A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =35, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
15
540
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
16
531.2
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
18
516.2
A7-B6
A12-B11
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
21
501
A5-B6
A10-B11
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
22
496
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
62
200.7
A19-B3
A27-B11
A37-B21
A52-B36
A57-B41
(
A19
B3
A27
B11
A37
B21
A52
B36
A57
B41
)
64
195.3
A23-B1
A33-B11
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A23
B1
A33
B11
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
65
194.3
A3-B14
A8-B19
A19-B30
A32-B43
A46-B57
(
A3
B14
A8
B19
A19
B30
A32
B43
A46
B57
)
66
193
A23-B10
A28-B15
A37-B24
A45-B32
A55-B42
(
A23
B10
A28
B15
A37
B24
A45
B32
A55
B42
)
67
188.5
A11-B5
A16-B10
A21-B15
A26-B20
A31-B25
(
A11
B5
A16
B10
A21
B15
A26
B20
A31
B25
)
73
160
A7-B22
A25-B40
A30-B45
A39-B54
(
A7
B22
A25
B40
A30
B45
A39
B54
)
74
159.4
A27-B14
A37-B24
A45-B32
A55-B42
(
A27
B14
A37
B24
A45
B32
A55
B42
)
75
157.8
A25-B12
A37-B24
A45-B32
A55-B42
(
A25
B12
A37
B24
A45
B32
A55
B42
)
78
152.4
A9-B14
A31-B36
A36-B41
A41-B46
(
A9
B14
A31
B36
A36
B41
A41
B46
)
89
124.1
A39-B22
A46-B29
A56-B39
(
A39
B22
A46
B29
A56
B39
)
93
120.8
A3-B20
A19-B36
A39-B56
(
A3
B20
A19
B36
A39
B56
)
100
113.4
A3-B29
A18-B44
A30-B56
(
A3
B29
A18
B44
A30
B56
)
111
87.1
A45-B30
A53-B38
(
A45
B30
A53
B38
)
114
84.4
A37-B7
A43-B13
(
A37
B7
A43
B13
)
120
82.4
A7-B19
A42-B54
(
A7
B19
A42
B54
)
123
81.3
A35-B14
A51-B30
(
A35
B14
A51
B30
)
126
80.6
A3-B19
A36-B52
(
A3
B19
A36
B52
)
129
79.5
A45-B12
A51-B18
(
A45
B12
A51
B18
)
130
79.2
A45-B19
A56-B30
(
A45
B19
A56
B30
)
131
78.9
A5-B21
A36-B52
(
A5
B21
A36
B52
)
134
76.5
A35-B41
A42-B48
(
A35
B41
A42
B48
)
143
72.8
A33-B41
A39-B47
(
A33
B41
A39
B47
)
145
71.9
A29-B9
A50-B30
(
A29
B9
A50
B30
)
153
45.5
A35-B48
(
A35
B48
)
155
44.7
A5-B54
(
A5
B54
)
162
43.2
A39-B30
(
A39
B30
)
164
42.4
A45-B15
(
A45
B15
)
165
42.4
A57-B31
(
A57
B31
)
169
40.5
A37-B18
(
A37
B18
)
172
40
A57-B53
(
A57
B53
)
176
38.5
A1-B29
(
A1
B29
)
179
38.2
A7-B49
(
A7
B49
)
182
38.2
A35-B30
(
A35
B30
)
186
37.1
A21-B54
(
A21
B54
)
195
36.4
A41-B11
(
A41
B11
)
196
36.4
A41-B33
(
A41
B33
)
203
35.1
A25-B52
(
A25
B52
)