A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =30, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
1 49.4 A5-B5 A10-B10 A15-B15 A37-B37 ( A5 B5 A10 B10 A15 B15 A37 B37 )
2 48.6 A1-B1 A6-B6 A11-B11 A16-B16 A37-B37 ( A1 B1 A6 B6 A11 B11 A16 B16 A37 B37 )
3 48.2 A35-B7 ( A35 B7 )
4 47.6 A3-B3 A8-B8 A13-B13 A18-B18 A37-B37 ( A3 B3 A8 B8 A13 B13 A18 B18 A37 B37 )
9 44.4 A7-B7 A12-B12 A17-B17 A37-B37 ( A7 B7 A12 B12 A17 B17 A37 B37 )
29 39.5 A5-B18 A18-B31 ( A5 B18 A18 B31 )
33 39.0 A35-B6 ( A35 B6 )
34 38.9 A5-B6 A10-B11 A15-B16 ( A5 B6 A10 B11 A15 B16 )
36 38.8 A7-B8 A12-B13 A17-B18 ( A7 B8 A12 B13 A17 B18 )
41 38.3 A5-B17 ( A5 B17 )
47 37.7 A41-B20 ( A41 B20 )
48 37.7 A1-B2 A6-B7 A11-B12 A16-B17 ( A1 B2 A6 B7 A11 B12 A16 B17 )
49 37.7 A3-B4 A8-B9 A13-B14 ( A3 B4 A8 B9 A13 B14 )
57 37.2 A31-B9 A38-B16 ( A31 B9 A38 B16 )
67 36.0 A7-B20 A18-B31 ( A7 B20 A18 B31 )
69 35.9 A21-B13 A47-B39 ( A21 B13 A47 B39 )
70 35.9 A3-B2 A8-B7 A13-B12 A18-B17 A23-B22 ( A3 B2 A8 B7 A13 B12 A18 B17 A23 B22 )
72 35.8 A39-B14 A53-B28 ( A39 B14 A53 B28 )
83 34.8 A23-B5 A50-B32 ( A23 B5 A50 B32 )
94 34.2 A7-B6 A13-B12 A18-B17 A23-B22 ( A7 B6 A13 B12 A18 B17 A23 B22 )
96 34.1 A5-B1 A22-B18 A28-B24 ( A5 B1 A22 B18 A28 B24 )
98 34.0 A5-B19 A15-B29 A21-B35 ( A5 B19 A15 B29 A21 B35 )
99 34.0 A37-B5 A53-B21 ( A37 B5 A53 B21 )
101 33.9 A39-B9 A52-B22 ( A39 B9 A52 B22 )
105 33.6 A19-B6 A25-B12 A52-B39 ( A19 B6 A25 B12 A52 B39 )
106 33.5 A21-B5 A37-B21 ( A21 B5 A37 B21 )
115 33.0 A23-B10 A52-B39 ( A23 B10 A52 B39 )
121 32.8 A25-B12 A52-B39 ( A25 B12 A52 B39 )
127 32.8 A3-B16 A18-B31 ( A3 B16 A18 B31 )
130 32.4 A1-B5 A8-B12 A19-B23 A35-B39 ( A1 B5 A8 B12 A19 B23 A35 B39 )
131 32.3 A39-B13 A44-B18 A54-B28 ( A39 B13 A44 B18 A54 B28 )
139 32.2 A43-B6 A48-B11 A53-B16 ( A43 B6 A48 B11 A53 B16 )
141 31.9 A5-B16 ( A5 B16 )