A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =30, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
1 54.5 A17-B17 ( A17 B17 )
2 51.3 A3-B3 A9-B9 A14-B14 ( A3 B3 A9 B9 A14 B14 )
3 50.2 A5-B5 A10-B10 A15-B15 ( A5 B5 A10 B10 A15 B15 )
4 49.6 A1-B1 A6-B6 A11-B11 A16-B16 ( A1 B1 A6 B6 A11 B11 A16 B16 )
5 49.2 A11-B11 A16-B16 ( A11 B11 A16 B16 )
6 47.8 A9-B9 A14-B14 ( A9 B9 A14 B14 )
7 46.7 A37-B34 ( A37 B34 )
8 46.0 A45-B12 A50-B17 ( A45 B12 A50 B17 )
9 44.2 A7-B7 A12-B12 A17-B17 ( A7 B7 A12 B12 A17 B17 )
10 43.8 A55-B30 ( A55 B30 )
11 42.5 A13-B13 A18-B18 ( A13 B13 A18 B18 )
12 42.4 A15-B15 ( A15 B15 )
13 42.0 A29-B22 A47-B40 ( A29 B22 A47 B40 )
14 41.9 A7-B20 ( A7 B20 )
15 41.5 A41-B20 A54-B33 ( A41 B20 A54 B33 )
16 40.6 A5-B18 ( A5 B18 )
17 40.6 A15-B30 ( A15 B30 )
18 40.5 A17-B18 ( A17 B18 )
19 40.0 A39-B13 ( A39 B13 )
20 38.9 A17-B32 ( A17 B32 )
21 38.7 A13-B40 ( A13 B40 )
22 38.7 A19-B38 ( A19 B38 )
23 38.7 A47-B40 ( A47 B40 )
24 38.2 A5-B36 ( A5 B36 )
25 38.1 A3-B30 A13-B40 ( A3 B30 A13 B40 )
26 37.5 A35-B7 ( A35 B7 )
27 37.5 A43-B39 ( A43 B39 )
28 36.4 A23-B6 ( A23 B6 )
29 36.4 A27-B14 ( A27 B14 )
30 36.0 A31-B11 A41-B21 ( A31 B11 A41 B21 )
31 35.5 A21-B38 ( A21 B38 )
32 35.5 A27-B20 A47-B40 ( A27 B20 A47 B40 )
33 35.4 A21-B26 A33-B38 ( A21 B26 A33 B38 )
34 35.4 A31-B27 A43-B39 ( A31 B27 A43 B39 )
35 35.3 A5-B41 ( A5 B41 )
36 35.1 A27-B35 A32-B40 ( A27 B35 A32 B40 )
37 35.1 A13-B14 ( A13 B14 )
38 35.1 A15-B16 ( A15 B16 )
39 34.7 A1-B7 A14-B20 A24-B30 ( A1 B7 A14 B20 A24 B30 )
40 34.7 A7-B12 A20-B25 A33-B38 ( A7 B12 A20 B25 A33 B38 )
41 34.4 A21-B2 ( A21 B2 )
42 33.4 A1-B8 A10-B17 A25-B32 ( A1 B8 A10 B17 A25 B32 )
43 33.4 A11-B18 A25-B32 ( A11 B18 A25 B32 )
44 33.3 A5-B37 ( A5 B37 )
45 33.3 A19-B10 ( A19 B10 )
46 33.3 A27-B37 ( A27 B37 )
47 33.3 A33-B38 ( A33 B38 )
48 33.3 A41-B21 ( A41 B21 )
49 33.3 A55-B6 ( A55 B6 )
50 32.9 A15-B24 A22-B31 ( A15 B24 A22 B31 )
51 32.7 A31-B9 A38-B16 A46-B24 A54-B32 ( A31 B9 A38 B16 A46 B24 A54 B32 )
52 32.4 A11-B14 ( A11 B14 )
53 32.4 A11-B15 ( A11 B15 )
54 32.4 A25-B32 ( A25 B32 )
55 32.4 A9-B13 A14-B18 ( A9 B13 A14 B18 )
56 32.3 A15-B26 ( A15 B26 )
57 32.2 A17-B31 A22-B36 ( A17 B31 A22 B36 )
58 31.9 A3-B2 A18-B17 A24-B23 ( A3 B2 A18 B17 A24 B23 )
59 31.9 A5-B4 A18-B17 A24-B23 ( A5 B4 A18 B17 A24 B23 )
60 31.8 A35-B12 A46-B23 ( A35 B12 A46 B23 )
61 31.8 A51-B5 A57-B11 ( A51 B5 A57 B11 )
62 31.5 A37-B16 A54-B33 ( A37 B16 A54 B33 )
63 31.4 A5-B35 ( A5 B35 )
64 31.4 A33-B19 ( A33 B19 )
65 31.4 A37-B8 ( A37 B8 )
66 31.4 A49-B13 ( A49 B13 )
67 31.4 A51-B14 ( A51 B14 )
68 31.4 A53-B3 ( A53 B3 )
69 31.4 A53-B4 ( A53 B4 )
70 31.2 A5-B31 ( A5 B31 )
71 31.2 A13-B17 ( A13 B17 )
72 31.2 A15-B19 ( A15 B19 )
73 31.2 A53-B28 ( A53 B28 )
74 31.2 A57-B11 ( A57 B11 )
75 30.6 A15-B35 ( A15 B35 )
76 30.3 A7-B32 ( A7 B32 )
77 30.3 A15-B4 ( A15 B4 )
78 30.3 A25-B39 ( A25 B39 )
79 30.3 A55-B18 ( A55 B18 )