A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =25, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
1 270.6 A1-B1 A6-B6 A11-B11 A16-B16 A22-B22 A37-B37 ( A1 B1 A6 B6 A11 B11 A16 B16 A22 B22 A37 B37 )
2 237.9 A3-B3 A8-B8 A13-B13 A18-B18 A37-B37 ( A3 B3 A8 B8 A13 B13 A18 B18 A37 B37 )
3 225.1 A5-B5 A10-B10 A15-B15 A22-B22 A37-B37 ( A5 B5 A10 B10 A15 B15 A22 B22 A37 B37 )
4 205.1 A7-B7 A12-B12 A17-B17 A22-B22 A37-B37 ( A7 B7 A12 B12 A17 B17 A22 B22 A37 B37 )
5 185.3 A3-B8 A8-B13 A14-B19 A19-B24 A26-B31 A35-B40 ( A3 B8 A8 B13 A14 B19 A19 B24 A26 B31 A35 B40 )
6 183.9 A5-B1 A16-B12 A22-B18 A28-B24 A33-B29 A38-B34 ( A5 B1 A16 B12 A22 B18 A28 B24 A33 B29 A38 B34 )
7 183 A1-B6 A8-B13 A14-B19 A19-B24 A26-B31 A35-B40 ( A1 B6 A8 B13 A14 B19 A19 B24 A26 B31 A35 B40 )
8 182.4 A1-B5 A6-B10 A11-B15 A17-B21 A22-B26 A32-B36 ( A1 B5 A6 B10 A11 B15 A17 B21 A22 B26 A32 B36 )
9 180.8 A1-B2 A6-B7 A11-B12 A16-B17 A21-B22 ( A1 B2 A6 B7 A11 B12 A16 B17 A21 B22 )
10 179.4 A3-B2 A8-B7 A13-B12 A18-B17 A23-B22 ( A3 B2 A8 B7 A13 B12 A18 B17 A23 B22 )
11 176 A9-B5 A16-B12 A22-B18 A28-B24 A33-B29 A38-B34 ( A9 B5 A16 B12 A22 B18 A28 B24 A33 B29 A38 B34 )
13 168 A3-B4 A8-B9 A13-B14 A18-B19 A24-B25 ( A3 B4 A8 B9 A13 B14 A18 B19 A24 B25 )
15 159.3 A13-B1 A18-B6 A25-B13 A35-B23 A52-B40 ( A13 B1 A18 B6 A25 B13 A35 B23 A52 B40 )
17 150 A1-B7 A10-B16 A18-B24 A23-B29 A34-B40 ( A1 B7 A10 B16 A18 B24 A23 B29 A34 B40 )
18 146.7 A5-B6 A10-B11 A15-B16 A21-B22 ( A5 B6 A10 B11 A15 B16 A21 B22 )
19 145.5 A3-B18 A9-B24 A14-B29 A20-B35 A25-B40 ( A3 B18 A9 B24 A14 B29 A20 B35 A25 B40 )
21 143.6 A29-B6 A34-B11 A39-B16 A44-B21 A54-B31 ( A29 B6 A34 B11 A39 B16 A44 B21 A54 B31 )
22 143.2 A7-B8 A12-B13 A17-B18 A24-B25 ( A7 B8 A12 B13 A17 B18 A24 B25 )
23 143.1 A23-B2 A30-B9 A39-B18 A47-B26 A52-B31 ( A23 B2 A30 B9 A39 B18 A47 B26 A52 B31 )
25 141.1 A25-B2 A30-B7 A35-B12 A44-B21 A54-B31 ( A25 B2 A30 B7 A35 B12 A44 B21 A54 B31 )
26 139.5 A27-B4 A33-B10 A39-B16 A44-B21 A54-B31 ( A27 B4 A33 B10 A39 B16 A44 B21 A54 B31 )
27 133.9 A7-B6 A12-B11 A17-B16 A23-B22 ( A7 B6 A12 B11 A17 B16 A23 B22 )
28 130.1 A1-B3 A6-B8 A12-B14 A19-B21 A33-B35 ( A1 B3 A6 B8 A12 B14 A19 B21 A33 B35 )
31 127.2 A19-B6 A25-B12 A42-B29 A52-B39 ( A19 B6 A25 B12 A42 B29 A52 B39 )
32 126.8 A21-B1 A40-B20 A46-B26 A51-B31 ( A21 B1 A40 B20 A46 B26 A51 B31 )
33 124 A23-B5 A31-B13 A48-B30 A53-B35 ( A23 B5 A31 B13 A48 B30 A53 B35 )
