A=Mouse.Q8VCY6, B=Homosapiens.Q9NYH9, Threshold for similarity =30, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity, Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no.
Average Score
Fragment alignment
Fasta links
1
93.5
A49-B49
A54-B54
(
A49
B49
A54
B54
)
2
90.8
A5-B5
A10-B10
A15-B15
A20-B20
A25-B25
A30-B30
A35-B35
A40-B40
A45-B45
A50-B50
A55-B55
(
A5
B5
A10
B10
A15
B15
A20
B20
A25
B25
A30
B30
A35
B35
A40
B40
A45
B45
A50
B50
A55
B55
)
3
90.3
A45-B45
A50-B50
A55-B55
(
A45
B45
A50
B50
A55
B55
)
4
90.3
A55-B55
(
A55
B55
)
5
90.3
A57-B57
(
A57
B57
)
6
90.3
A15-B15
A20-B20
A25-B25
A30-B30
A35-B35
A40-B40
A45-B45
A50-B50
A55-B55
(
A15
B15
A20
B20
A25
B25
A30
B30
A35
B35
A40
B40
A45
B45
A50
B50
A55
B55
)
7
89.9
A9-B9
A14-B14
A19-B19
A24-B24
A29-B29
A34-B34
A39-B39
A44-B44
A49-B49
A54-B54
(
A9
B9
A14
B14
A19
B19
A24
B24
A29
B29
A34
B34
A39
B39
A44
B44
A49
B49
A54
B54
)
8
89.2
A1-B1
A6-B6
A11-B11
A16-B16
A21-B21
A26-B26
A31-B31
A36-B36
A41-B41
A46-B46
A51-B51
A56-B56
(
A1
B1
A6
B6
A11
B11
A16
B16
A21
B21
A26
B26
A31
B31
A36
B36
A41
B41
A46
B46
A51
B51
A56
B56
)
9
88.9
A25-B25
A30-B30
A35-B35
A40-B40
A45-B45
A50-B50
A55-B55
(
A25
B25
A30
B30
A35
B35
A40
B40
A45
B45
A50
B50
A55
B55
)
10
88.2
A19-B19
A24-B24
A29-B29
A34-B34
A39-B39
A44-B44
A49-B49
A54-B54
(
A19
B19
A24
B24
A29
B29
A34
B34
A39
B39
A44
B44
A49
B49
A54
B54
)
11
87.7
A11-B11
A16-B16
A21-B21
A26-B26
A31-B31
A36-B36
A41-B41
A46-B46
A51-B51
A56-B56
(
A11
B11
A16
B16
A21
B21
A26
B26
A31
B31
A36
B36
A41
B41
A46
B46
A51
B51
A56
B56
)
12
87.3
A3-B3
A8-B8
A13-B13
A18-B18
A23-B23
A28-B28
A33-B33
A38-B38
A43-B43
A48-B48
A53-B53
(
A3
B3
A8
B8
A13
B13
A18
B18
A23
B23
A28
B28
A33
B33
A38
B38
A43
B43
A48
B48
A53
B53
)
13
87.3
A7-B7
A12-B12
A17-B17
A22-B22
A27-B27
A32-B32
A37-B37
A42-B42
A47-B47
A52-B52
A57-B57
(
A7
B7
A12
B12
A17
B17
A22
B22
A27
B27
A32
B32
A37
B37
A42
B42
A47
B47
A52
B52
A57
B57
)
14
87.1
A51-B51
A56-B56
(
A51
B51
A56
B56
)
15
87.1
A35-B35
A40-B40
A45-B45
A50-B50
A55-B55
(
A35
B35
A40
B40
A45
B45
A50
B50
A55
B55
)
16
87.1
A39-B39
A44-B44
A49-B49
A54-B54
(
A39
B39
A44
B44
A49
B49
A54
B54
)
17
86.7
A13-B13
A18-B18
A23-B23
A28-B28
A33-B33
A38-B38
A43-B43
A48-B48
A53-B53
(
A13
B13
A18
B18
A23
B23
A28
B28
A33
B33
A38
B38
A43
B43
A48
B48
A53
B53
)
18
86.7
A17-B17
A22-B22
A27-B27
A32-B32
A37-B37
A42-B42
A47-B47
A52-B52
A57-B57
(
A17
B17
A22
B22
A27
B27
A32
B32
A37
B37
A42
B42
A47
B47
A52
B52
A57
B57
)
19
86.0
A47-B47
A52-B52
A57-B57
(
A47
B47
A52
B52
A57
B57
)
20
86.0
A29-B29
A34-B34
A39-B39
A44-B44
A49-B49
A54-B54
(
A29
B29
A34
B34
A39
B39
A44
B44
A49
B49
A54
B54
)
21
85.8
A21-B21
A26-B26
A31-B31
A36-B36
A41-B41
A46-B46
A51-B51
A56-B56
(
A21
B21
A26
B26
A31
B31
A36
B36
A41
B41
A46
B46
A51
B51
A56
B56
)
22
85.0
A43-B43
A48-B48
A53-B53
(
A43
B43
A48
B48
A53
B53
)
23
84.7
A41-B41
A46-B46
A51-B51
A56-B56
(
A41
B41
A46
B46
A51
B51
A56
B56
)
24
84.3
A27-B27
A32-B32
A37-B37
A42-B42
A47-B47
A52-B52
A57-B57
(
A27
B27
A32
B32
A37
B37
A42
B42
A47
B47
A52
B52
A57
B57
)
25
83.9
A53-B53
(
A53
B53
)
26
83.8
A23-B23
A28-B28
