A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =25, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
1070
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A21-B21
A26-B26
A31-B31
A36-B36
A41-B41
A46-B46
A51-B51
A56-B56
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A21
B21
A26
B26
A31
B31
A36
B36
A41
B41
A46
B46
A51
B51
A56
B56
)
2
999.1
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A20-B20
A25-B25
A30-B30
A35-B35
A40-B40
A45-B45
A50-B50
A55-B55
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A20
B20
A25
B25
A30
B30
A35
B35
A40
B40
A45
B45
A50
B50
A55
B55
)
3
960.2
A3-B3
A8-B8
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A18-B18
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A28-B28
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A38-B38
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A53-B53
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A23
B23
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B28
A33
B33
A38
B38
A43
B43
A48
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A53
B53
)
4
960.1
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A17-B17
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A32-B32
A37-B37
A42-B42
A47-B47
A52-B52
A57-B57
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
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B22
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B27
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B32
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B37
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B42
A47
B47
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B52
A57
B57
)
5
899.3
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A14-B14
A19-B19
A24-B24
A29-B29
A34-B34
A39-B39
A44-B44
A49-B49
A54-B54
(
A9
B9
A14
B14
A19
B19
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B24
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B29
A34
B34
A39
B39
A44
B44
A49
B49
A54
B54
)
15
535
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
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B19
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B24
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A55
B54
)
16
526.3
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A51-B52
A56-B57
(
A1
B2
A6
B7
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B12
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B27
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B32
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B52
A56
B57
)
18
514.7
A7-B6
A12-B11
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
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A37
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A47
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A57
B56
)
19
503.2
A3-B2
A8-B7
A13-B12
A18-B17
A23-B22
A28-B27
A33-B32
A38-B37
A43-B42
A48-B47
A53-B52
(
A3
B2
A8
B7
A13
B12
A18
B17
A23
B22
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B27
A33
B32
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A43
B42
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A53
