A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =25, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
1 46.7 A37-B34 ( A37 B34 )
2 46.0 A45-B12 A50-B17 ( A45 B12 A50 B17 )
3 45.0 A1-B1 A6-B6 A11-B11 A16-B16 A34-B34 ( A1 B1 A6 B6 A11 B11 A16 B16 A34 B34 )
4 44.2 A5-B5 A10-B10 A15-B15 A34-B34 ( A5 B5 A10 B10 A15 B15 A34 B34 )
5 43.8 A55-B30 ( A55 B30 )
6 41.9 A7-B20 ( A7 B20 )
7 41.7 A11-B11 A16-B16 A34-B34 ( A11 B11 A16 B16 A34 B34 )
8 41.5 A3-B3 A9-B9 A14-B14 A19-B19 A34-B34 ( A3 B3 A9 B9 A14 B14 A19 B19 A34 B34 )
9 41.5 A41-B20 A54-B33 ( A41 B20 A54 B33 )
10 40.6 A5-B18 ( A5 B18 )
11 40.5 A17-B17 A34-B34 ( A17 B17 A34 B34 )
12 40.5 A17-B18 ( A17 B18 )
13 39.8 A7-B7 A12-B12 A17-B17 A34-B34 ( A7 B7 A12 B12 A17 B17 A34 B34 )
14 38.7 A13-B40 ( A13 B40 )
15 38.7 A19-B38 ( A19 B38 )
16 38.7 A47-B40 ( A47 B40 )
17 38.2 A5-B36 ( A5 B36 )
18 37.5 A43-B39 ( A43 B39 )
19 37.4 A9-B9 A14-B14 A19-B19 A34-B34 ( A9 B9 A14 B14 A19 B19 A34 B34 )
20 37.3 A29-B22 A46-B39 ( A29 B22 A46 B39 )
21 37.1 A13-B13 A18-B18 A34-B34 ( A13 B13 A18 B18 A34 B34 )
22 36.4 A23-B6 ( A23 B6 )
23 36.0 A31-B11 A41-B21 ( A31 B11 A41 B21 )
24 35.5 A21-B38 ( A21 B38 )
25 35.4 A21-B26 A33-B38 ( A21 B26 A33 B38 )
26 35.4 A31-B27 A43-B39 ( A31 B27 A43 B39 )
27 35.3 A5-B41 ( A5 B41 )
28 35.1 A27-B35 A32-B40 ( A27 B35 A32 B40 )
29 35.1 A15-B16 ( A15 B16 )
30 34.7 A7-B12 A20-B25 A33-B38 ( A7 B12 A20 B25 A33 B38 )
31 34.5 A15-B15 A34-B34 ( A15 B15 A34 B34 )
32 34.4 A3-B30 A8-B35 A13-B40 ( A3 B30 A8 B35 A13 B40 )
33 33.5 A27-B23 A43-B39 ( A27 B23 A43 B39 )
34 33.5 A49-B12 A54-B17 ( A49 B12 A54 B17 )
35 33.3 A5-B37 ( A5 B37 )
36 33.3 A27-B37 ( A27 B37 )
37 33.3 A33-B38 ( A33 B38 )
38 33.3 A41-B21 ( A41 B21 )
39 33.3 A55-B6 ( A55 B6 )
40 33.1 A15-B30 A25-B40 ( A15 B30 A25 B40 )
41 33.0 A35-B7 A53-B25 ( A35 B7 A53 B25 )
42 32.7 A31-B9 A38-B16 A46-B24 A54-B32 ( A31 B9 A38 B16 A46 B24 A54 B32 )
43 32.5 A5-B32 A13-B40 ( A5 B32 A13 B40 )
44 32.4 A1-B8 A10-B17 A24-B31 ( A1 B8 A10 B17 A24 B31 )
45 32.4 A11-B14 ( A11 B14 )
46 32.4 A13-B14 A18-B19 ( A13 B14 A18 B19 )
47 32.4 A25-B32 ( A25 B32 )
48 32.3 A15-B26 ( A15 B26 )
49 32.3 A17-B32 A25-B40 ( A17 B32 A25 B40 )
50 32.2 A17-B31 A22-B36 ( A17 B31 A22 B36 )
51 32.1 A27-B14 A52-B39 ( A27 B14 A52 B39 )
52 31.9 A11-B18 A24-B31 ( A11 B18 A24 B31 )
53 31.9 A31-B16 A36-B21 ( A31 B16 A36 B21 )
54 31.9 A39-B13 A46-B20 A55-B29 ( A39 B13 A46 B20 A55 B29 )
55 31.8 A51-B5 A57-B11 ( A51 B5 A57 B11 )
56 31.4 A1-B7 A14-B20 A23-B29 A32-B38 ( A1 B7 A14 B20 A23 B29 A32 B38 )
57 31.4 A5-B35 ( A5 B35 )
58 31.4 A33-B19 ( A33 B19 )
59 31.4 A51-B14 ( A51 B14 )
60 31.4 A53-B3 ( A53 B3 )
61 31.4 A53-B4 ( A53 B4 )
62 31.4 A5-B6 A13-B14 A18-B19 ( A5 B6 A13 B14 A18 B19 )
63 31.2 A53-B28 ( A53 B28 )
64 31.2 A57-B11 ( A57 B11 )
65 30.9 A41-B18 A46-B23 ( A41 B18 A46 B23 )
66 30.9 A15-B24 A22-B31 A27-B36 ( A15 B24 A22 B31 A27 B36 )
67 30.8 A27-B20 A46-B39 ( A27 B20 A46 B39 )
68 30.8 A37-B16 A45-B24 A54-B33 ( A37 B16 A45 B24 A54 B33 )