A33-B33
A38-B38
A43-B43
A48-B48
A53-B53
(
A23
B23
A28
B28
A33
B33
A38
B38
A43
B43
A48
B48
A53
B53
)
27
83.3
A31-B31
A36-B36
A41-B41
A46-B46
A51-B51
A56-B56
(
A31
B31
A36
B36
A41
B41
A46
B46
A51
B51
A56
B56
)
28
81.3
A37-B37
A42-B42
A47-B47
A52-B52
A57-B57
(
A37
B37
A42
B42
A47
B47
A52
B52
A57
B57
)
29
81.3
A33-B33
A38-B38
A43-B43
A48-B48
A53-B53
(
A33
B33
A38
B38
A43
B43
A48
B48
A53
B53
)
30
53.8
A49-B48
A54-B53
(
A49
B48
A54
B53
)
31
52.5
A51-B50
A56-B55
(
A51
B50
A56
B55
)
32
52.1
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
33
51.3
A55-B54
(
A55
B54
)
34
51.3
A57-B56
(
A57
B56
)
35
50.6
A41-B40
A46-B45
A51-B50
A56-B55
(
A41
B40
A46
B45
A51
B50
A56
B55
)
36
50.0
A31-B30
A36-B35
A41-B40
A46-B45
A51-B50
A56-B55
(
A31
B30
A36
B35
A41
B40
A46
B45
A51
B50
A56
B55
)
37
49.6
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
38
49.3
A39-B38
A44-B43
A49-B48
A54-B53
(
A39
B38
A44
B43
A49
B48
A54
B53
)
39
49.2
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
40
49.2
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
41
49.1
A21-B20
A26-B25
A31-B30
A36-B35
A41-B40
A46-B45
A51-B50
A56-B55
(
A21
B20
A26
B25
A31
B30
A36
B35
A41
B40
A46
B45
A51
B50
A56
B55
)
42
49.0
A11-B10
A16-B15
A21-B20
A26-B25
A31-B30
A36-B35
A41-B40
A46-B45
A51-B50
A56-B55
(
A11
B10
A16
B15
A21
B20
A26
B25
A31
B30
A36
B35
A41
B40
A46
B45
A51
B50
A56
B55
)
43
48.6
A5-B4
A10-B9
A15-B14
A20-B19
A25-B24
A30-B29
A35-B34
A40-B39
A45-B44
A50-B49
A55-B54
(
A5
B4
A10
B9
A15
B14
A20
B19
A25
B24
A30
B29
A35
B34
A40
B39
A45
B44
A50
B49
A55
B54
)
44
48.6
A19-B18
A24-B23
A29-B28
A34-B33
A39-B38
A44-B43
A49-B48
A54-B53
(
A19
B18
A24
B23
A29
B28
A34
B33
A39
B38
A44
B43
A49
B48
A54
B53
)
45
48.5
A29-B28
A34-B33
A39-B38
A44-B43
A49-B48
A54-B53
(
A29
B28
A34
B33
A39
B38
A44
B43
A49
B48
A54
B53
)
46
48.4
A9-B8
A14-B13
A19-B18
A24-B23
A29-B28
A34-B33
A39-B38
A44-B43
A49-B48
A54-B53
(
A9
B8
A14
B13
A19
B18
A24
B23
A29
B28
A34
B33
A39
B38
A44
B43
A49
B48
A54
B53
)
47
47.9
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
48
47.5
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
49
47.5
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
50
47.0
A43-B42
A48-B47
A53-B52
(
A43
B42
A48
B47
A53
B52
)
51
46.9
A17-B54
(
A17
B54
)
52
46.8
A7-B6
A12-B11
A17-B16
A22-B21
A27-B26
A32-B31
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A7
B6
A12
B11
A17
B16
A22
B21
A27
B26
A32
B31
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
53
46.7
A13-B26
(
A13
B26
)
54
46.3
A49-B50
A54-B55
(
A49
B50
A54
B55
)
55
46.3
A53-B54
(
A53
B54
)
56
46.3
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
57
46.2
A53-B52
(
A53
B52
)
58
46.2
A37-B36
A42-B41
A47-B46
A52-B51
A57-B56
(
A37
B36
A42
B41
A47
B46
A52
B51
A57
B56
)
59
45.7
A3-B2
A8-B7
A13-B12
A18-B17
A23-B22
A28-B27
A33-B32
A38-B37
A43-B42
A48-B47
A53-B52
(
A3
B2
A8
B7
A13
B12
A18
B17
A23
B22
A28
B27
A33
B32
A38
B37
A43
B42
A48
B47
A53
B52
)
60
45.6
A13-B12
A18-B17
A23-B22
A28-B27
A33-B32
A38-B37
A43-B42
A48-B47
A53-B52
(
A13
B12
A18
B17
A23
B22
A28
B27
A33
B32
A38
