A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =35, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
1070
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A21-B21
A26-B26
A31-B31
A36-B36
A41-B41
A46-B46
A51-B51
A56-B56
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A21
B21
A26
B26
A31
B31
A36
B36
A41
B41
A46
B46
A51
B51
A56
B56
)
2
999.1
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A20-B20
A25-B25
A30-B30
A35-B35
A40-B40
A45-B45
A50-B50
A55-B55
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A20
B20
A25
B25
A30
B30
A35
B35
A40
B40
A45
B45
A50
B50
A55
B55
)
3
960.2
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
A23-B23
A28-B28
A33-B33
A38-B38
A43-B43
A48-B48
A53-B53
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A23
B23
A28
B28
A33
B33
A38
B38
A43
B43
A48
B48
A53
B53
)
4
960.1
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A22-B22
A27-B27
A32-B32
A37-B37
A42-B42
A47-B47
A52-B52
A57-B57
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A22
B22
A27
B27
A32
B32
A37
B37
A42
B42
A47
B47
A52
B52
A57
B57
)
5
899.3
A9-B9
A14-B14
A19-B19
A24-B24
A29-B29
A34-B34
A39-B39
A44-B44
A49-B49
A54-B54
(
A9
B9
A14
B14
A19
B19
A24
B24
A29
B29
A34
B34
A39
B39
A44
B44
A49
B49
A54
B54
)
15
535
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
16
528.6
A3-B2
A8-B7
A13-B12
A18-B17
A23-B22
A28-B27
A33-B32
A39-B38
A44-B43
A49-B48
A54-B53
(
A3
B2
A8
B7
A13
B12
A18
B17
A23
B22
A28
B27
A33
B32
A39
B38
A44
B43
A49
B48
A54
B53
)
18
514.7
A7-B6
A12-B11
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
19
501.9
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
20
501
A5-B6
A10-B11
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
22
496
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
23
490
A11-B10
A16-B15
A21-B20
A26-B25
A31-B30
A36-B35
A41-B40
A46-B45
A51-B50
A56-B55
(
A11
B10
A16
B15
A21
B20
A26
B25
A31
B30
A36
B35
A41
B40
A46
B45
A51
B50
A56
B55
)
24
483.5
A9-B8
A14-B13
A19-B18
A24-B23
A29-B28
A34-B33
A39-B38
A44-B43
A49-B48
A54-B53
(
A9
B8
A14
B13
A19
B18
A24
B23
A29
B28
A34
B33
A39
B38
A44
B43
A49
B48
A54
B53
)
25
449.3
A7-B8
A12-B13
A17-B18
A22-B23
A27-B28
A32-B33
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A7
B8
A12
B13
A17
B18
A22
B23
A27
B28
A32
B33
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
26
448.5
A9-B10
A14-B15
A19-B20
A24-B25
A29-B30
A34-B35
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A9
B10
A14
B15
A19
B20
A24
B25
A29
B30
A34
B35
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
66
165.8
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
69
141.1
A43-B42
A48-B47
A53-B52
(
A43
B42
A48
B47
A53
B52
)
70
138.9
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
72
110.5
A3-B14
A32-B43
A46-B57
(
A3
B14
A32
B43
A46
B57
)
79
85.2
A45-B30
A53-B38
(
A45
B30
A53
B38
)
81
81.1
A7-B37
A15-B45
(
A7
B37
A15
B45
)
82
80.5
A47-B48
A52-B53
(
A47
B48
A52
B53
)
83
78.7
A37-B4
A42-B9
(
A37
B4
A42
B9
)
84
76.9
A47-B43
A57-B53
(
A47
B43
A57
B53
)
87
46.9
A17-B54
(
A17
B54
)
88
46.9
A43-B10
(
A43
B10
)
89
46.7
A13-B26
(
A13
B26
)
92
45.2
A35-B14
(
A35
B14
)
93
44.1
A41-B46
(
A41
B46
)
95
43.8
A53-B9
(
A53
B9
)
96
43.3
A27-B14
(
A27
B14
)
97
42.4
A45-B15
(
A45
B15
)
98
40.6
A15-B52
(
A15
B52
)
99
40
A1-B26
(
A1
B26
)
100
40
A15-B12
(
A15
B12
)
102
40
A57-B46
(
A57
B46
)
103
38.7
A21-B15
(
A21
B15
)
104
38.7
A39-B17
(
A39
B17
)
106
38.2
A39-B22
(
A39
B22
)
107
37.5
A43-B13
(
A43
B13
)
109
37.1
A7-B38
(
A7
B38
)
110
36.7
A55-B18
(
A55
B18
)
111
36.4
A7-B19
(
A7
B19
)
112
36.4
A41-B11
(
A41
B11
)
113
35.3
A35-B41
(
A35
B41
)
114
35.3
A45-B21
(
A45
B21
)
115
35.3
A53-B57
(
A53
B57
)
116
35.1
A31-B45
(
A31
B45
)