69 30.6 A15-B35 ( A15 B35 )
70 30.4 A41-B1 A54-B14 ( A41 B1 A54 B14 )
71 30.4 A45-B24 A54-B33 ( A45 B24 A54 B33 )
72 30.3 A9-B13 A14-B18 A21-B25 ( A9 B13 A14 B18 A21 B25 )
73 30.3 A25-B39 ( A25 B39 )
74 30.3 A55-B18 ( A55 B18 )
75 30.3 A41-B29 A52-B40 ( A41 B29 A52 B40 )
76 30.3 A19-B10 A27-B18 A50-B41 ( A19 B10 A27 B18 A50 B41 )
77 30.0 A21-B2 A57-B38 ( A21 B2 A57 B38 )
78 30.0 A37-B8 A44-B15 ( A37 B8 A44 B15 )
79 29.9 A3-B2 A10-B9 A17-B16 A24-B23 A31-B30 ( A3 B2 A10 B9 A17 B16 A24 B23 A31 B30 )
80 29.9 A5-B4 A10-B9 A17-B16 A24-B23 A31-B30 ( A5 B4 A10 B9 A17 B16 A24 B23 A31 B30 )
81 29.9 A9-B10 A14-B15 ( A9 B10 A14 B15 )
82 29.8 A35-B12 A40-B17 A46-B23 ( A35 B12 A40 B17 A46 B23 )
83 29.7 A1-B2 A9-B10 A14-B15 ( A1 B2 A9 B10 A14 B15 )
84 29.7 A3-B4 A9-B10 A14-B15 ( A3 B4 A9 B10 A14 B15 )
85 29.5 A23-B29 A32-B38 ( A23 B29 A32 B38 )
86 29.4 A29-B23 ( A29 B23 )
87 29.4 A51-B42 ( A51 B42 )
88 29.4 A55-B5 ( A55 B5 )
89 29.4 A55-B11 ( A55 B11 )
90 29.4 A37-B1 A49-B13 A54-B18 ( A37 B1 A49 B13 A54 B18 )
91 29.4 A11-B15 A21-B25 ( A11 B15 A21 B25 )
92 29.3 A35-B11 A54-B30 ( A35 B11 A54 B30 )
93 29.2 A49-B13 A54-B18 ( A49 B13 A54 B18 )
94 29.0 A57-B27 ( A57 B27 )
95 28.9 A55-B31 ( A55 B31 )
96 28.8 A5-B25 A10-B30 A15-B35 ( A5 B25 A10 B30 A15 B35 )
97 28.8 A45-B15 A57-B27 ( A45 B15 A57 B27 )
98 28.8 A13-B17 A21-B25 ( A13 B17 A21 B25 )
99 28.8 A15-B19 A21-B25 ( A15 B19 A21 B25 )
100 28.8 A27-B18 A50-B41 ( A27 B18 A50 B41 )
101 28.7 A17-B16 A24-B23 A31-B30 ( A17 B16 A24 B23 A31 B30 )
102 28.6 A15-B3 A26-B14 A41-B29 A52-B40 ( A15 B3 A26 B14 A41 B29 A52 B40 )
103 28.6 A15-B4 A47-B36 ( A15 B4 A47 B36 )
104 28.6 A19-B21 A24-B26 A35-B37 ( A19 B21 A24 B26 A35 B37 )
105 28.6 A29-B3 A38-B12 A46-B20 A55-B29 ( A29 B3 A38 B12 A46 B20 A55 B29 )
106 28.6 A37-B9 A53-B25 ( A37 B9 A53 B25 )
107 28.6 A53-B25 ( A53 B25 )
108 28.4 A5-B31 A13-B39 ( A5 B31 A13 B39 )
109 28.4 A35-B6 A44-B15 ( A35 B6 A44 B15 )
110 28.2 A9-B28 A16-B35 ( A9 B28 A16 B35 )
111 28.2 A31-B30 ( A31 B30 )
112 28.1 A39-B23 ( A39 B23 )
113 28.0 A7-B32 A15-B40 ( A7 B32 A15 B40 )
114 27.9 A7-B6 A17-B16 A24-B23 A31-B30 ( A7 B6 A17 B16 A24 B23 A31 B30 )
115 27.8 A53-B40 ( A53 B40 )
116 27.8 A55-B12 ( A55 B12 )
117 27.7 A5-B17 A23-B35 ( A5 B17 A23 B35 )
118 27.7 A7-B19 A23-B35 ( A7 B19 A23 B35 )
119 27.3 A45-B35 ( A45 B35 )
120 27.0 A27-B36 ( A27 B36 )
121 27.0 A29-B37 ( A29 B37 )
122 27.0 A47-B36 ( A47 B36 )
123 27.0 A55-B19 ( A55 B19 )
124 26.9 A19-B19 A34-B34 ( A19 B19 A34 B34 )
125 26.6 A41-B14 A47-B20 ( A41 B14 A47 B20 )
126 26.5 A23-B35 ( A23 B35 )
127 26.5 A3-B14 A13-B24 ( A3 B14 A13 B24 )
128 26.3 A21-B25 ( A21 B25 )
129 26.2 A55-B29 ( A55 B29 )
130 25.8 A47-B20 ( A47 B20 )
131 25.7 A3-B35 ( A3 B35 )
132 25.7 A15-B40 ( A15 B40 )
133 25.7 A25-B40 ( A25 B40 )
134 25.7 A33-B18 ( A33 B18 )
135 25.6 A13-B24 ( A13 B24 )
136 25.6 A13-B39 ( A13 B39 )
137 25.6 A23-B5 ( A23 B5 )
138 25.6 A35-B37 ( A35 B37 )
139 25.6 A47-B39 ( A47 B39 )
140 25.6 A57-B38 ( A57 B38 )