A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =25, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
15
535
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
16
526.3
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
18
514.7
A7-B6
A12-B11
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
20
501
A5-B6
A10-B11
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
22
493.5
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
59
222.1
A3-B14
A8-B19
A13-B24
A23-B34
A31-B42
A37-B48
A45-B56
(
A3
B14
A8
B19
A13
B24
A23
B34
A31
B42
A37
B48
A45
B56
)
64
196.2
A9-B14
A19-B24
A30-B35
A36-B41
A41-B46
A48-B53
(
A9
B14
A19
B24
A30
B35
A36
B41
A41
B46
A48
B53
)
73
145.5
A25-B3
A32-B10
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A25
B3
A32
B10
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
77
137.5
A13-B10
A18-B15
A31-B28
A48-B45
A57-B54
(
A13
B10
A18
B15
A31
B28
A48
B45
A57
B54
)
80
125.3
A15-B12
A31-B28
A48-B45
A57-B54
(
A15
B12
A31
B28
A48
B45
A57
B54
)
81
124.8
A13-B17
A30-B34
A43-B47
A53-B57
(
A13
B17
A30
B34
A43
B47
A53
B57
)
83
122.8
A33-B11
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A33
B11
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
87
112
A37-B4
A42-B9
A50-B17
(
A37
B4
A42
B9
A50
B17
)
88
107.6
A19-B6
A26-B13
A42-B29
(
A19
B6
A26
B13
A42
B29
)
93
97.3
A23-B37
A31-B45
A39-B53
(
A23
B37
A31
B45
A39
B53
)
94
96.1
A31-B35
A43-B47
A53-B57
(
A31
B35
A43
B47
A53
B57
)
95
95
A11-B5
A21-B15
A41-B35
(
A11
B5
A21
B15
A41
B35
)
103
89.6
A7-B19
A29-B41
A39-B51
(
A7
B19
A29
B41
A39
B51
)
104
88.4
A3-B25
A10-B32
A30-B52
(
A3
B25
A10
B32
A30
B52
)
112
85.2
A45-B30
A53-B38
(
A45
B30
A53
B38
)
115
83.5
A31-B17
A36-B22
A45-B31
(
A31
B17
A36
B22
A45
B31
)
116
81.8
A39-B16
A45-B22
A54-B31
(
A39
B16
A45
B22
A54
B31
)
118
80.2
A43-B10
A50-B17
(
A43
B10
A50
B17
)
119
78.8
A5-B17
A29-B41
A39-B51
(
A5
B17
A29
B41
A39
B51
)
120
75.6
A27-B14
A42-B29
(
A27
B14
A42
B29
)
126
67.7
A45-B12
A50-B17
(
A45
B12
A50
B17
)
127
67.4
A7-B38
A21-B52
(
A7
B38
A21
B52
)
133
63.9
A45-B49
A53-B57
(
A45
B49
A53
B57
)
138
61.4
A39-B9
A44-B14
(
A39
B9
A44
B14
)
141
61.3
A39-B49
A47-B57
(
A39
B49
A47
B57
)
142
61.2
A45-B11
A54-B20
(
A45
B11
A54
B20
)
144
60.2
A41-B33
A47-B39
(
A41
B33
A47
B39
)
145
60
A25-B51
A30-B56
(
A25
B51
A30
B56
)
148
58.8
A33-B41
A39-B47
(
A33
B41
A39
B47
)
150
58.1
A23-B18
A34-B29
(
A23
B18
A34
B29
)
152
57.8
A37-B23
A45-B31
(
A37
B23
A45
B31
)
153
57.5
A35-B46
A45-B56
(
A35
B46
A45
B56
)
154
57.2
A39-B31
A45-B37
(
A39
B31
A45
B37
)
155
57.1
A13-B16
A45-B48
(
A13
B16
A45
B48
)
156
57.1
A15-B18
A45-B48
(
A15
B18
A45
B48
)
158
56.9
A1-B48
A7-B54
(
A1
B48
A7
B54
)
173
45.2
A35-B14
(
A35
B14
)
176
42.4
A45-B15
(
A45
B15
)
181
37.5
A43-B13
(
A43
B13
)
182
37.5
A57-B53
(
A57
B53
)
184
36.4
A41-B11
(
A41
B11
)
189
34.4
A57-B31
(
A57
B31
)
193
32.4
A35-B30
(
A35
B30
)
202
31.2
A57-B18
(
A57
B18
)
207
29.7
A9-B52
(
A9
B52
)
208
29.7
A39-B18
(
A39
B18
)
229
26.3
A5-B56
(
A5
B56
)
231
25.7
A21-B55
(
A21
B55
)
232
25.7
A27-B18
(
A27
B18
)