A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =25, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
2
207.6
A3-B3
A9-B9
A14-B14
A19-B19
A34-B34
(
A3
B3
A9
B9
A14
B14
A19
B19
A34
B34
)
3
177
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A34-B34
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A34
B34
)
4
159.1
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A34-B34
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A34
B34
)
6
149.4
A3-B2
A10-B9
A17-B16
A24-B23
A31-B30
(
A3
B2
A10
B9
A17
B16
A24
B23
A31
B30
)
7
149.4
A5-B4
A10-B9
A17-B16
A24-B23
A31-B30
(
A5
B4
A10
B9
A17
B16
A24
B23
A31
B30
)
8
130.7
A31-B9
A38-B16
A46-B24
A54-B32
(
A31
B9
A38
B16
A46
B24
A54
B32
)
9
125.8
A1-B7
A14-B20
A23-B29
A32-B38
(
A1
B7
A14
B20
A23
B29
A32
B38
)
11
114.6
A15-B3
A26-B14
A41-B29
A52-B40
(
A15
B3
A26
B14
A41
B29
A52
B40
)
12
114.5
A29-B3
A38-B12
A46-B20
A55-B29
(
A29
B3
A38
B12
A46
B20
A55
B29
)
15
104.1
A7-B12
A20-B25
A33-B38
(
A7
B12
A20
B25
A33
B38
)
17
97.3
A1-B8
A10-B17
A24-B31
(
A1
B8
A10
B17
A24
B31
)
18
95.6
A39-B13
A46-B20
A55-B29
(
A39
B13
A46
B20
A55
B29
)
21
92.4
A37-B16
A45-B24
A54-B33
(
A37
B16
A45
B24
A54
B33
)
22
91.9
A45-B12
A50-B17
(
A45
B12
A50
B17
)
23
91
A9-B13
A14-B18
A21-B25
(
A9
B13
A14
B18
A21
B25
)
24
90.8
A19-B10
A27-B18
A50-B41
(
A19
B10
A27
B18
A50
B41
)
25
89.3
A35-B12
A40-B17
A46-B23
(
A35
B12
A40
B17
A46
B23
)
26
89
A1-B2
A9-B10
A14-B15
(
A1
B2
A9
B10
A14
B15
)
27
89
A3-B4
A9-B10
A14-B15
(
A3
B4
A9
B10
A14
B15
)
32
83
A41-B20
A54-B33
(
A41
B20
A54
B33
)
43
66.1
A35-B7
A53-B25
(
A35
B7
A53
B25
)
48
64.2
A27-B14
A52-B39
(
A27
B14
A52
B39
)
51
63.5
A51-B5
A57-B11
(
A51
B5
A57
B11
)
52
61.9
A41-B18
A46-B23
(
A41
B18
A46
B23
)
53
61.7
A27-B20
A46-B39
(
A27
B20
A46
B39
)
58
60
A37-B8
A44-B15
(
A37
B8
A44
B15
)
62
58.6
A35-B11
A54-B30
(
A35
B11
A54
B30
)
64
57.6
A45-B15
A57-B27
(
A45
B15
A57
B27
)
69
57.2
A37-B9
A53-B25
(
A37
B9
A53
B25
)
71
56.8
A35-B6
A44-B15
(
A35
B6
A44
B15
)
75
55.4
A7-B19
A23-B35
(
A7
B19
A23
B35
)
77
53.1
A41-B14
A47-B20
(
A41
B14
A47
B20
)
78
52.9
A3-B14
A13-B24
(
A3
B14
A13
B24
)
81
41.9
A7-B20
(
A7
B20
)
82
40.6
A5-B18
(
A5
B18
)