A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =30, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
1 242.9 A1-B1 A6-B6 A11-B11 A16-B16 A37-B37 ( A1 B1 A6 B6 A11 B11 A16 B16 A37 B37 )
2 237.9 A3-B3 A8-B8 A13-B13 A18-B18 A37-B37 ( A3 B3 A8 B8 A13 B13 A18 B18 A37 B37 )
3 197.4 A5-B5 A10-B10 A15-B15 A37-B37 ( A5 B5 A10 B10 A15 B15 A37 B37 )
4 179.4 A3-B2 A8-B7 A13-B12 A18-B17 A23-B22 ( A3 B2 A8 B7 A13 B12 A18 B17 A23 B22 )
5 177.4 A7-B7 A12-B12 A17-B17 A37-B37 ( A7 B7 A12 B12 A17 B17 A37 B37 )
7 150.8 A1-B2 A6-B7 A11-B12 A16-B17 ( A1 B2 A6 B7 A11 B12 A16 B17 )
9 137 A7-B6 A13-B12 A18-B17 A23-B22 ( A7 B6 A13 B12 A18 B17 A23 B22 )
13 129.6 A1-B5 A8-B12 A19-B23 A35-B39 ( A1 B5 A8 B12 A19 B23 A35 B39 )
15 116.7 A5-B6 A10-B11 A15-B16 ( A5 B6 A10 B11 A15 B16 )
16 116.3 A7-B8 A12-B13 A17-B18 ( A7 B8 A12 B13 A17 B18 )
19 113 A3-B4 A8-B9 A13-B14 ( A3 B4 A8 B9 A13 B14 )
26 102.2 A5-B1 A22-B18 A28-B24 ( A5 B1 A22 B18 A28 B24 )
28 102.1 A5-B19 A15-B29 A21-B35 ( A5 B19 A15 B29 A21 B35 )
29 100.7 A19-B6 A25-B12 A52-B39 ( A19 B6 A25 B12 A52 B39 )
33 96.9 A39-B13 A44-B18 A54-B28 ( A39 B13 A44 B18 A54 B28 )
34 96.6 A43-B6 A48-B11 A53-B16 ( A43 B6 A48 B11 A53 B16 )
39 78.9 A5-B18 A18-B31 ( A5 B18 A18 B31 )
46 74.4 A31-B9 A38-B16 ( A31 B9 A38 B16 )
51 72 A7-B20 A18-B31 ( A7 B20 A18 B31 )
53 71.8 A21-B13 A47-B39 ( A21 B13 A47 B39 )
55 71.6 A39-B14 A53-B28 ( A39 B14 A53 B28 )
59 69.7 A23-B5 A50-B32 ( A23 B5 A50 B32 )
65 67.9 A37-B5 A53-B21 ( A37 B5 A53 B21 )
66 67.8 A39-B9 A52-B22 ( A39 B9 A52 B22 )
69 67.1 A21-B5 A37-B21 ( A21 B5 A37 B21 )
73 66.1 A23-B10 A52-B39 ( A23 B10 A52 B39 )
78 65.5 A3-B16 A18-B31 ( A3 B16 A18 B31 )
84 48.2 A35-B7 ( A35 B7 )
105 39 A35-B6 ( A35 B6 )
108 38.3 A5-B17 ( A5 B17 )
111 37.7 A41-B20 ( A41 B20 )
144 31.9 A5-B16 ( A5 B16 )