A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =35, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
51.5
A23-B6
(
A23
B6
)
2
50.0
A5-B18
(
A5
B18
)
3
50.0
A50-B17
(
A50
B17
)
4
48.4
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A30-B30
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A30
B30
)
5
48.2
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
A30-B30
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A30
B30
)
6
47.8
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A30-B30
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A30
B30
)
7
47.5
A17-B17
A30-B30
(
A17
B17
A30
B30
)
8
47.2
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A30-B30
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A30
B30
)
9
47.1
A52-B33
(
A52
B33
)
10
46.9
A1-B24
(
A1
B24
)
11
46.9
A5-B31
(
A5
B31
)
12
46.4
A11-B11
A16-B16
A30-B30
(
A11
B11
A16
B16
A30
B30
)
13
45.5
A40-B24
(
A40
B24
)
14
45.5
A42-B26
(
A42
B26
)
15
45.4
A9-B9
A14-B14
A30-B30
(
A9
B9
A14
B14
A30
B30
)
16
45.2
A34-B6
(
A34
B6
)
17
44.6
A25-B4
A41-B20
A50-B29
(
A25
B4
A41
B20
A50
B29
)
18
44.0
A19-B22
A35-B38
(
A19
B22
A35
B38
)
19
43.8
A13-B13
A18-B18
A30-B30
(
A13
B13
A18
B18
A30
B30
)
20
43.8
A7-B20
(
A7
B20
)
21
43.8
A17-B35
(
A17
B35
)
22
43.8
A36-B31
(
A36
B31
)
23
43.8
A54-B29
(
A54
B29
)
24
43.8
A44-B11
A50-B17
(
A44
B11
A50
B17
)
25
42.9
A7-B39
(
A7
B39
)
26
42.4
A3-B29
(
A3
B29
)
27
41.9
A48-B15
(
A48
B15
)
28
41.9
A50-B4
(
A50
B4
)
29
41.8
A23-B26
A35-B38
(
A23
B26
A35
B38
)
30
41.7
A5-B42
(
A5
B42
)
31
41.7
A17-B32
(
A17
B32
)
32
41.7
A19-B20
(
A19
B20
)
33
41.5
A15-B15
A30-B30
(
A15
B15
A30
B30
)
34
41.3
A9-B6
A37-B34
(
A9
B6
A37
B34
)
35
41.2
A5-B16
(
A5
B16
)
36
41.2
A23-B42
(
A23
B42
)
37
41.2
A52-B21
(
A52
B21
)
38
41.2
A54-B17
(
A54
B17
)
39
41.0
A19-B3
A40-B24
(
A19
B3
A40
B24
)
40
40.6
A15-B30
(
A15
B30
)
41
40.6
A54-B14
(
A54
B14
)
42
40.3
A17-B1
A40-B24
(
A17
B1
A40
B24
)
43
40.2
A17-B18
A23-B24
(
A17
B18
A23
B24
)
44
40.0
A23-B24
(
A23
B24
)
45
40.0
A54-B4
(
A54
B4
)
46
40.0
A56-B12
(
A56
B12
)
47
40.0
A11-B18
A25-B32
(
A11
B18
A25
B32
)
48
40.0
A13-B25
A27-B39
(
A13
B25
A27
B39
)
49
40.0
A38-B13
A54-B29
(
A38
B13
A54
B29
)
50
39.7
A15-B4
A23-B12
A35-B24
(
A15
B4
A23
B12
A35
B24
)
51
39.5
A31-B13
A47-B29
(
A31
B13
A47
B29
)
52
39.5
A46-B23
(
A46
B23
)
53
39.4
A19-B40
(
A19
B40
)
54
39.4
A48-B41
(
A48
B41
)
55
39.4
A54-B42
(
A54
B42
)
56
38.9
A29-B22
A38-B31
A47-B40
(
A29
B22
A38
B31
A47
B40
)
57
38.9
A3-B35
(
A3
B35
)
58
38.9
A13-B34
A18-B39
(
A13
B34
A18
B39
)
59
38.9
A40-B31
A49-B40
(
A40
B31
A49
B40
)
60
38.9
A11-B27
A25-B41
(
A11
B27
A25
B41
)
61
38.7
A13-B40
(
A13
B40
)
62
38.7
A25-B24
(
A25
B24
)
63
38.5
A5-B33
(
A5
B33
)
64
38.5
A9-B13
A14-B18
(
A9
B13
A14
B18
)
65
38.4
A13-B14
A19-B20
(
A13
B14
A19
B20
)
66
38.4
A1-B8
A10-B17
A25-B32
(
A1
B8
A10
B17
A25
B32
)
67
38.2
A3-B26
(
A3
B26
)
68
38.2
A36-B42
(
A36
B42
)
69
38.2
A50-B29
(
A50
B29
)
70
38.2
A54-B32
(
A54
B32
)
71
38.1
A7-B28
A13-B34
A18-B39
(
A7
B28
A13
B34
A18
B39
)
72
38.0
A1-B22
A7-B28
A13-B34
A18-B39
(
A1
B22
A7
B28
A13
B34
A18
B39
)
73
37.8
A3-B32
(
A3
B32
)
74
37.8
A11-B15
(
A11
B15
)
75
37.8
A23-B25
(
A23
B25
)
76
37.5
A15-B16
A23-B24
(
A15
B16
A23
B24
)
77
37.5
A27-B39
(
A27
B39
)
78
37.1
A25-B41
(
A25
B41
)
79
37.1
A36-B8
(
A36
B8
)
80
37.1
A50-B41
(
A50
B41
)
81
37.1
A56-B25
(
A56
B25
)
82
37.0
A3-B7
A8-B12
A14-B18
(
A3
B7
A8
B12
A14
B18
)
83
36.8
A23-B12
A35-B24
(
A23
B12
A35
B24
)
84
36.8
A31-B31
(
A31
B31
)
85
36.8
A54-B35
(
A54
B35
)
86
36.7
A21-B26
A36-B41
(
A21
B26
A36
B41
)
87
36.6
A25-B33
A32-B40
(
A25
B33
A32
B40
)
88
36.4
A27-B14
(
A27
B14
)
89
36.1
A13-B29
A25-B41
(
A13
B29
A25
B41
)
90
36.1
A25-B32
(
A25
B32
)
91
36.1
A40-B30
(
A40
B30
)
92
36.1
A54-B23
(
A54
B23
)
93
36.1
A56-B16
(
A56
B16
)
94
36.0
A11-B35
A17-B41
(
A11
B35
A17
B41
)
95
36.0
A1-B25
A11-B35
A17-B41
(
A1
B25
A11
B35
A17
B41
)
96
36.0
A31-B7
A40-B16
A47-B23
(
A31
B7
A40
B16
A47
B23
)
97
35.9
A17-B41
(
A17
B41
)
98
35.8
A38-B31
A47-B40
(
A38
B31
A47
B40
)
99
35.8
A40-B16
A47-B23
(
A40
B16
A47
B23
)
100
35.1
A36-B41
(
A36
B41
)
101
35.1
A50-B30
(
A50
B30
)