A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =30, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
1 54.7 A15-B15 ( A15 B15 )
2 50.9 A5-B5 A10-B10 A15-B15 ( A5 B5 A10 B10 A15 B15 )
3 50.5 A1-B1 A6-B6 A11-B11 A16-B16 ( A1 B1 A6 B6 A11 B11 A16 B16 )
4 50.5 A9-B9 A14-B14 ( A9 B9 A14 B14 )
5 47.2 A11-B11 A16-B16 ( A11 B11 A16 B16 )
6 46.5 A3-B3 A8-B8 A13-B13 A18-B18 ( A3 B3 A8 B8 A13 B13 A18 B18 )
7 46.2 A5-B18 ( A5 B18 )
8 45.6 A15-B16 ( A15 B16 )
9 45.3 A7-B7 A12-B12 A17-B17 ( A7 B7 A12 B12 A17 B17 )
10 42.3 A54-B29 ( A54 B29 )
11 41.5 A17-B17 ( A17 B17 )
12 40.7 A5-B36 ( A5 B36 )
13 40.5 A13-B13 A18-B18 ( A13 B13 A18 B18 )
14 40.4 A13-B14 ( A13 B14 )
15 40.4 A38-B16 ( A38 B16 )
16 40.0 A35-B32 ( A35 B32 )
17 39.6 A15-B4 ( A15 B4 )
18 39.5 A11-B12 A16-B17 ( A11 B12 A16 B17 )
19 39.3 A15-B30 ( A15 B30 )
20 38.5 A9-B10 A14-B15 ( A9 B10 A14 B15 )
21 38.1 A1-B2 A6-B7 A11-B12 A16-B17 ( A1 B2 A6 B7 A11 B12 A16 B17 )
22 37.9 A50-B17 ( A50 B17 )
23 37.7 A3-B4 A8-B9 A13-B14 ( A3 B4 A8 B9 A13 B14 )
24 37.5 A5-B37 ( A5 B37 )
25 37.3 A42-B21 ( A42 B21 )
26 37.2 A5-B6 A10-B11 A15-B16 ( A5 B6 A10 B11 A15 B16 )
27 36.4 A54-B4 ( A54 B4 )
28 36.2 A30-B8 A38-B16 ( A30 B8 A38 B16 )
29 35.7 A5-B4 A10-B9 A15-B14 ( A5 B4 A10 B9 A15 B14 )
30 35.1 A17-B18 ( A17 B18 )
31 34.9 A11-B10 A16-B15 ( A11 B10 A16 B15 )
32 34.9 A15-B14 ( A15 B14 )
33 34.8 A3-B2 A8-B7 A14-B13 ( A3 B2 A8 B7 A14 B13 )
34 34.6 A13-B28 ( A13 B28 )
35 34.6 A19-B24 ( A19 B24 )
36 34.5 A5-B17 ( A5 B17 )
37 34.5 A30-B15 ( A30 B15 )
38 34.5 A54-B30 ( A54 B30 )
39 34.2 A15-B29 A22-B36 ( A15 B29 A22 B36 )
40 34.0 A3-B40 ( A3 B40 )
41 34.0 A7-B8 A12-B13 A17-B18 ( A7 B8 A12 B13 A17 B18 )
42 33.9 A52-B3 ( A52 B3 )
43 33.5 A7-B6 A14-B13 ( A7 B6 A14 B13 )
44 33.3 A17-B16 ( A17 B16 )
45 33.3 A38-B12 A55-B29 ( A38 B12 A55 B29 )
46 33.3 A48-B2 ( A48 B2 )
47 33.3 A50-B16 ( A50 B16 )
48 32.8 A1-B25 ( A1 B25 )
49 32.8 A15-B3 ( A15 B3 )
50 32.8 A25-B12 ( A25 B12 )
51 32.7 A3-B29 ( A3 B29 )
52 32.7 A3-B33 ( A3 B33 )
53 32.7 A9-B16 ( A9 B16 )
54 32.7 A48-B12 ( A48 B12 )
55 32.3 A5-B19 A14-B28 A22-B36 ( A5 B19 A14 B28 A22 B36 )
56 32.1 A22-B36 ( A22 B36 )
57 32.1 A30-B16 ( A30 B16 )
58 31.8 A9-B8 A14-B13 ( A9 B8 A14 B13 )
59 31.7 A11-B28 ( A11 B28 )
60 31.6 A52-B16 ( A52 B16 )
61 31.4 A50-B4 ( A50 B4 )
62 30.9 A50-B13 ( A50 B13 )
63 30.2 A27-B14 ( A27 B14 )