B37
A43
B42
A48
B47
A53
B52
)
61
45.5
A5-B6
A10-B11
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A5
B6
A10
B11
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
62
45.2
A35-B14
(
A35
B14
)
63
45.1
A33-B32
A38-B37
A43-B42
A48-B47
A53-B52
(
A33
B32
A38
B37
A43
B42
A48
B47
A53
B52
)
64
45.1
A23-B22
A28-B27
A33-B32
A38-B37
A43-B42
A48-B47
A53-B52
(
A23
B22
A28
B27
A33
B32
A38
B37
A43
B42
A48
B47
A53
B52
)
65
44.9
A17-B18
A22-B23
A27-B28
A32-B33
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A17
B18
A22
B23
A27
B28
A32
B33
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
66
44.9
A3-B4
A8-B9
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A3
B4
A8
B9
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
67
44.9
A9-B10
A14-B15
A19-B20
A24-B25
A29-B30
A34-B35
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A9
B10
A14
B15
A19
B20
A24
B25
A29
B30
A34
B35
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
68
44.8
A13-B14
A18-B19
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A13
B14
A18
B19
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
69
44.8
A15-B16
A20-B21
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A15
B16
A20
B21
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
70
44.7
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
71
44.7
A7-B8
A12-B13
A17-B18
A22-B23
A27-B28
A32-B33
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A7
B8
A12
B13
A17
B18
A22
B23
A27
B28
A32
B33
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
72
44.4
A25-B26
A30-B31
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A25
B26
A30
B31
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
73
44.1
A27-B28
A32-B33
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A27
B28
A32
B33
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
74
43.9
A55-B56
(
A55
B56
)
75
43.9
A19-B20
A24-B25
A29-B30
A34-B35
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A19
B20
A24
B25
A29
B30
A34
B35
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
76
43.9
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
77
43.9
A1-B2
A6-B7
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A1
B2
A6
B7
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
78
43.8
A53-B9
(
A53
B9
)
79
43.4
A35-B36
A40-B41
A45-B46
A50-B51
A55-B56
(
A35
B36
A40
B41
A45
B46
A50
B51
A55
B56
)
80
43.4
A23-B24
A28-B29
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A23
B24
A28
B29
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
81
43.1
A11-B12
A16-B17
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A11
B12
A16
B17
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
82
42.9
A33-B34
A38-B39
A43-B44
A48-B49
A53-B54
(
A33
B34
A38
B39
A43
B44
A48
B49
A53
B54
)
83
42.7
A29-B30
A34-B35
A39-B40
A44-B45
A49-B50
A54-B55
(
A29
B30
A34
B35
A39
B40
A44
B45
A49
B50
A54
B55
)
84
42.6
A51-B52
A56-B57
(
A51
B52
A56
B57
)
85
42.6
A45-B30
A53-B38
(
A45
B30
A53
B38
)
86
42.4
A45-B15
(
A45
B15
)
87
42.4
A21-B22
A26-B27
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A21
B22