B52
)
20
501
A5-B6
A10-B11
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
22
493.5
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
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A48
B49
A53
B54
)
23
490
A11-B10
A16-B15
A21-B20
A26-B25
A31-B30
A36-B35
A41-B40
A46-B45
A51-B50
A56-B55
(
A11
B10
A16
B15
A21
B20
A26
B25
A31
B30
A36
B35
A41
B40
A46
B45
A51
B50
A56
B55
)
24
483.5
A9-B8
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A19-B18
A24-B23
A29-B28
A34-B33
A39-B38
A44-B43
A49-B48
A54-B53
(
A9
B8
A14
B13
A19
B18
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B23
A29
B28
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B33
A39
B38
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A49
B48
A54
B53
)
25
448.5
A9-B10
A14-B15
A19-B20
A24-B25
A29-B30
A34-B35
A39-B40
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A49-B50
A54-B55
(
A9
B10
A14
B15
A19
B20
A24
B25
A29
B30
A34
B35
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
30
420.1
A7-B8
A12-B13
A17-B18
A22-B23
A27-B28
A32-B33
A37-B38
A42-B43
A47-B48
A52-B53
(
A7
B8
A12
B13
A17
B18
A22
B23
A27
B28
A32
B33
A37
B38
A42
B43
A47
B48
A52
B53
)
59
222.1
A3-B14
A8-B19
A13-B24
A23-B34
A31-B42
A37-B48
A45-B56
(
A3
B14
A8
B19
A13
B24
A23
B34
A31
B42
A37
B48
A45
B56
)
64
196.2
A9-B14
A19-B24
A30-B35
A36-B41
A41-B46
A48-B53
(
A9
B14
A19
B24
A30
B35
A36
B41
A41
B46
A48
B53
)
73
145.5
A25-B3
A32-B10
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A25
B3
A32
B10
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
77
137.5
A13-B10
A18-B15
A31-B28
A48-B45
A57-B54
(
A13
B10
A18
B15
A31
B28
A48
B45
A57
B54
)
79
133
A31-B36
A36-B41
A41-B46
A48-B53
(
A31
B36
A36
B41
A41
B46
A48
B53
)
80
125.3
A15-B12
A31-B28
A48-B45
A57-B54
(
A15
B12
A31
B28
A48
B45
A57
B54
)
81
124.8
A13-B17
A30-B34
A43-B47
A53-B57
(
A13
B17
A30
B34
A43
B47
A53
B57
)
83
122.8
A33-B11
A39-B17
A45-B23
A51-B29
(
A33
B11
A39
B17
A45
B23
A51
B29
)
84
121.9
A1-B26
A10-B35
A21-B46
A31-B56
(
A1
B26
A10
B35
A21
B46
A31
B56
)
85
117.3
A1-B35
A7-B41
A13-B47
A19-B53
(
A1
B35
A7
B41
A13
B47
A19
B53
)
86
115
A17-B13
A34-B30
A46-B42
A56-B52
(
A17
B13
A34
B30
A46
B42
A56
B52
)
87
112
A37-B4
A42-B9
A50-B17
(
A37
B4
A42
B9
A50
B17
)
88
107.6
A19-B6
A26-B13
A42-B29
(
A19
B6
A26
B13
A42
B29
)
91
102.7
A19-B8
A34-B23
A57-B46
(
A19
B8
A34
B23
A57
B46
)
92
97.5
A7-B37
A14-B44
A19-B49
(
A7
B37
A14
B44
A19
B49
)
93
97.3
A23-B37
A31-B45
A39-B53
(
A23
B37
A31
B45
A39
B53
)
94
96.1
A31-B35
A43-B47
A53-B57
(
A31
B35
A43
B47
A53
B57
)
95
95
A11-B5
A21-B15
A41-B35
(
A11
B5
A21
B15
A41
B35
)
96
95
A39-B22
A45-B28
A53-B36
(
A39
B22
A45
B28
A53
B36
)
99
91.5
A35-B1
A44-B10
A54-B20
(
A35
B1
A44
B10
A54
B20
)
103
89.6
A7-B19
A29-B41
A39-B51
(
A7
B19
A29
B41
A39
B51
)
104
88.4
A3-B25
A10-B32
A30-B52
(
A3
B25
A10
B32
A30
B52
)
105
88
A13-B38
A21-B46
A31-B56
(
A13
B38
A21
B46
A31
B56
)
106
87.4
A37-B20
A45-B28
A53-B36
(
A37
B20
A45
B28
A53
B36
)
108
85.9
A19-B29
A36-B46
A47-B57
(
A19
B29
A36
B46
A47
B57
)
111
85.2
A33-B38
A40-B45
A48-B53
(
A33
B38
A40
B45
A48
B53
)
112
85.2
A45-B30
A53-B38
(
