A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =25, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
270.6
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A22-B22
A37-B37
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A22
B22
A37
B37
)
2
237.9
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
A37-B37
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A37
B37
)
3
225.1
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A22-B22
A37-B37
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A22
B22
A37
B37
)
4
205.1
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A22-B22
A37-B37
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A22
B22
A37
B37
)
5
185.3
A3-B8
A8-B13
A14-B19
A19-B24
A26-B31
A35-B40
(
A3
B8
A8
B13
A14
B19
A19
B24
A26
B31
A35
B40
)
6
183.9
A5-B1
A16-B12
A22-B18
A28-B24
A33-B29
A38-B34
(
A5
B1
A16
B12
A22
B18
A28
B24
A33
B29
A38
B34
)
7
183
A1-B6
A8-B13
A14-B19
A19-B24
A26-B31
A35-B40
(
A1
B6
A8
B13
A14
B19
A19
B24
A26
B31
A35
B40
)
8
182.4
A1-B5
A6-B10
A11-B15
A17-B21
A22-B26
A32-B36
(
A1
B5
A6
B10
A11
B15
A17
B21
A22
B26
A32
B36
)
9
180.8
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
A21-B22
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
)
10
179.4
A3-B2
A8-B7
A13-B12
A18-B17
A23-B22
(
A3
B2
A8
B7
A13
B12
A18
B17
A23
B22
)
11
176
A9-B5
A16-B12
A22-B18
A28-B24
A33-B29
A38-B34
(
A9
B5
A16
B12
A22
B18
A28
B24
A33
B29
A38
B34
)
13
168
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A24-B25
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A24
B25
)
15
159.3
A13-B1
A18-B6
A25-B13
A35-B23
A52-B40
(
A13
B1
A18
B6
A25
B13
A35
B23
A52
B40
)
17
150
A1-B7
A10-B16
A18-B24
A23-B29
A34-B40
(
A1
B7
A10
B16
A18
B24
A23
B29
A34
B40
)
18
146.7
A5-B6
A10-B11
A15-B16
A21-B22
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
A21
B22
)
19
145.5
A3-B18
A9-B24
A14-B29
A20-B35
A25-B40
(
A3
B18
A9
B24
A14
B29
A20
B35
A25
B40
)
21
143.6
A29-B6
A34-B11
A39-B16
A44-B21
A54-B31
(
A29
B6
A34
B11
A39
B16
A44
B21
A54
B31
)
22
143.2
A7-B8
A12-B13
A17-B18
A24-B25
(
A7
B8
A12
B13
A17
B18
A24
B25
)
23
143.1
A23-B2
A30-B9
A39-B18
A47-B26
A52-B31
(
A23
B2
A30
B9
A39
B18
A47
B26
A52
B31
)
25
141.1
A25-B2
A30-B7
A35-B12
A44-B21
A54-B31
(
A25
B2
A30
B7
A35
B12
A44
B21
A54
B31
)
26
139.5
A27-B4
A33-B10
A39-B16
A44-B21
A54-B31
(
A27
B4
A33
B10
A39
B16
A44
B21
A54
B31
)
27
133.9
A7-B6
A12-B11
A17-B16
A23-B22
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
A23
B22
)
28
130.1
A1-B3
A6-B8
A12-B14
A19-B21
A33-B35
(
A1
B3
A6
B8
A12
B14
A19
B21
A33
B35
)
31
127.2