A26
B27
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
88
41.5
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
89
40.6
A31-B32
A36-B37
A41-B42
A46-B47
A51-B52
A56-B57
(
A31
B32
A36
B37
A41
B42
A46
B47
A51
B52
A56
B57
)
90
40.6
A15-B52
(
A15
B52
)
91
40.5
A7-B37
A15-B45
(
A7
B37
A15
B45
)
92
40.2
A47-B48
A52-B53
(
A47
B48
A52
B53
)
93
40.1
A43-B10
A50-B17
(
A43
B10
A50
B17
)
94
40.0
A15-B12
(
A15
B12
)
95
40.0
A53-B38
(
A53
B38
)
96
40.0
A57-B46
(
A57
B46
)
97
38.7
A21-B15
(
A21
B15
)
98
38.7
A39-B17
(
A39
B17
)
99
38.2
A15-B45
(
A15
B45
)
100
38.2
A41-B46
A49-B54
(
A41
B46
A49
B54
)
101
37.8
A39-B9
A45-B15
(
A39
B9
A45
B15
)
102
37.8
A27-B14
A42-B29
(
A27
B14
A42
B29
)
103
37.5
A43-B13
(
A43
B13
)
104
37.5
A57-B53
(
A57
B53
)
105
37.3
A37-B4
A42-B9
A50-B17
(
A37
B4
A42
B9
A50
B17
)
106
36.7
A55-B18
(
A55
B18
)
107
36.6
A19-B8
A57-B46
(
A19
B8
A57
B46
)
108
36.5
A9-B14
A36-B41
A41-B46
A49-B54
(
A9
B14
A36
B41
A41
B46
A49
B54
)
109
36.4
A7-B19
(
A7
B19
)
110
36.4
A41-B11
(
A41
B11
)
111
36.2
A1-B26
A13-B38
(
A1
B26
A13
B38
)
112
35.3
A45-B21
(
A45
B21
)
113
35.3
A47-B43
A56-B52
(
A47
B43
A56
B52
)
114
35.3
A53-B57
(
A53
B57
)
115
35.1
A31-B45
(
A31
B45
)
116
35.0
A7-B41
A20-B54
(
A7
B41
A20
B54
)
117
35.0
A15-B56
(
A15
B56
)
118
34.7
A39-B22
A45-B28
(
A39
B22
A45
B28
)
119
34.5
A33-B11
A39-B17
(
A33
B11
A39
B17
)
120
34.4
A1-B22
(
A1
B22
)
121
34.4
A39-B20
(
A39
B20
)
122
34.4
A41-B3
(
A41
B3
)
123
34.4
A57-B31
(
A57
B31
)
124
34.3
A35-B41
A40-B46
(
A35
B41
A40
B46
)
125
34.3
A55-B6
(
A55
B6
)
126
34.2
A23-B37
A31-B45
(
A23
B37
A31
B45
)
127
33.8
A45-B12
A50-B17
(
A45
B12
A50
B17
)
128
33.7
A1-B35
A7-B41
A20-B54
(
A1
B35
A7
B41
A20
B54
)
129
33.7
A7-B38
A21-B52
(
A7
B38
A21
B52
)
130
33.3
A19-B29
A38-B48
(
A19
B29
A38
B48
)
131
33.3
A43-B47
A53-B57
(
A43
B47
A53
B57
)
132
33.3
A1-B39
(
A1
B39
)
133
33.3
A37-B45
(
A37
B45
)
134
32.6
A3-B14
A8-B19
A23-B34
A31-B42
A38-B49
A45-B56
(
A3
B14
A8
B19
A23
B34
A31
B42
A38
B49
A45
B56
)
135
32.4
A13-B38
(
A13
B38
)
136
32.4
A31-B57
(
A31
B57
)
137
32.4
A35-B30
(
A35
B30
)
138
32.4
A39-B49
(
A39
B49
)
139
32.4
A11-B48
A16-B53
(
A11
B48
A16
B53
)
140
32.3
A33-B41
(
A33
B41
)
141
32.3
A49-B54
(
A49
B54
)
142
32.2
A49-B45
A56-B52
(
A49
B45
A56
B52
)
143
31.8
A23-B34
A31-B42
A38-B49
A45-B56
(
A23
B34
A31
B42
A38
B49
A45
B56
)
144
31.5
A13-B37
A22-B46
(
A13
B37
A22
B46
)
145
31.5
A25-B51
A31-B57
(
A25
B51
A31
B57
)
146
31.4
A45-B48
(
A45
B48
)
147
31.4
A57-B2
(
A57
B2
)
148
31.4
A57-B22
(
A57
B22
)
149
31.4
A31-B42
A38-B49
A45-B56
(
A31
B42
A38
B49
A45
B56
)
150
31.3
A35-B1
A54-B20
(
A35
B1
A54
B20
)
151
31.2
A7-B54
(
A7
B54
)
152
31.2
A45-B28
(
A45
B28
)
153
31.2
A45-B56
(
A45
B56
)
154
31.2
A47-B29
(
A47
B29
)
155
31.2
A47-B39
(
A47
B39
)
156
31.2
A57-B18
(
A57
B18
)
157
30.9
A37-B20
A45-B28
(
A37
B20
A45
B28
)
158
30.9
A39-B21
A47-B29
(
A39
B21
A47
B29
)
159
30.8
A45-B31
(
A45
B31
)
160
30.8
A53-B10
(
A53
B10
)
161
30.6
A35-B23
(
A35
B23
)
162
30.6
A45-B22
(
A45
B22
)
163
30.3
A3-B20
(
A3
B20
)
164
30.3
A21-B52
(
A21
B52
)