)
38
40
A39-B13
(
A39
B13
)
39
38.9
A17-B32
(
A17
B32
)
41
38.7
A19-B38
(
A19
B38
)
43
38.2
A5-B36
(
A5
B36
)
44
37.5
A35-B7
(
A35
B7
)
46
36.4
A23-B6
(
A23
B6
)
47
36.4
A27-B14
(
A27
B14
)
48
35.5
A21-B38
(
A21
B38
)
49
35.3
A5-B41
(
A5
B41
)
50
35.1
A13-B14
(
A13
B14
)
51
35.1
A15-B16
(
A15
B16
)
52
34.4
A21-B2
(
A21
B2
)
53
33.3
A5-B37
(
A5
B37
)
54
33.3
A19-B10
(
A19
B10
)
55
33.3
A27-B37
(
A27
B37
)
58
33.3
A55-B6
(
A55
B6
)
59
32.4
A11-B14
(
A11
B14
)
60
32.4
A11-B15
(
A11
B15
)
62
32.3
A15-B26
(
A15
B26
)
63
31.4
A5-B35
(
A5
B35
)
64
31.4
A33-B19
(
A33
B19
)
65
31.4
A37-B8
(
A37
B8
)
66
31.4
A49-B13
(
A49
B13
)
67
31.4
A51-B14
(
A51
B14
)
68
31.4
A53-B3
(
A53
B3
)
69
31.4
A53-B4
(
A53
B4
)
70
31.2
A5-B31
(
A5
B31
)
71
31.2
A13-B17
(
A13
B17
)
72
31.2
A15-B19
(
A15
B19
)
73
31.2
A53-B28
(
A53
B28
)
75
30.6
A15-B35
(
A15
B35
)
76
30.3
A7-B32
(
A7
B32
)
77
30.3
A15-B4
(
A15
B4
)
78
30.3
A25-B39
(
A25
B39
)
79
30.3
A55-B18
(
A55
B18
)