A=Mouse.Q8VCY6, B=Saccharomyces.Q02354, Threshold for similarity =25, length of fragment = 30, sorted based on average %similarity , Multiply index with 10 to get sequence starting position in original sequence
Sl no. Average Score Fragment alignment Fasta links
2 207.6 A3-B3 A9-B9 A14-B14 A19-B19 A34-B34 ( A3 B3 A9 B9 A14 B14 A19 B19 A34 B34 )
3 177 A5-B5 A10-B10 A15-B15 A34-B34 ( A5 B5 A10 B10 A15 B15 A34 B34 )
4 159.1 A7-B7 A12-B12 A17-B17 A34-B34 ( A7 B7 A12 B12 A17 B17 A34 B34 )
6 149.4 A3-B2 A10-B9 A17-B16 A24-B23 A31-B30 ( A3 B2 A10 B9 A17 B16 A24 B23 A31 B30 )
7 149.4 A5-B4 A10-B9 A17-B16 A24-B23 A31-B30 ( A5 B4 A10 B9 A17 B16 A24 B23 A31 B30 )
8 130.7 A31-B9 A38-B16 A46-B24 A54-B32 ( A31 B9 A38 B16 A46 B24 A54 B32 )
9 125.8 A1-B7 A14-B20 A23-B29 A32-B38 ( A1 B7 A14 B20 A23 B29 A32 B38 )
11 114.6 A15-B3 A26-B14 A41-B29 A52-B40 ( A15 B3 A26 B14 A41 B29 A52 B40 )
12 114.5 A29-B3 A38-B12 A46-B20 A55-B29 ( A29 B3 A38 B12 A46 B20 A55 B29 )
15 104.1 A7-B12 A20-B25 A33-B38 ( A7 B12 A20 B25 A33 B38 )
17 97.3 A1-B8 A10-B17 A24-B31 ( A1 B8 A10 B17 A24 B31 )
18 95.6 A39-B13 A46-B20 A55-B29 ( A39 B13 A46 B20 A55 B29 )
21 92.4 A37-B16 A45-B24 A54-B33 ( A37 B16 A45 B24 A54 B33 )
22 91.9 A45-B12 A50-B17 ( A45 B12 A50 B17 )
23 91 A9-B13 A14-B18 A21-B25 ( A9 B13 A14 B18 A21 B25 )
24 90.8 A19-B10 A27-B18 A50-B41 ( A19 B10 A27 B18 A50 B41 )
25 89.3 A35-B12 A40-B17 A46-B23 ( A35 B12 A40 B17 A46 B23 )
26 89 A1-B2 A9-B10 A14-B15 ( A1 B2 A9 B10 A14 B15 )
27 89 A3-B4 A9-B10 A14-B15 ( A3 B4 A9 B10 A14 B15 )
32 83 A41-B20 A54-B33 ( A41 B20 A54 B33 )
43 66.1 A35-B7 A53-B25 ( A35 B7 A53 B25 )
48 64.2 A27-B14 A52-B39 ( A27 B14 A52 B39 )
51 63.5 A51-B5 A57-B11 ( A51 B5 A57 B11 )
52 61.9 A41-B18 A46-B23 ( A41 B18 A46 B23 )
53 61.7 A27-B20 A46-B39 ( A27 B20 A46 B39 )
58 60 A37-B8 A44-B15 ( A37 B8 A44 B15 )
62 58.6 A35-B11 A54-B30 ( A35 B11 A54 B30 )
64 57.6 A45-B15 A57-B27 ( A45 B15 A57 B27 )
69 57.2 A37-B9 A53-B25 ( A37 B9 A53 B25 )
71 56.8 A35-B6 A44-B15 ( A35 B6 A44 B15 )
75 55.4 A7-B19 A23-B35 ( A7 B19 A23 B35 )
77 53.1 A41-B14 A47-B20 ( A41 B14 A47 B20 )
78 52.9 A3-B14 A13-B24 ( A3 B14 A13 B24 )
81 41.9 A7-B20 ( A7 B20 )
82 40.6 A5-B18 ( A5 B18 )