A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =25, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
15 535 A5-B4 A10-B9 A15-B14 A20-B19 A25-B24 A30-B29 A35-B34 A40-B39 A45-B44 A50-B49 A55-B54 ( A5 B4 A10 B9 A15 B14 A20 B19 A25 B24 A30 B29 A35 B34 A40 B39 A45 B44 A50 B49 A55 B54 )
16 526.3 A1-B2 A6-B7 A11-B12 A16-B17 A21-B22 A26-B27 A31-B32 A36-B37 A41-B42 A46-B47 A51-B52 A56-B57 ( A1 B2 A6 B7 A11 B12 A16 B17 A21 B22 A26 B27 A31 B32 A36 B37 A41 B42 A46 B47 A51 B52 A56 B57 )
18 514.7 A7-B6 A12-B11 A17-B16 A22-B21 A27-B26 A32-B31 A37-B36 A42-B41 A47-B46 A52-B51 A57-B56 ( A7 B6 A12 B11 A17 B16 A22 B21 A27 B26 A32 B31 A37 B36 A42 B41 A47 B46 A52 B51 A57 B56 )
20 501 A5-B6 A10-B11 A15-B16 A20-B21 A25-B26 A30-B31 A35-B36 A40-B41 A45-B46 A50-B51 A55-B56 ( A5 B6 A10 B11 A15 B16 A20 B21 A25 B26 A30 B31 A35 B36 A40 B41 A45 B46 A50 B51 A55 B56 )
22 493.5 A3-B4 A8-B9 A13-B14 A18-B19 A23-B24 A28-B29 A33-B34 A38-B39 A43-B44 A48-B49 A53-B54 ( A3 B4 A8 B9 A13 B14 A18 B19 A23 B24 A28 B29 A33 B34 A38 B39 A43 B44 A48 B49 A53 B54 )
59 222.1 A3-B14 A8-B19 A13-B24 A23-B34 A31-B42 A37-B48 A45-B56 ( A3 B14 A8 B19 A13 B24 A23 B34 A31 B42 A37 B48 A45 B56 )
64 196.2 A9-B14 A19-B24 A30-B35 A36-B41 A41-B46 A48-B53 ( A9 B14 A19 B24 A30 B35 A36 B41 A41 B46 A48 B53 )
73 145.5 A25-B3 A32-B10 A39-B17 A45-B23 A51-B29 ( A25 B3 A32 B10 A39 B17 A45 B23 A51 B29 )
77 137.5 A13-B10 A18-B15 A31-B28 A48-B45 A57-B54 ( A13 B10 A18 B15 A31 B28 A48 B45 A57 B54 )
80 125.3 A15-B12 A31-B28 A48-B45 A57-B54 ( A15 B12 A31 B28 A48 B45 A57 B54 )
81 124.8 A13-B17 A30-B34 A43-B47 A53-B57 ( A13 B17 A30 B34 A43 B47 A53 B57 )
83 122.8 A33-B11 A39-B17 A45-B23 A51-B29 ( A33 B11 A39 B17 A45 B23 A51 B29 )
87 112 A37-B4 A42-B9 A50-B17 ( A37 B4 A42 B9 A50 B17 )
88 107.6 A19-B6 A26-B13 A42-B29 ( A19 B6 A26 B13 A42 B29 )
93 97.3 A23-B37 A31-B45 A39-B53 ( A23 B37 A31 B45 A39 B53 )
94 96.1 A31-B35 A43-B47 A53-B57 ( A31 B35 A43 B47 A53 B57 )
95 95 A11-B5 A21-B15 A41-B35 ( A11 B5 A21 B15 A41 B35 )
103 89.6 A7-B19 A29-B41 A39-B51 ( A7 B19 A29 B41 A39 B51 )
104 88.4 A3-B25 A10-B32 A30-B52 ( A3 B25 A10 B32 A30 B52 )
112 85.2 A45-B30 A53-B38 ( A45 B30 A53 B38 )
115 83.5 A31-B17 A36-B22 A45-B31 ( A31 B17 A36 B22 A45 B31 )
116 81.8 A39-B16 A45-B22 A54-B31 ( A39 B16 A45 B22 A54 B31 )
118 80.2 A43-B10 A50-B17 ( A43 B10 A50 B17 )
119 78.8 A5-B17 A29-B41 A39-B51 ( A5 B17 A29 B41 A39 B51 )
120 75.6 A27-B14 A42-B29 ( A27 B14 A42 B29 )
126 67.7 A45-B12 A50-B17 ( A45 B12 A50 B17 )
127 67.4 A7-B38 A21-B52 ( A7 B38 A21 B52 )
133 63.9 A45-B49 A53-B57 ( A45 B49 A53 B57 )
138 61.4 A39-B9 A44-B14 ( A39 B9 A44 B14 )
141 61.3 A39-B49 A47-B57 ( A39 B49 A47 B57 )
142 61.2 A45-B11 A54-B20 ( A45 B11 A54 B20 )
144 60.2 A41-B33 A47-B39 ( A41 B33 A47 B39 )
145 60 A25-B51 A30-B56 ( A25 B51 A30 B56 )
148 58.8 A33-B41 A39-B47 ( A33 B41 A39 B47 )
150 58.1 A23-B18 A34-B29 ( A23 B18 A34 B29 )
152 57.8 A37-B23 A45-B31 ( A37 B23 A45 B31 )
153 57.5 A35-B46 A45-B56 ( A35 B46 A45 B56 )
154 57.2 A39-B31 A45-B37 ( A39 B31 A45 B37 )
155 57.1 A13-B16 A45-B48 ( A13 B16 A45 B48 )
156 57.1 A15-B18 A45-B48 ( A15 B18 A45 B48 )
158 56.9 A1-B48 A7-B54 ( A1 B48 A7 B54 )
173 45.2 A35-B14 ( A35 B14 )
176 42.4 A45-B15 ( A45 B15 )
181 37.5 A43-B13 ( A43 B13 )
182 37.5 A57-B53 ( A57 B53 )
184 36.4 A41-B11 ( A41 B11 )
189 34.4 A57-B31 ( A57 B31 )
193 32.4 A35-B30 ( A35 B30 )
202 31.2 A57-B18 ( A57 B18 )
207 29.7 A9-B52 ( A9 B52 )
208 29.7 A39-B18 ( A39 B18 )
229 26.3 A5-B56 ( A5 B56 )
231 25.7 A21-B55 ( A21 B55 )
232 25.7 A27-B18 ( A27 B18 )