A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =35, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
49.4
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A37-B37
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A37
B37
)
2
48.6
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A37-B37
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A37
B37
)
3
47.6
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
A37-B37
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A37
B37
)
4
46.8
A15-B15
A37-B37
(
A15
B15
A37
B37
)
5
46.6
A9-B9
A14-B14
A37-B37
(
A9
B9
A14
B14
A37
B37
)
6
46.2
A5-B18
(
A5
B18
)
7
45.6
A15-B16
(
A15
B16
)
8
44.4
A11-B11
A16-B16
A37-B37
(
A11
B11
A16
B16
A37
B37
)
9
44.4
A40-B24
(
A40
B24
)
10
44.4
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A37-B37
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A37
B37
)
11
43.6
A34-B6
(
A34
B6
)
12
42.9
A3-B26
(
A3
B26
)
13
42.7
A13-B13
A18-B18
A37-B37
(
A13
B13
A18
B18
A37
B37
)
14
41.8
A1-B24
(
A1
B24
)
15
41.8
A3-B29
(
A3
B29
)
16
41.8
A23-B39
(
A23
B39
)
17
41.4
A36-B39
(
A36
B39
)
18
41.2
A48-B15
(
A48
B15
)
19
41.1
A9-B16
(
A9
B16
)
20
41.1
A48-B39
(
A48
B39
)
21
41.1
A19-B22
A33-B36
(
A19
B22
A33
B36
)
22
40.7
A9-B25
A23-B39
(
A9
B25
A23
B39
)
23
40.7
A21-B4
A47-B30
(
A21
B4
A47
B30
)
24
40.4
A13-B14
(
A13
B14
)
25
40.4
A38-B16
(
A38
B16
)
26
40.4
A38-B22
(
A38
B22
)
27
40.3
A17-B18
(
A17
B18
)
28
40.0
A25-B35
(
A25
B35
)
29
40.0
A52-B21
(
A52
B21
)
30
39.7
A48-B31
(
A48
B31
)
31
39.6
A15-B4
(
A15
B4
)
32
39.6
A17-B17
A37-B37
(
A17
B17
A37
B37
)
33
39.3
A7-B20
(
A7
B20
)
34
39.3
A46-B39
(
A46
B39
)
35
39.3
A54-B10
(
A54
B10
)
36
38.9
A1-B2
A7-B8
A12-B13
A17-B18
(
A1
B2
A7
B8
A12
B13
A17
B18
)
37
38.8
A28-B6
A38-B16
(
A28
B6
A38
B16
)
38
38.8
A3-B4
A12-B13
A17-B18
(
A3
B4
A12
B13
A17
B18
)
39
38.8
A7-B8
A12-B13
A17-B18
(
A7
B8
A12
B13
A17
B18
)
40
38.7
A3-B32
(
A3
B32
)
41
38.6
A9-B13
(
A9
B13
)
42
38.6
A11-B15
(
A11
B15
)
43
38.6
A38-B6
(
A38
B6
)
44
38.4
A3-B30
A11-B38
(
A3
B30
A11
B38
)
45
38.3
A5-B17
(
A5
B17
)
46
38.2
A21-B5
A38-B22
(
A21
B5
A38
B22
)
47
38.1
A15-B30
A24-B39
(
A15
B30
A24
B39
)
48
37.9
A54-B4
(
A54
B4
)
49
37.7
A3-B2
A8-B7
A16-B15
A23-B22
(
A3
B2
A8
B7
A16
B15
A23
B22
)
50
37.7
A1-B25
(
A1
B25
)
51
37.7
A5-B6
A12-B13
A17-B18
(
A5
B6
A12
B13
A17
B18
)
52
37.7
A52-B12
(
A52
B12
)
53
37.5
A21-B26
A35-B40
(
A21
B26
A35
B40
)
54
37.5
A11-B38
(
A11
B38
)
55
37.3
A1-B38
(
A1
B38
)
56
37.3
A3-B40
(
A3
B40
)
57
37.3
A19-B38
(
A19
B38
)
58
37.3
A50-B13
A55-B18
(
A50
B13
A55
B18
)
59
37.0
A54-B14
(
A54
B14
)
60
36.9
A5-B4
A16-B15
A23-B22
(
A5
B4
A16
B15
A23
B22
)
61
36.9
A40-B20
(
A40
B20
)
62
36.8
A19-B40
(
A19
B40
)
63
36.8
A50-B4
(
A50
B4
)
64
36.8
A54-B18
(
A54
B18
)
65
36.8
A54-B29
(
A54
B29
)
66
36.7
A15-B29
(
A15
B29
)
67
36.5
A32-B17
A39-B24
(
A32
B17
A39
B24
)
68
36.5
A38-B12
(
A38
B12
)
69
36.4
A23-B5
(
A23
B5
)
70
36.4
A34-B40
(
A34
B40
)
71
36.4
A52-B15
(
A52
B15
)
72
36.2
A15-B35
(
A15
B35
)
73
36.2
A7-B6
A16-B15
A23-B22
(
A7
B6
A16
B15
A23
B22
)
74
35.9
A21-B13
A47-B39
(
A21
B13
A47
B39
)
75
35.7
A46-B4
(
A46
B4
)
76
35.7
A13-B28
A24-B39
(
A13
B28
A24
B39
)
77
35.6
A17-B31
(
A17
B31
)
78
35.3
A23-B22
(
A23
B22
)
79
35.1
A19-B6
(
A19
B6
)
80
35.1
A30-B16
(
A30
B16
)
81
35.1
A34-B10
(
A34
B10
)
82
35.1
A52-B16
(
A52
B16
)
83
35.1
A54-B17
(
A54
B17
)