A19-B6
A25-B12
A42-B29
A52-B39
(
A19
B6
A25
B12
A42
B29
A52
B39
)
32
126.8
A21-B1
A40-B20
A46-B26
A51-B31
(
A21
B1
A40
B20
A46
B26
A51
B31
)
33
124
A23-B5
A31-B13
A48-B30
A53-B35
(
A23
B5
A31
B13
A48
B30
A53
B35
)
34
123.1
A25-B1
A30-B6
A36-B12
A52-B28
(
A25
B1
A30
B6
A36
B12
A52
B28
)
38
122.7
A15-B3
A22-B10
A35-B23
A52-B40
(
A15
B3
A22
B10
A35
B23
A52
B40
)
39
122.5
A21-B5
A32-B16
A37-B21
A47-B31
(
A21
B5
A32
B16
A37
B21
A47
B31
)
42
119.6
A19-B7
A25-B13
A35-B23
A52-B40
(
A19
B7
A25
B13
A35
B23
A52
B40
)
44
117.3
A27-B1
A38-B12
A43-B17
A53-B27
(
A27
B1
A38
B12
A43
B17
A53
B27
)
48
114.1
A17-B2
A22-B7
A30-B15
A36-B21
(
A17
B2
A22
B7
A30
B15
A36
B21
)
49
113.4
A17-B9
A23-B15
A39-B31
A47-B39
(
A17
B9
A23
B15
A39
B31
A47
B39
)
51
113
A21-B2
A39-B20
A46-B27
A51-B32
(
A21
B2
A39
B20
A46
B27
A51
B32
)
62
102.1
A5-B19
A15-B29
A21-B35
(
A5
B19
A15
B29
A21
B35
)
69
98
A21-B13
A39-B31
A47-B39
(
A21
B13
A39
B31
A47
B39
)
73
96.6
A43-B6
A48-B11
A53-B16
(
A43
B6
A48
B11
A53
B16
)
74
95.8
A37-B5
A48-B16
A53-B21
(
A37
B5
A48
B16
A53
B21
)
77
95.2
A41-B20
A47-B26
A52-B31
(
A41
B20
A47
B26
A52
B31
)
81
93.6
A3-B17
A15-B29
A21-B35
(
A3
B17
A15
B29
A21
B35
)
82
92.9
A37-B6
A49-B18
A54-B23
(
A37
B6
A49
B18
A54
B23
)
84
92.6
A23-B10
A42-B29
A52-B39
(
A23
B10
A42
B29
A52
B39
)
87
92.1
A39-B13
A44-B18
A53-B27
(
A39
B13
A44
B18
A53
B27
)
89
88.7
A39-B9
A44-B14
A51-B21
(
A39
B9
A44
B14
A51
B21
)
90
88.1
A5-B16
A13-B24
A24-B35
(
A5
B16
A13
B24
A24
B35
)
93
87.2
A1-B19
A17-B35
A22-B40
(
A1
B19
A17
B35
A22
B40
)
98
85.5
A33-B6
A39-B12
A44-B17
(
A33
B6
A39
B12
A44
B17
)
99
85
A21-B6
A30-B15
A36-B21
(
A21
B6
A30
B15
A36
B21
)
106
82.4
A31-B6
A38-B13
A51-B26
(
A31
B6
A38
B13
A51
B26
)
108
77.8
A23-B9
A29-B15
A52-B38
(
A23
B9
A29
B15
A52
B38
)
111
74.4
A31-B9
A38-B16
(
A31
B9
A38
B16
)
112
74.1
A5-B18
A16-B29
(
A5
B18
A16
B29
)
123
69.2
A33-B11
A38-B16
(
A33
B11
A38
B16
)
125
69.1
A41-B8
A48-B15
(
A41
B8
A48
B15
)
129
68.3
A43-B10
A48-B15
(
A43
B10
A48
B15
)
131
68.1
A35-B6
A41-B12
(
A35
B6
A41
B12
)
137
67.2
A7-B20
A16-B29
(
A7
B20
A16
B29
)
139
67
A39-B6
A48-B15
(
A39
B6
A48
B15
)
143
65.8
A3-B13
A25-B35
(
A3
B13
A25
B35
)
152
61.9
A9-B4
A23-B18
(
A9
B4
A23
B18
)
156
60.7
A3-B16
A16-B29
(
A3
B16
A16
B29
)
166
58.8
A33-B4
A41-B12
(
A33
B4
A41
B12
)
169
57.8
A43-B9
A49-B15
(
A43
B9
A49
B15
)
173
57
A39-B14
A51-B26
(
A39
B14
A51
B26
)
177
56.6
A35-B8
A44-B17
(
A35
B8
A44
B17
)
178
56.5
A35-B13
A40-B18
(
A35
B13
A40
B18
)
198
48.2
A35-B7
(
A35
B7
)
211
38.3
A5-B17
(
A5
B17
)
279
27.7
A3-B15
(
A3
B15
)
304
25.8
A37-B8
(
A37
B8
)