A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =25, length of fragment = 50, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
1 48.2 A35-B7 ( A35 B7 )
2 47.6 A3-B3 A8-B8 A13-B13 A18-B18 A37-B37 ( A3 B3 A8 B8 A13 B13 A18 B18 A37 B37 )
3 45.1 A1-B1 A6-B6 A11-B11 A16-B16 A22-B22 A37-B37 ( A1 B1 A6 B6 A11 B11 A16 B16 A22 B22 A37 B37 )
4 45.0 A5-B5 A10-B10 A15-B15 A22-B22 A37-B37 ( A5 B5 A10 B10 A15 B15 A22 B22 A37 B37 )
12 41.0 A7-B7 A12-B12 A17-B17 A22-B22 A37-B37 ( A7 B7 A12 B12 A17 B17 A22 B22 A37 B37 )
24 38.3 A5-B17 ( A5 B17 )
33 37.2 A31-B9 A38-B16 ( A31 B9 A38 B16 )
34 37.0 A5-B18 A16-B29 ( A5 B18 A16 B29 )
40 36.7 A5-B6 A10-B11 A15-B16 A21-B22 ( A5 B6 A10 B11 A15 B16 A21 B22 )
44 36.2 A1-B2 A6-B7 A11-B12 A16-B17 A21-B22 ( A1 B2 A6 B7 A11 B12 A16 B17 A21 B22 )
47 35.9 A3-B2 A8-B7 A13-B12 A18-B17 A23-B22 ( A3 B2 A8 B7 A13 B12 A18 B17 A23 B22 )
49 35.8 A7-B8 A12-B13 A17-B18 A24-B25 ( A7 B8 A12 B13 A17 B18 A24 B25 )
66 34.6 A33-B11 A38-B16 ( A33 B11 A38 B16 )
68 34.5 A41-B8 A48-B15 ( A41 B8 A48 B15 )
74 34.2 A43-B10 A48-B15 ( A43 B10 A48 B15 )
77 34.0 A35-B6 A41-B12 ( A35 B6 A41 B12 )
78 34.0 A5-B19 A15-B29 A21-B35 ( A5 B19 A15 B29 A21 B35 )
85 33.6 A3-B4 A8-B9 A13-B14 A18-B19 A24-B25 ( A3 B4 A8 B9 A13 B14 A18 B19 A24 B25 )
86 33.6 A7-B20 A16-B29 ( A7 B20 A16 B29 )
88 33.5 A39-B6 A48-B15 ( A39 B6 A48 B15 )
89 33.5 A7-B6 A12-B11 A17-B16 A23-B22 ( A7 B6 A12 B11 A17 B16 A23 B22 )
97 32.9 A3-B13 A25-B35 ( A3 B13 A25 B35 )
107 32.7 A21-B13 A39-B31 A47-B39 ( A21 B13 A39 B31 A47 B39 )
119 32.2 A43-B6 A48-B11 A53-B16 ( A43 B6 A48 B11 A53 B16 )
121 31.9 A37-B5 A48-B16 A53-B21 ( A37 B5 A48 B16 A53 B21 )
122 31.9 A13-B1 A18-B6 A25-B13 A35-B23 A52-B40 ( A13 B1 A18 B6 A25 B13 A35 B23 A52 B40 )
125 31.8 A19-B6 A25-B12 A42-B29 A52-B39 ( A19 B6 A25 B12 A42 B29 A52 B39 )
126 31.7 A41-B20 A47-B26 A52-B31 ( A41 B20 A47 B26 A52 B31 )
129 31.7 A21-B1 A40-B20 A46-B26 A51-B31 ( A21 B1 A40 B20 A46 B26 A51 B31 )
141 31.2 A3-B17 A15-B29 A21-B35 ( A3 B17 A15 B29 A21 B35 )
147 31.0 A23-B5 A31-B13 A48-B30 A53-B35 ( A23 B5 A31 B13 A48 B30 A53 B35 )
148 31.0 A37-B6 A49-B18 A54-B23 ( A37 B6 A49 B18 A54 B23 )
149 30.9 A9-B4 A23-B18 ( A9 B4 A23 B18 )
153 30.9 A3-B8 A8-B13 A14-B19 A19-B24 A26-B31 A35-B40 ( A3 B8 A8 B13 A14 B19 A19 B24 A26 B31 A35 B40 )
155 30.9 A23-B10 A42-B29 A52-B39 ( A23 B10 A42 B29 A52 B39 )
156 30.9 A25-B13 A35-B23 A52-B40 ( A25 B13 A35 B23 A52 B40 )
160 30.8 A25-B1 A30-B6 A36-B12 A52-B28 ( A25 B1 A30 B6 A36 B12 A52 B28 )
164 30.7 A25-B12 A42-B29 A52-B39 ( A25 B12 A42 B29 A52 B39 )
165 30.7 A39-B13 A44-B18 A53-B27 ( A39 B13 A44 B18 A53 B27 )
166 30.7 A15-B3 A22-B10 A35-B23 A52-B40 ( A15 B3 A22 B10 A35 B23 A52 B40 )