34 123.1 A25-B1 A30-B6 A36-B12 A52-B28 ( A25 B1 A30 B6 A36 B12 A52 B28 )
38 122.7 A15-B3 A22-B10 A35-B23 A52-B40 ( A15 B3 A22 B10 A35 B23 A52 B40 )
39 122.5 A21-B5 A32-B16 A37-B21 A47-B31 ( A21 B5 A32 B16 A37 B21 A47 B31 )
42 119.6 A19-B7 A25-B13 A35-B23 A52-B40 ( A19 B7 A25 B13 A35 B23 A52 B40 )
44 117.3 A27-B1 A38-B12 A43-B17 A53-B27 ( A27 B1 A38 B12 A43 B17 A53 B27 )
48 114.1 A17-B2 A22-B7 A30-B15 A36-B21 ( A17 B2 A22 B7 A30 B15 A36 B21 )
49 113.4 A17-B9 A23-B15 A39-B31 A47-B39 ( A17 B9 A23 B15 A39 B31 A47 B39 )
51 113 A21-B2 A39-B20 A46-B27 A51-B32 ( A21 B2 A39 B20 A46 B27 A51 B32 )
62 102.1 A5-B19 A15-B29 A21-B35 ( A5 B19 A15 B29 A21 B35 )
69 98 A21-B13 A39-B31 A47-B39 ( A21 B13 A39 B31 A47 B39 )
73 96.6 A43-B6 A48-B11 A53-B16 ( A43 B6 A48 B11 A53 B16 )
74 95.8 A37-B5 A48-B16 A53-B21 ( A37 B5 A48 B16 A53 B21 )
77 95.2 A41-B20 A47-B26 A52-B31 ( A41 B20 A47 B26 A52 B31 )
81 93.6 A3-B17 A15-B29 A21-B35 ( A3 B17 A15 B29 A21 B35 )
82 92.9 A37-B6 A49-B18 A54-B23 ( A37 B6 A49 B18 A54 B23 )
84 92.6 A23-B10 A42-B29 A52-B39 ( A23 B10 A42 B29 A52 B39 )
87 92.1 A39-B13 A44-B18 A53-B27 ( A39 B13 A44 B18 A53 B27 )
89 88.7 A39-B9 A44-B14 A51-B21 ( A39 B9 A44 B14 A51 B21 )
90 88.1 A5-B16 A13-B24 A24-B35 ( A5 B16 A13 B24 A24 B35 )
93 87.2 A1-B19 A17-B35 A22-B40 ( A1 B19 A17 B35 A22 B40 )
98 85.5 A33-B6 A39-B12 A44-B17 ( A33 B6 A39 B12 A44 B17 )
99 85 A21-B6 A30-B15 A36-B21 ( A21 B6 A30 B15 A36 B21 )
106 82.4 A31-B6 A38-B13 A51-B26 ( A31 B6 A38 B13 A51 B26 )
108 77.8 A23-B9 A29-B15 A52-B38 ( A23 B9 A29 B15 A52 B38 )
111 74.4 A31-B9 A38-B16 ( A31 B9 A38 B16 )
112 74.1 A5-B18 A16-B29 ( A5 B18 A16 B29 )
123 69.2 A33-B11 A38-B16 ( A33 B11 A38 B16 )
125 69.1 A41-B8 A48-B15 ( A41 B8 A48 B15 )
129 68.3 A43-B10 A48-B15 ( A43 B10 A48 B15 )
131 68.1 A35-B6 A41-B12 ( A35 B6 A41 B12 )
137 67.2 A7-B20 A16-B29 ( A7 B20 A16 B29 )
139 67 A39-B6 A48-B15 ( A39 B6 A48 B15 )
143 65.8 A3-B13 A25-B35 ( A3 B13 A25 B35 )
152 61.9 A9-B4 A23-B18 ( A9 B4 A23 B18 )
156 60.7 A3-B16 A16-B29 ( A3 B16 A16 B29 )
166 58.8 A33-B4 A41-B12 ( A33 B4 A41 B12 )
169 57.8 A43-B9 A49-B15 ( A43 B9 A49 B15 )
173 57 A39-B14 A51-B26 ( A39 B14 A51 B26 )
177 56.6 A35-B8 A44-B17 ( A35 B8 A44 B17 )
178 56.5 A35-B13 A40-B18 ( A35 B13 A40 B18 )
198 48.2 A35-B7 ( A35 B7 )
211 38.3 A5-B17 ( A5 B17 )
279 27.7 A3-B15 ( A3 B15 )
304 25.8 A37-B8 ( A37 B8 )