A45
B30
A53
B38
)
113
84
A9-B39
A14-B44
A19-B49
(
A9
B39
A14
B44
A19
B49
)
115
83.5
A31-B17
A36-B22
A45-B31
(
A31
B17
A36
B22
A45
B31
)
116
81.8
A39-B16
A45-B22
A54-B31
(
A39
B16
A45
B22
A54
B31
)
118
80.2
A43-B10
A50-B17
(
A43
B10
A50
B17
)
119
78.8
A5-B17
A29-B41
A39-B51
(
A5
B17
A29
B41
A39
B51
)
120
75.6
A27-B14
A42-B29
(
A27
B14
A42
B29
)
121
73.7
A13-B26
A23-B36
(
A13
B26
A23
B36
)
122
70.6
A47-B43
A56-B52
(
A47
B43
A56
B52
)
124
68.6
A35-B41
A40-B46
(
A35
B41
A40
B46
)
126
67.7
A45-B12
A50-B17
(
A45
B12
A50
B17
)
127
67.4
A7-B38
A21-B52
(
A7
B38
A21
B52
)
129
64.7
A11-B48
A16-B53
(
A11
B48
A16
B53
)
130
64.5
A49-B45
A56-B52
(
A49
B45
A56
B52
)
131
64.1
A39-B20
A49-B30
(
A39
B20
A49
B30
)
133
63.9
A45-B49
A53-B57
(
A45
B49
A53
B57
)
134
63
A13-B37
A22-B46
(
A13
B37
A22
B46
)
135
62.7
A11-B33
A30-B52
(
A11
B33
A30
B52
)
136
62.2
A1-B22
A11-B32
(
A1
B22
A11
B32
)
137
61.8
A39-B21
A47-B29
(
A39
B21
A47
B29
)
138
61.4
A39-B9
A44-B14
(
A39
B9
A44
B14
)
139
61.4
A51-B25
A56-B30
(
A51
B25
A56
B30
)
140
61.3
A35-B10
A46-B21
(
A35
B10
A46
B21
)
141
61.3
A39-B49
A47-B57
(
A39
B49
A47
B57
)
142
61.2
A45-B11
A54-B20
(
A45
B11
A54
B20
)
143
60.2
A17-B41
A22-B46
(
A17
B41
A22
B46
)
144
60.2
A41-B33
A47-B39
(
A41
B33
A47
B39
)
145
60
A25-B51
A30-B56
(
A25
B51
A30
B56
)
146
59.5
A1-B39
A15-B53
(
A1
B39
A15
B53
)
148
58.8
A33-B41
A39-B47
(
A33
B41
A39
B47
)
149
58.4
A3-B20
A22-B39
(
A3
B20
A22
B39
)
150
58.1
A23-B18
A34-B29
(
A23
B18
A34
B29
)
151
58
A1-B41
A10-B50
(
A1
B41
A10
B50
)
152
57.8
A37-B23
A45-B31
(
A37
B23
A45
B31
)
153
57.5
A35-B46
A45-B56
(
A35
B46
A45
B56
)
154
57.2
A39-B31
A45-B37
(
A39
B31
A45
B37
)
155
57.1
A13-B16
A45-B48
(
A13
B16
A45
B48
)
156
57.1
A15-B18
A45-B48
(
A15
B18
A45
B48
)
157
57
A15-B28
A23-B36
(
A15
B28
A23
B36
)
158
56.9
A1-B48
A7-B54
(
A1
B48
A7
B54
)
160
56.2
A17-B5
A35-B23
(
A17
B5
A35
B23
)
164
53.5
A17-B30
A23-B36
(
A17
B30
A23
B36
)
167
52.6
A11-B45
A19-B53
(
A11
B45
A19
B53
)
170
46.9
A17-B54
(
A17
B54
)
173
45.2
A35-B14
(
A35
B14
)
175
43.8
A53-B9
(
A53
B9
)
176
42.4
A45-B15
(
A45
B15
)
177
40.6
A15-B52
(
A15
B52
)
180
38.2
A15-B45
(
A15
B45
)
181
37.5
A43-B13
(
A43
B13
)
182
37.5
A57-B53
(
A57
B53
)
183
36.7
A55-B18
(
A55
B18
)
184
36.4
A41-B11
(
A41
B11
)
185
35.3
A45-B21
(
A45
B21
)
187
35
A15-B56
(
A15
B56
)
188
34.4
A41-B3
(
A41
B3
)
189
34.4
A57-B31
(
A57
B31
)
190
34.3
A55-B6
(
A55
B6
)
191
33.3
A37-B45
(
A37
B45
)
192
32.4
A31-B57
(
A31
B57
)
193
32.4
A35-B30
(
A35
B30
)
194
32.3
A49-B54
(
A49
B54
)
196
31.4
A57-B2
(
A57
B2
)
197
31.4
A57-B22
(
A57
B22
)
202
31.2
A57-B18
(
A57
B18
)
204
30.8
A53-B10
(
A53
B10
)
207
29.7
A9-B52
(
A9
B52
)
208
29.7
A39-B18
(
A39
B18
)
210
29.4
A19-B28
(
A19
B28
)
211
29.4
A55-B33
(
A55
B33
)
216
28.6
A19-B42
(
A19
B42
)
217
28.6
A57-B23
(
A57
B23
)
218
28.1
A57-B9
(
A57
B9
)
221
27.8
A49-B35
(
A49
B35
)
226
27
A39-B10
(
A39
B10
)
228
26.5
A53-B2
(
A53
B2
)
229
26.3
A5-B56
(
A5
B56
)
231
25.7
A21-B55
(
A21
B55
)
232
25.7
A27-B18
(
A27
B18
)
233
25.7
A29-B49
(
A29
B49
)
234
25.7
A35-B28
(
A35
B28
)
237
25.7
A53-B26
(
A53
B26
)
239
25.6
A55-B11
(
A55
B11
)