167 30.6 A5-B1 A16-B12 A22-B18 A28-B24 A33-B29 A38-B34 ( A5 B1 A16 B12 A22 B18 A28 B24 A33 B29 A38 B34 )
168 30.6 A21-B5 A32-B16 A37-B21 A47-B31 ( A21 B5 A32 B16 A37 B21 A47 B31 )
172 30.5 A1-B6 A8-B13 A14-B19 A19-B24 A26-B31 A35-B40 ( A1 B6 A8 B13 A14 B19 A19 B24 A26 B31 A35 B40 )
174 30.4 A1-B5 A6-B10 A11-B15 A17-B21 A22-B26 A32-B36 ( A1 B5 A6 B10 A11 B15 A17 B21 A22 B26 A32 B36 )
175 30.3 A3-B16 A16-B29 ( A3 B16 A16 B29 )
184 30.0 A1-B7 A10-B16 A18-B24 A23-B29 A34-B40 ( A1 B7 A10 B16 A18 B24 A23 B29 A34 B40 )
187 29.9 A19-B7 A25-B13 A35-B23 A52-B40 ( A19 B7 A25 B13 A35 B23 A52 B40 )
193 29.6 A39-B9 A44-B14 A51-B21 ( A39 B9 A44 B14 A51 B21 )
195 29.4 A33-B4 A41-B12 ( A33 B4 A41 B12 )
196 29.4 A5-B16 A13-B24 A24-B35 ( A5 B16 A13 B24 A24 B35 )
198 29.3 A9-B5 A16-B12 A22-B18 A28-B24 A33-B29 A38-B34 ( A9 B5 A16 B12 A22 B18 A28 B24 A33 B29 A38 B34 )
199 29.3 A27-B1 A38-B12 A43-B17 A53-B27 ( A27 B1 A38 B12 A43 B17 A53 B27 )
205 29.1 A3-B18 A9-B24 A14-B29 A20-B35 A25-B40 ( A3 B18 A9 B24 A14 B29 A20 B35 A25 B40 )
206 29.1 A41-B12 ( A41 B12 )
207 29.1 A1-B19 A17-B35 A22-B40 ( A1 B19 A17 B35 A22 B40 )
208 29.1 A23-B15 A39-B31 A47-B39 ( A23 B15 A39 B31 A47 B39 )
212 28.9 A43-B9 A49-B15 ( A43 B9 A49 B15 )
217 28.7 A29-B6 A34-B11 A39-B16 A44-B21 A54-B31 ( A29 B6 A34 B11 A39 B16 A44 B21 A54 B31 )
220 28.6 A23-B2 A30-B9 A39-B18 A47-B26 A52-B31 ( A23 B2 A30 B9 A39 B18 A47 B26 A52 B31 )
222 28.6 A23-B18 ( A23 B18 )
227 28.6 A39-B16 A44-B21 A54-B31 ( A39 B16 A44 B21 A54 B31 )
228 28.5 A17-B2 A22-B7 A30-B15 A36-B21 ( A17 B2 A22 B7 A30 B15 A36 B21 )
229 28.5 A33-B6 A39-B12 A44-B17 ( A33 B6 A39 B12 A44 B17 )
230 28.5 A39-B14 A51-B26 ( A39 B14 A51 B26 )
234 28.4 A17-B9 A23-B15 A39-B31 A47-B39 ( A17 B9 A23 B15 A39 B31 A47 B39 )
237 28.3 A21-B6 A30-B15 A36-B21 ( A21 B6 A30 B15 A36 B21 )
240 28.3 A35-B8 A44-B17 ( A35 B8 A44 B17 )
241 28.3 A39-B18 A47-B26 A52-B31 ( A39 B18 A47 B26 A52 B31 )
242 28.2 A21-B2 A39-B20 A46-B27 A51-B32 ( A21 B2 A39 B20 A46 B27 A51 B32 )
243 28.2 A35-B13 A40-B18 ( A35 B13 A40 B18 )
244 28.2 A25-B2 A30-B7 A35-B12 A44-B21 A54-B31 ( A25 B2 A30 B7 A35 B12 A44 B21 A54 B31 )
251 28.0 A33-B10 A39-B16 A44-B21 A54-B31 ( A33 B10 A39 B16 A44 B21 A54 B31 )
252 28.0 A35-B12 A44-B21 A54-B31 ( A35 B12 A44 B21 A54 B31 )
253 27.9 A27-B4 A33-B10 A39-B16 A44-B21 A54-B31 ( A27 B4 A33 B10 A39 B16 A44 B21 A54 B31 )
255 27.8 A39-B20 A46-B27 A51-B32 ( A39 B20 A46 B27 A51 B32 )
258 27.7 A3-B15 ( A3 B15 )
269 27.5 A31-B6 A38-B13 A51-B26 ( A31 B6 A38 B13 A51 B26 )
287 26.6 A39-B12 A44-B17 ( A39 B12 A44 B17 )
297 26.2 A43-B17 A53-B27 ( A43 B17 A53 B27 )
301 26.0 A1-B3 A6-B8 A12-B14 A19-B21 A33-B35 ( A1 B3 A6 B8 A12 B14 A19 B21 A33 B35 )
302 25.9 A23-B9 A29-B15 A52-B38 ( A23 B9 A29 B15 A52 B38 )
304 25.8 A37-B8 ( A37 B8 )