A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =25, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
1 54.7 A15-B15 ( A15 B15 )
2 50.9 A5-B5 A10-B10 A15-B15 ( A5 B5 A10 B10 A15 B15 )
3 50.5 A1-B1 A6-B6 A11-B11 A16-B16 ( A1 B1 A6 B6 A11 B11 A16 B16 )
4 50.5 A9-B9 A14-B14 ( A9 B9 A14 B14 )
5 47.2 A11-B11 A16-B16 ( A11 B11 A16 B16 )
6 46.5 A3-B3 A8-B8 A13-B13 A18-B18 ( A3 B3 A8 B8 A13 B13 A18 B18 )
7 45.6 A15-B16 ( A15 B16 )
8 45.3 A7-B7 A12-B12 A17-B17 ( A7 B7 A12 B12 A17 B17 )
9 43.1 A39-B18 ( A39 B18 )
10 41.5 A17-B17 ( A17 B17 )
11 40.7 A5-B36 ( A5 B36 )
12 40.5 A13-B13 A18-B18 ( A13 B13 A18 B18 )
13 40.4 A55-B30 ( A55 B30 )
14 40.0 A35-B32 ( A35 B32 )
15 39.5 A11-B12 A16-B17 ( A11 B12 A16 B17 )
16 39.3 A53-B4 ( A53 B4 )
17 38.5 A9-B10 A14-B15 ( A9 B10 A14 B15 )
18 38.2 A53-B3 ( A53 B3 )
19 38.1 A1-B2 A6-B7 A11-B12 A16-B17 ( A1 B2 A6 B7 A11 B12 A16 B17 )
20 37.5 A5-B37 ( A5 B37 )
21 37.2 A5-B6 A10-B11 A15-B16 ( A5 B6 A10 B11 A15 B16 )
22 37.0 A5-B18 A16-B29 ( A5 B18 A16 B29 )
23 36.5 A53-B28 ( A53 B28 )
24 35.7 A5-B4 A10-B9 A15-B14 ( A5 B4 A10 B9 A15 B14 )
25 35.6 A31-B9 A38-B16 ( A31 B9 A38 B16 )
26 35.1 A17-B18 ( A17 B18 )
27 34.9 A11-B10 A16-B15 ( A11 B10 A16 B15 )
28 34.9 A15-B14 ( A15 B14 )
29 34.8 A3-B4 A8-B9 A13-B14 A18-B19 ( A3 B4 A8 B9 A13 B14 A18 B19 )
30 34.6 A19-B24 ( A19 B24 )
31 34.5 A5-B17 ( A5 B17 )
32 34.5 A31-B16 ( A31 B16 )
33 34.2 A15-B29 A22-B36 ( A15 B29 A22 B36 )
34 34.0 A3-B40 ( A3 B40 )
35 34.0 A7-B8 A12-B13 A17-B18 ( A7 B8 A12 B13 A17 B18 )
36 33.9 A31-B17 ( A31 B17 )
37 33.4 A13-B14 A18-B19 ( A13 B14 A18 B19 )
38 33.3 A17-B16 ( A17 B16 )
39 33.0 A15-B4 A45-B34 ( A15 B4 A45 B34 )
40 32.8 A1-B25 ( A1 B25 )
41 32.8 A15-B30 A21-B36 ( A15 B30 A21 B36 )
42 32.8 A25-B12 ( A25 B12 )
43 32.8 A53-B29 ( A53 B29 )
44 32.7 A3-B29 ( A3 B29 )
45 32.7 A3-B33 ( A3 B33 )
46 32.7 A9-B16 ( A9 B16 )
47 32.7 A49-B12 ( A49 B12 )
48 32.7 A51-B11 ( A51 B11 )
49 32.4 A3-B2 A8-B7 A13-B12 A18-B17 ( A3 B2 A8 B7 A13 B12 A18 B17 )
50 32.2 A39-B19 ( A39 B19 )
51 31.8 A7-B6 A12-B11 A17-B16 ( A7 B6 A12 B11 A17 B16 )
52 31.8 A9-B8 A14-B13 ( A9 B8 A14 B13 )
53 31.7 A11-B28 ( A11 B28 )
54 31.5 A53-B16 ( A53 B16 )
55 31.3 A15-B17 A20-B22 ( A15 B17 A20 B22 )
56 30.8 A21-B1 A39-B19 ( A21 B1 A39 B19 )
57 30.6 A55-B29 ( A55 B29 )
58 30.6 A5-B19 A14-B28 A19-B33 ( A5 B19 A14 B28 A19 B33 )
59 30.5 A13-B28 A21-B36 ( A13 B28 A21 B36 )
60 30.2 A27-B14 ( A27 B14 )
61 29.8 A53-B17 ( A53 B17 )
62 29.5 A15-B3 A25-B13 ( A15 B3 A25 B13 )
63 29.1 A49-B13 ( A49 B13 )
64 29.0 A33-B19 ( A33 B19 )
65 28.8 A41-B21 ( A41 B21 )
66 28.6 A15-B35 ( A15 B35 )
67 28.6 A47-B11 A52-B16 ( A47 B11 A52 B16 )
68 28.3 A1-B3 A12-B14 A20-B22 ( A1 B3 A12 B14 A20 B22 )
69 28.3 A35-B33 ( A35 B33 )
70 27.9 A5-B3 A35-B33 ( A5 B3 A35 B33 )
71 27.8 A13-B12 A18-B17 ( A13 B12 A18 B17 )
72 27.6 A19-B23 ( A19 B23 )
73 27.6 A5-B1 A16-B12 A33-B29 ( A5 B1 A16 B12 A33 B29 )
74 27.4 A3-B16 A16-B29 ( A3 B16 A16 B29 )
75 27.4 A13-B29 ( A13 B29 )
76 27.4 A19-B25 ( A19 B25 )
77 27.4 A39-B16 ( A39 B16 )
78 27.3 A15-B31 ( A15 B31 )
79 27.3 A33-B18 ( A33 B18 )
80 27.3 A33-B29 ( A33 B29 )
81 27.3 A39-B17 ( A39 B17 )
82 27.2 A3-B1 A35-B33 ( A3 B1 A35 B33 )
83 26.8 A19-B33 ( A19 B33 )
84 26.7 A37-B33 ( A37 B33 )
85 26.7 A49-B17 ( A49 B17 )
86 26.6 A3-B38 ( A3 B38 )
87 26.6 A7-B37 ( A7 B37 )
88 26.6 A17-B13 A33-B29 ( A17 B13 A33 B29 )
89 26.4 A31-B21 ( A31 B21 )
90 26.3 A21-B36 ( A21 B36 )
91 26.3 A25-B13 ( A25 B13 )
92 26.3 A45-B34 ( A45 B34 )
93 26.2 A29-B21 ( A29 B21 )
94 25.9 A3-B30 ( A3 B30 )
95 25.9 A55-B10 ( A55 B10 )
96 25.8 A19-B1 ( A19 B1 )
97 25.8 A53-B5 ( A53 B5 )
98 25.8 A53-B27 ( A53 B27 )